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[發(fā)明專利]水仙BES-SSR標(biāo)記引物GA19及鑒定水仙品種的方法有效

專利信息
申請(qǐng)?zhí)枺?/td> 201310562208.8 申請(qǐng)日: 2013-11-13
公開(公告)號(hào): CN103555855A 公開(公告)日: 2014-02-05
發(fā)明(設(shè)計(jì))人: 潘東明;祁世明;潘騰飛;郭志雄;林琳 申請(qǐng)(專利權(quán))人: 福建農(nóng)林大學(xué)
主分類號(hào): C12Q1/68 分類號(hào): C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 福州元?jiǎng)?chuàng)專利商標(biāo)代理有限公司 35100 代理人: 蔡學(xué)俊
地址: 350002 福*** 國(guó)省代碼: 福建;35
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摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 水仙 bes ssr 標(biāo)記 引物 ga19 鑒定 品種 方法
【權(quán)利要求書】:

1.一種水仙BES-SSR標(biāo)記引物GA19,由上游引物GA19F和下游引物GA19R組成,其特征在于核苷酸序列如下:

GA19?F:?5'-GAGAAGAATGGGAAATGAATG-3'

GA19?R:?5'-TCCTTTGGAGTTGTTGGTG-3'。

2.利用如權(quán)利要求1所述的水仙BES-SSR標(biāo)記引物GA19鑒定水仙品種的方法,包括水仙基因組總DNA提取、PCR總反應(yīng)體系建立、PCR擴(kuò)增程序、聚丙烯酰胺凝膠電泳條件和PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)鑒定,其特征在于:

(1)水仙基因組總DNA提取:利用改良的CTAB法提取水仙基因組總DNA;

(2)PCR總反應(yīng)體系建立:總反應(yīng)體系20ul:供鑒定的水仙基因組總DNA?50ng,10×PCR?Buffer?2ul,10mmol/L?dNTPs?0.5ul,10mmol/L水仙GA19上下游引物各1.0ul,5U/L?Taq?DNA聚合酶?0.2ul,無(wú)菌ddH2O?12.8ul;所述供鑒定的水仙,本發(fā)明共提供24份水仙品種樣品;

(3)PCR擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性4min,94℃變性30s,52℃退火30s,72℃?延伸45s,共35個(gè)循環(huán),72℃延伸10min,4℃保存;

(4)聚丙烯酰胺凝膠電泳條件:1×TBE電泳緩沖液,體積比為8%的聚丙烯酰胺凝膠,在電壓400V,電流100mA下電泳3.0h后用銀染法染色,經(jīng)ImageScanner?Ⅲ凝膠掃描儀掃描保存;

(5)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)鑒定:利用水仙BES-SSR標(biāo)記引物GA19,對(duì)24份水仙的樣品進(jìn)行品種鑒定,于聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)的PCR擴(kuò)增圖譜中,在分子量為259bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為中國(guó)多花水仙金盞銀臺(tái);在分子量為199bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為中國(guó)多花水仙重瓣玉玲瓏;在分子量為215bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋重瓣水仙Replete;在分子量為343bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋小冠水仙Alltruist;在分子量為260bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋多花水仙Jetfire;在分子量為285bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋重瓣水仙Tahiti;在分子量為256bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋裂冠水仙Orangerie;在分子量為384bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋重瓣水仙Yellow?Cheerfulness;在分子量為240bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋紅口水仙Recurvus;在分子量為372bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋多花水仙Erlicheer;在分子量為313bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋三蕊水仙Thalia;在分子量為412bp?的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋喇叭水仙Mount?Hood;在分子量為315bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋多花水仙White?Favourite;在分子量為447bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋長(zhǎng)壽花水仙Silver?Smiles;在分子量為343bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋大冠水仙Pink?Charm;在分子量為158bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋大冠水仙Johann?Strauss;在分子量為276bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋小冠水仙Barret?Browning;在分子量為215bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋喇叭水仙Dutch?Master;在分子量為272bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋大冠水仙Fortissimo;在分子量為438bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋大冠水仙Daydream;在分子量為250bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋重瓣水仙Gay?Tabor;在分子量為240bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋仙客來(lái)水仙Tete-a-Tete;在分子量為349bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋大冠水仙Bella?Vista;在分子量為153bp的位置出現(xiàn)DNA條帶,則該品種為西洋大冠水仙Carlton。

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