[發(fā)明專利]一種野生奧德蘑種類的鑒定方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310654406.7 | 申請日: | 2013-12-05 |
| 公開(公告)號: | CN103667478A | 公開(公告)日: | 2014-03-26 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 李傳華;黃建春;譚琦;尚曉冬;張勁松;鮑大鵬 | 申請(專利權(quán))人: | 上海市農(nóng)業(yè)科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海泰能知識產(chǎn)權(quán)代理事務所 31233 | 代理人: | 黃志達 |
| 地址: | 201106 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 野生 奧德蘑 種類 鑒定 方法 | ||
1.一種野生奧德蘑鑒定方法,包括下列步驟:
(1)野外采集
先對從野外采集的野生奧德蘑子實體進行拍照,拍攝清楚菌蓋、菌柄、菌環(huán)和菌褶以及子實體周圍的生境;照片拍攝后采集奧德蘑野生子實體,測量并記錄其外部形態(tài)特征,并進行菌種分離;
(2)外部形態(tài)鑒定
將步驟(1)采集到的野生奧德蘑子實體的外部形態(tài)特征和現(xiàn)有的奧德蘑子實體的外部形態(tài)特征進行比對,找出相似種類;
(3)微觀結(jié)構(gòu)鑒定
將步驟(1)得到的奧德蘑野生子實體進行顯微結(jié)構(gòu)觀察,然后將野生奧德蘑與步驟(2)得到的相似種類的奧德蘑的顯微結(jié)構(gòu)進行比對,找到顯微結(jié)構(gòu)相似的種類;
(4)分子序列鑒定
1)DNA提取:提取總DNA,測定濃度后調(diào)節(jié)至100ng/μL備用;
2)PCR擴增:選用真菌通用引物ITS1和ITS4擴增奧德蘑核糖體RNA部分18S、ITS1、5.8S、ITS2和部分28S的DNA片段;反應體系總量20μL,包含有Taq酶5U、Mg2+?1.5mmol/L、dNTP各200μmol/L、引物各1.0×10-5μmol、模版DNA100ng;PCR反應程序94℃預變性5min,30個循環(huán)中94℃?50s、51℃?50s、72℃?1min,最后72℃延伸10min;
3)PCR測序:經(jīng)ITS擴增片段進行雙向測序,測序結(jié)果經(jīng)過比對拼接后確定最終序列;
4)ITS序列分析:將測序好的序列在Genebank中進行Blast比對;
(5)綜合鑒定:綜合外部形態(tài)特征、微觀結(jié)構(gòu)和分子序列比對的種類,綜合比較,準確確定野生奧德蘑的種類。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種野生奧德蘑鑒定方法,其特征在于:將步驟(1)中所采集到的奧德蘑野生子實體放入固定的器具中以免損壞。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種野生奧德蘑鑒定方法,其特征在于:步驟(1)中所示的測量并記錄其外部形態(tài)特征包括:測量菌蓋直徑、菌柄長度和直徑,與比色卡進行比對并記錄菌蓋、菌柄、菌褶顏色及形狀,記錄其味道和氣味。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種野生奧德蘑鑒定方法,其特征在于:步驟(3)中所述的顯微結(jié)構(gòu)觀察的具體操作為:選取步驟(1)得到的奧德蘑野生子實體的菌褶少許,放入事先配置好的滴定有5%KOH溶液的載玻片上,待菌褶充分溶解還原后,蓋上蓋玻片,置于放大400倍的顯微鏡下觀察,觀察孢子、擔子、囊狀體、菌絲等顯微結(jié)構(gòu)的特征,并測量其大小,同時進行顯微照片拍攝。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種野生奧德蘑鑒定方法,其特征在于:步驟(4)中所述的提取總DNA的方法為采用改良的CTAB法提取總DNA,包括:
1)將-20℃冷凍干燥的野生奧德蘑子實體0.1g研磨成粉末,加入65℃預熱的2×CTAB抽提液,65℃保溫45min以上,間或輕搖混勻;
2)12000rpm,4℃離心20min,取上清液;
3)加入等體積的酚、氯仿和異戊醇的混合液,其中酚、氯仿和異戊醇的體積比為25:24:1,輕輕混勻10min,12000rpm,4℃離心10min,取上清液移入新離心管中;
4)加入等體積的氯仿、異戊醇混合液,其中的氯仿、異戊醇的體積比為24:1,輕輕混勻10min,12000rpm,4℃離心10min,取上清液移入新離心管中;
5)加入2/3體積的-20℃預冷的異丙醇,輕輕搖動5min,8000rpm,4℃離心10min,去上清;
6)將沉淀依次用體積百分數(shù)為75%的乙醇、10mmol/L醋酸鉀各洗滌2~3次,每次8000rpm,室溫離心5min;
7)加入預冷的體積百分數(shù)為95%的乙醇,輕輕上下顛倒,8000rpm室溫離心10min,棄乙醇,真空抽干或自然晾干;
8)加入100uL?10×TE緩沖液,輕輕敲打使沉淀溶解;
9)加入1uL?10mg/mL?RNaseA?37℃水浴,1hr,去除RNA,即得DNA提取物。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的一種野生奧德蘑鑒定方法,其特征在于:步驟(4)中所述的真菌通用引物ITS1為:5’-TCC?GTA?GGT?GAA?CCT?GCG?G-3’,ITS4為5’-TCC?TCC?GCT?TAT?TGA?TAT?GC-3’。
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