[發明專利]運用比較基因組學快速鑒定草莓白粉病基因在審
| 申請號: | 201310541421.0 | 申請日: | 2013-11-04 |
| 公開(公告)號: | CN104611407A | 公開(公告)日: | 2015-05-13 |
| 發明(設計)人: | 錢孝英;俞錁;劉云飛;錢春桃 | 申請(專利權)人: | 常熟市董浜鎮北港蔬菜專業合作社 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;G06F19/24;C12N15/29;C07K14/415 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 215535*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 運用 比較 基因組 快速 鑒定 草莓 白粉病 基因 | ||
1.草莓抗白粉病基因,其特征在于選自下列3個基因或其之一:
gene09623-vl.0-ab_initio
氨基酸序列:
MAAAGKERSLEQTPTWAVAVVCFILVLVSIIIEYILHLIGKWLERKNKRALYEALEKIKAELMLLGFLSLLLTVGQGPISDICISKSVGATWHPCSKKQEPVYAKEDGESTSSESDDDSGRRRLLSVVLSSSGKNARRVLAAAGYDKCGAKGKVPFVSFYGIHQLHILIFVLAVSHVLYCIITLVLGRAKMRKWKTWELETRTADYQFSHDPERFRFARDTSFGRRHLSFWSRSPILLWIVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRNGFIFAHLAPQSQTKFDFQKYINRSVEEDFKVVVGISPVIWLFAVLFLLSNTHGSWSYLYLPFIPLVMILLVGTKLQVIITKMGLKIQERGEVVKGTPLVEPGDHLFWFNSPRLILHIIHFVLFQNAFQLAFFAWTWYEFGLKSCFHDKMEDVVLRITMGVVIQILCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNDRVANAIRKWHHAAKKHVKQSKHSVPTSAPGTPLHGMSPVHLLRHYHSELDMDSMQTLPRMSYAEREGPNESPSHHDTDDVPWSNQGQEEEISAHYQPNSVNNPPPGYGNQIQHEIQIHTKD
核苷酸序列:
ATGGCAGCAGCTGGAAAGGAACGATCTTTGGAGCAAACGCCGACGTGGGCCGTTGCCGTTGTTTGTTTCATATTGGTTTTGGTCTCCATCATCATCGAATATATCCTTCATTTGATCGGAAAGTGGTTGGAAAGGAAGAATAAAACGAGCTCTCTATGAAGCACTGGAAAAGATCAAAGCAGAGCTTATGTTATTGGGGTTCCTCTCGCTGCTGCTAACAGTAGGACAAGGCCCCATTTCGGACATTTGCATATCGAAGTCTGTTGGGGCTACTTGGCATCCATGTAGTAAGAAGCAAGAGCCAGTCTATGCAAAGGAGGACGGAGAGAGCACTAGTTCAGAATCCGATGATGACAGCGGCCGTAGAAGGCTACTATCCGTGGTTCTATCGAGTTCCGGCAAGAATGCCCGACGTGTTTTGGCCGCAGCCGGATATGACAAATGCGGTGCCAAGGGAAAAGTTCCATTTGTGTCATTTTATGGAATTCACCAGCTTCATATACTCATCTTCGTGCTAGCCGTATCCCATGTGCTTTACTGCATAATAACACTGGTTTTGGGCAGAGCTAAGATGAGGAAGTGGAAAACATGGGAATTGGAAACCAGGACAGCAGACTACCAGTTCTCACATGACCCTGAAAGATTCCGATTTGCGAGAGACACATCGTTTGGGCGAAGGCACTTGAGCTTTTGGAGCCGGTCACCCATTTTGTTATGGATTGTTTGCTTCTTCAGACAGTTTGTTAGATCAGTGCCTAAGGTGGATTACCTGACGCTACGCAATGGGTTCATCTTTGCACATTTGGCACCTCAGAGTCAAACTAAATTTGATTTCCAGAAGTACATCAACAGATCAGTCGAAGAGGACTTCAAGGTTGTGGTGGGGATCAGCCCTGTTATCTGGTTATTCGCCGTATTGTTCCTGCTATCTAACACCCATGGCTCATGGTCCTATCTCTATCTACCTTTTATTCCCCTAGTGATGATCTTGTTAGTAGGGACAAAGCTACAGGTTATAATAACCAAGATGGGGCTTAAAATTCAAGAAAGAGGAGAAGTAGTTAAGGGTACCCCGCTTGTTGAGCCTGGTGACCATCTCTTCTGGTTCAACAGCCCTCGTCTCATTCTTCACATCATCCATTTTGTTCTCTTTCAGAATGCCTTTCAACTTGCTTTCTTTGCATGGACTTGGTACGAATTTGGGTTGAAGTCTTGCTTTCACGACAAGATGGAAGATGTGGTCTTAAGAATTACAATGGGGGTCGTCATACAAATACTATGCAGCTATGTAACTCTACCACTTTATGCCTTAGTTACACAGATGGGTTCAACTATGAAGCCTACGATATTTAACGACAGAGTAGCAAATGCTATAAGAAAGTGGCACCACGCAGCAAAGAAGCATGTAAAACAGAGCAAGCATTCGGTTCCAACCAGTGCACCCGGCACTCCATTACATGGCATGTCCCCGGTTCATCTTCTGCGGCACTATCATTCCGAACTGGACATGGATAGTATGCAAACATTGCCAAGGATGTCATACGCTGAAAGAGAAGGTCCAAACGAGTCCCCATCTCACCACGACACCGACGATGTACCCTGGTCTAACCAGGGTCAGGAGGAAGAGATTAGTGCTCACTATCAACCTAACTCGGTGAACAATCCTCCACCTGGTTATGGAAACCAAATTCAACACGAAATCCAAATTCACACAAAGGATTAG
gene02764-vl.0-ab_initio
氨基酸序列:
MAASTSGRSLEQTPTWAVAVVCFVLVLISIIIEHILELIGKWLKNKHKRALFEALEKVKSELMLLGFISLLLTVGQGPISNICISEKVGNTWHPCSKKQEVKIEEEEEVESPSRRLLAAFESGYGGGNVRRVLAAAGTDKCAAKGKVPFISADGIHQLHIFIFVLAIFHVLYCILTMALGRAKVCFFRQFVRSVPKVDYLTLRHGFIMAHLAPQSHQQFNFQKYINRSLEEDFKVVVGISPPIWCFAVIFLLFNTHGWYSYLWLPFIPLIIILLVGTKLQVIITKMGLRIQERGEVVKGTPVVQPGDDLFWFNRPRLILYLINFVLFQNAFQLAFFAWSWYEFSLKSCFHEHIEDIIIRVSMGVLIQILCSYVTLPLYALVTQMGSTMKPTIFNERVATALRKWHHTAKKHIKQNKGSVTPMSSRPGTPSHHASPIHLLRHYRSEVDSFHTSPRRSNFDVEQRYETDSPSPSHHLHIDGSFSHQHQHQVELGNVEHDRMEVNEPNSGHATIRGSQSTREQHEINIGPPKDFSFDKRQAASSSYNMPLVFRLTDPNSMSESEAMVIVEGLLGKLARRCYAVLCLGVPVVSVTVAHFIKGTMDLPEEPTQPRERSKRRLRALQGQLFVPIESSY
核苷酸序列:
ATGGCGGCATCAACCTCTGGAAGATCGCTGGAGCAAACGCCCACATGGGCCGTCGCCGTCGTCTGTTTTGTCTTGGTTCTTATCTCAATCATCATCGAGCACATACTCGAACTTTAGGAAAGTGGCTGAAGAATAAACACAAACGAGCTCTATTTGAAGCACTAGAAAAGGTGAAATCAGAGCTTATGCTACTGGGGTTCATATCGCTGCTGCTGACCGTCGGGCAGGGTCCGATATCGAACATATGCATATCGGAGAAAGTGGGGAACACGTGGCATCCGTGTAGCAAGAAGCAGGAGGTTAAGATCGAGGAAGAAGAAGAGGTTGAAAGCCCGAGTAGGAGACTGCTGGCGGCGTTTGAATCTGGTTATGGAGGTGGAAACGTACGCCGCGTTTTGGCGGCTGCTGGCACCGACAAGTGTGCAGCCAAGGGAAAAGTTCCATTCATATCTGCCGATGGTATTCATCAGCTGCATATATTTATCTTCGTCTTGGCTTTTTCCACGTACTCTATTGCATCCTCACAATGGCTTTAGGAAGAGCCAAGGTTTGTTTTTTCAGACAATTTGTTAGATCAGTTCCCAAAGTTGATTACTTGACCTTGCGGCATGGATTTATCATGGCACATTTGGCACCTCAAAGCCATCAACAATTCAATTTCCAGAAGTACATAAACAGATCACTCGAAGAGGATTTCAAAGTTGTTGTGGGAATCAGCCCTCCAATTTGGTGCTTTGCCGTGATCTTTCTACTCTTCAATACTCATGGCTGGTATTCGTATCTTTGGTTACCCTTTATCCCACTCATTATTATTCTATTGGTGGGAACCAAGCTACAAGTGATCATAACCAAGATGGGTCTTAGAATTCAGGAAAGAGGAGAAGTTGTGAAGGGCACACCAGTTGTTCAACCTGGTGATGACCTCTTCTGGTTCAATCGCCCTCGCCTCATTCTCTACCTCATCAACTTCGTTCTCTTTCAGAATGCCTTCCAACTTGCTTTCTTCGCATGGAGTTGGTATGAATTTAGTTTGAAATCTTGCTTTCATGAGCATATTGAGGATATCATCATCAGAGTTTCAATGGGGGTCCTCATACAAATTCTTTGCAGTTATGTCACTCTCCCCCTTTATGCCCTTGTCACACAGATGGGCTCTACTATGAAACCAACAATATTCAACGAGAGAGTAGCCACAGCTCTACGCAAGTGGCATCACACGGCTAAGAAGCACATCAAACAGAACAAAGGCTCCGTCACCCCAATGTCTAGCCGACCAGGCACTCCATCCCACCATGCATCGCCCATCCACCTCCTGCGGCACTACCGCAGCGAGGTGGATAGCTTCCACACATCACCACGGAGATCAAACTTCGACGTCGAACAACGTTACGAAACCGACTCCCCCTCCCCCTCCCACCACCTCCACATAGATGGTTCATTTTCTCACCAACACCAACACCAAGTCGAATTAGGGAATGTGGAACATGATCGGATGGAGGTCAATGAACCCAACTCCGGTCATGCCACAATTAGAGGTTCTCAATCGACTCGCGAACAACACGAAATTAATATCGGACCGCCCAAGGACTTTTCGTTCGATAAGAGACAAGCGGCTTCTTCCTCCTATAATATGCCCCTTGTTTTTCGGCTCACTGATCCAAATTCCATGTCAGAGAGTGAAGCCATGGTGATAGTGGAAGGATTGTTGGGGAAGCTGGCTCGTCGGTGCTATGCGGTGTTGTGTCTGGGGGTGCCGGTTGTGTCGGTGACGGTGGCTCACTTCATTAAAGGAACTATGGATCTGCCGGAGGAACCTACTCAACCTAGAGAGCGCAGCAAGCGCCGTCTTCGAGCTTTGCAGGGTCAGCTCTTCGTACCAATCGAGTCTAGCTACTGA
gene23134-vl.0-ab_initio
氨基酸序列:
MAALEYERTLEKTPTWAVAAVCFVLLVISIFIEHVINFIGKWFRSRQKRALYEALEKIKSELMLLGFLSLLLTVLQDPISGICIPKSVAATWHPCNDDPPKTTAGKLEEYSDSGFIFRRQLATKGYDKCTAHGKVAFVSAYGIHQLHIFIFVLAIFHVLYCITTLFLGRHKMRIWKYWENETKTIEYQFSTDPERFRYTRDTSFGKRHLHFWSESPVFLWIVCFFRQFYRSVTKTDYLTLRHGFITAHLAPGSETTFDFRKYISRSLEDDFLVIVEISPIIWFSAVLFLLSNAYGWHSYLWLPFISLIIILVVGTKLQVIITKLGLRIQDRGGVVMGAPLVQPGDQHFWFGRPRFLLFLIHFALFQNAFQLAFFAWSTWQFGITSCFHQTPQDTAIRLSVGVIVQVLCSYVTLPLYALVTQNANNRSEVTDGDDLFPPPDASVVVDMQHWDTEGSRSPKNNVGSSERGGIRQPSTFELGRTQELPAFSLSHPEVSSPSGISSARARK
