[發明專利]GⅠ型諾如病毒的環介導等溫擴增檢測引物組、檢測方法和試劑盒有效
| 申請號: | 201310690315.9 | 申請日: | 2013-12-16 |
| 公開(公告)號: | CN103642943A | 公開(公告)日: | 2014-03-19 |
| 發明(設計)人: | 寇曉霞;吳清平;薛亮;張菊梅 | 申請(專利權)人: | 廣東省微生物研究所;廣東環凱微生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001 | 代理人: | 劉明星 |
| 地址: | 510070 *** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 型諾如 病毒 環介導 等溫 擴增 檢測 引物 方法 試劑盒 | ||
1.一種應用環介導等溫擴增檢測GⅠ型諾如病毒的檢測引物組,其特征在于,由下列引物組成:
上游外引物F3:5’-AGCATGGGACTCAACACA-3’;
下游外引物B3:5’-ATGGGAATCCAGATGGCA-3’;
上游內引物FIP:5’-CAATTCTGGTGAGGCCGTAAG-TAGACAAATTATGACAGAATCCTTC-3’;
下游內引物BIP:5’-CGAGGTTGTGGCCCAAGATT-CCTCTTTGACCCTGATGAC-3’。
2.一種非疾病的診斷和治療目的的GⅠ型諾如病毒的檢測方法,其特征在于,對樣品進行病毒RNA提取,再反轉錄成cDNA,然后通過環介導等溫擴增的方法用權利要求1所述的檢測引物組對cDNA進行選擇性擴增,確認是否存在有擴增產物。
3.根據權利要求2所述的檢測方法,其特征在于,所述的樣品為醫院的腹瀉樣品,水或食品。
4.根據權利要求2所述的檢測方法,其特征在于,所述的通過環介導等溫擴增的方法用權利要求1所述的檢測引物組對cDNA進行選擇性擴增具體為:環介導等溫擴增體系為:體系總體積20-100μL,包括10×Thermopol反應緩沖液、10mmol/LdNTPs、10μmol/L上游外引物F3、10μmol/L下游外引物B3、40μmol/L上游內引物FIP、40μmol/L下游內引物BIP、100mmol/L?MgSO4、2mol/L甜菜堿、1-5μL8U/μL?Bst?DNA聚合酶和1-5μL?c?DNA,加滅菌雙蒸水ddH2O至反應總體積,反應條件為在溫度為63℃孵育40-70min。
5.根據權利要求2、3或4所述的檢測方法,其特征在于,所述的確認是否存在有擴增產物是在終止反應的反應管中加入1μL10%SYBR?GreenⅠ顯色劑,10min后觀察結果,如果顏色為黃色,則樣品GⅠ型諾如病毒陰性,無GⅠ型諾如病毒,如果顏色為綠色,則樣品GⅠ型諾如病毒陽性,含有GⅠ型諾如病毒。
6.一種GⅠ型諾如病毒的檢測試劑盒,包括RNA提取試劑,RNA反轉錄試劑,環介導等溫擴增試劑和檢測引物組,其特征在于,所述的檢測引物組由下列引物組成:
上游外引物F3:5’-AGCATGGGACTCAACACA-3’;
下游外引物B3:5’-ATGGGAATCCAGATGGCA-3’;
上游內引物FIP:5’-CAATTCTGGTGAGGCCGTAAG-TAGACAAATTATGACAGAATCCTTC-3’;
下游內引物BIP:5’-CGAGGTTGTGGCCCAAGATT-CCTCTTTGACCCTGATGAC-3’。
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