[發明專利]過氧化氫酶基因標簽單核苷酸多態性位點的挑選、檢測及其應用

有效

• 申請號: 201310661025.1
• 申請日: 2013-12-09
• 公開（公告）號: CN103642921A
• 公開（公告）日: 2014-03-19
• 發明（設計）人: 段朝霞;楊俊慧;張潔元;康建毅;陳魁君;李曉霞;陳繼川;王建民;李兵倉
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍第三軍醫大學第三附屬醫院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 重慶志合專利事務所 50210
• 代理人: 胡榮琿

技術領域

本發明設計涉及一種過氧化氫酶基因（catalase，CAT）基因標簽單核苷酸多態性（Tag?Single?Nucleotide?Polymorphism，tSNP）位點的挑選、檢測及其應用。本發明還涉及由CAT基因標簽單核苷酸多態性位點組成的單體型及其檢測方法和應用。?

背景技術

耳聾一直是困擾人類的常見疾病，給社會和家庭帶來了許多煩惱，消耗了大量的人力和物力。據世界衛生組織估計，全世界有2.5億人患有中度以上聽力喪失。2006年第二次全國殘疾人抽樣調查推算，全國各類殘疾人總數為8296萬人，其中聽力殘疾2004萬，占各種殘疾的首位。噪聲性耳聾又稱噪聲性聽力損失，是指一次高強度脈沖噪聲瞬時暴露或長期接觸噪聲刺激引起的緩慢的、進行性感音神經性聾，損傷部位主要在內耳。前者又稱為急性聲損傷，后者稱為慢性聲損傷。噪聲污染已被認為是世界性七大公害之首。噪聲性耳聾是工業、建筑業、軍事、交通和娛樂業等最常見的職業性傷害和聽力致殘因素。噪聲性聾的發病率僅次于老年性聾,約占臨床聽力損傷的三分之一,并有逐年上升的趨勢。可見，噪聲性耳聾對人類健康和社會經濟發展已構成巨大威脅。因此，如何降低噪聲性聾的發病率已成為當今聽力學家和職業病防治工作者面臨的一項非常重要的課題。?

噪音性耳聾的發生具有明顯的遺傳傾向，同時又受到環境因素的密切影響，因此是典型的多因子疾病。從基礎到臨床，人們對噪音性耳聾進行了大量的研究，并在噪音性耳聾的危險因素和噪音性耳聾發生的病理生理方面積累了大量的知識，但對于噪音性耳聾發生的遺傳因素的研究仍未取得重大突破。而從遺?傳學角度來解釋、預防、和/或診斷噪音性耳聾是目前需要解決的首要問題。?

CAT與超氧化物歧化酶（superoxide?dismutase，SOD)和谷胱甘肽過氧化酶（glutathione?peroxidase，GSHPx)一起構成了機體主要的抗氧化防御體系。CAT以其自身的結構和功能以較低濃度有效地降解毒性H₂O₂。在機體CAT活性降低或喪失時，此酶導致的組織損傷不僅通過H₂O₂和其衍生物、而且間接通過抑制SOD而增加超氧陰離子。如果CAT發生突變，則可能降低氧自由基的清除效果，繼而導致個體對噪聲耐受力下降、NIHL易感性升高,因此，它可能是NIHL易感性的重要候選基因。但目前為止，有關CAT基因多態性與NIHL的相關研究很少，主要集中在啟動子區-262C/T上，并且都沒有檢測到有意義的主效應；而389C>T多態位點近幾年研究也比較多，但國內外報道比較多的是它與白癜風、系統性紅斑狼瘡等之間的相關性，尚未見報道其與NIHL的相關性研究，以及這些變異在預測預報和新藥開發中的應用的相關報道。?

單核苷酸多態性(Single?Nucleotide?polymorphism，SNP)是DNA序列的變體，當基因組序列中單個核苷酸（T,T,C或G）發生改變時就會出現SNP。SNP是決定人體對各種應激打擊易感性與耐受性、臨床表現多樣性及藥物治療反應差異性的重要因素。在本發明中SNP命名原則如下：以轉錄起始位點的第一個核苷酸定義為+1，5’上游方向核苷酸依次定義為：-1、-2...，3’下游方向核苷酸依次定義為+2、+3...。單核苷酸多態位于編碼區，則以核苷酸相應變化和該核苷酸在核苷酸序列中的位置定義此多態性；若位于編碼區，則以核苷酸相應變化和該核苷酸在核苷酸序列中的位置定義此多態性或以該核苷酸編碼的氨基酸序列相應變化和該氨基酸在氨基酸序列中的位置定義此多態。?

發明內容

針對上述問題，本發明的目的是提供一種挑選CAT基因的標簽單核苷酸多態性位點；提供一種CAT基因的標簽單核苷酸多態性位點組成的CAT基因保護性單體型；提供一種CAT基因的標簽單核苷酸多態性位點組成的CAT基因危險性單體型；提供一種檢測本發明的CAT基因的標簽單核苷酸多態性位點的方法；提供一種檢測CAT基因的保護性單體型或危險性單體型的方法；提供一種體外檢測噪音性耳聾相關基因的方法；提供一種體外檢測待測樣品中是否含有CAT?基因保護性單體型或危險性單體型的方法；提供一種體外預測待測個體患噪音性耳聾危險性的方法；提供一種檢測CAT基因的標簽單核苷酸多態性位點的試劑盒。?