核苷酸序列:
ATGGCGGCACTCGAATATGAGCGTACTTTAGAGAAAACTCCAACATGGGCAGTTGCTGCGGTCTGTTTTGTGTTGCTTGTAATATCAATTTTCATCGAGCATGTCATCAACTTCATAGGAAAGTGGTTTAGAAGTAGACAGAAGCGAGCTCTCTATGAAGCTCTTGAGAAGATCAAATCAGAGCTTATGCTGTTGGGATTCCTATCCTTGCTCCTAACAGTTCTACAAGATCCAATTTCTGGTATATGTATACCAAAGAGTGTTGCAGCCACTTGGCATCCTTGCAATGATGACCCTCCAAAGACTACAGCTGGGAAACTTGAGGAATACTCAGATTCTGGCTTCATTTTCCGGCGCCAATTAGCCACAAAAGGATATGATAAGTGCACGGCTCATGGTAAAGTTGCCTTTGTGTCTGCATATGGGATTCACCAGCTCCATATATTCATCTTTGTGCTAGCAATTTTTCATGTGCTCTACTGCATCACAACTTTGTTTTTGGGAAGACACAAGATGAGAATATGGAAGTATTGGGAGAATGAGACAAAAACAATTGAATACCAGTTTAGTACTGATCCAGAAAGGTTTAGGTATACGAGGGATACATCATTTGGAAAGAGGCATTTACACTTCTGGAGCGAGTCACCAGTTTTCCTTTGGATTGTATGCTTCTTCAGACAGTTCTACAGGTCAGTTACTAAGACTGATTACCTGACTCTGAGGCATGGCTTTATCACGGCACATTTAGCACCTGGGAGTGAAACGACCTTTGATTTTCGGAAGTACATAAGTAGATCACTTGAAGATGACTTCTTAGTTATTGTTGAGATAAGTCCAATTATATGGTTCTCAGCAGTGCTGTTCCTGTTGTCTAATGCATATGGATGGCATTCGTATCTCTGGCTACCATTTATCTCTTTAATTATAATCCTTGTGGTGGGAACTAAACTACAAGTGATTATAACCAAGCTGGGGCTAAGGATTCAGGATAGAGGGGGTGTGGTGATGGGTGCACCGCTTGTTCAACCCGGTGATCAGCACTTCTGGTTTGGACGCCCGCGCTTCTTGCTCTTCCTCATCCACTTTGCTTTATTCCAGAATGCATTTCAGCTGGCCTTCTTTGCATGGAGTACTTGGCAGTTTGGGATAACTTCTTGCTTCCATCAAACCCCTCAAGATACCGCCATCAGGCTCTCAGTGGGGGTTATCGTACAAGTTTTATGTAGTTATGTGACTCTGCCACTCTATGCTCTAGTGACACAGAATGCCAACAACCGCAGTGAGGTCACTGATGGGGATGACCTATTTCCACCTCCAGACGCATCAGTCGTAGTTGATATGCAACATTGGGACACTGAAGGGTCACGTTCCCCGAAGAACAATGTTGGATCGAGTGAAAGAGGAGGAATTAGGCAACCTAGTACTTTTGAGTTAGGCCGAATTCAAGAGCTACCTGCATTCTCCTTGTCTCACCCTGAAGTTAGTAGTCCCTCAGGCATCTCATCTGCTAGAGCAAGAAAGTGA。
2.權利要求1所述快速鑒定草莓白粉病基因的應用,包括:
1)攜帶有抗白粉病MLO基因的育種材料的創制或者新品種創制:利用權利1所給出的MLO基因源為親本材料,在雜交、回交后代中,可以獲得轉育有MLO抗性基因的育種材料。
2)抗白粉病基礎理論研究:對權利1的MLO型抗白粉病基因進行分子標記分析;對該基因進行分子作圖或者基因定位;對該基因進行克隆以及基因間互作分析。
3)抗白粉病轉基因研究:利用權利要求1所給出的MLO型白粉病基因進行轉基因研究。
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