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[發明專利]一種采用巢式PCR檢測脊柱結核分枝桿菌的方法及其專用引物在審

專利信息
申請號: 201310541387.7 申請日: 2013-11-06
公開(公告)號: CN104131068A 公開(公告)日: 2014-11-05
發明(設計)人: 王文軍;左建宏;宋西正 申請(專利權)人: 王文軍;左建宏;宋西正
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 衡陽市科航專利事務所 43101 代理人: 劉勛階
地址: 421001 湖南省衡陽市*** 國省代碼: 湖南;43
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 采用 pcr 檢測 脊柱 結核 分枝桿菌 方法 及其 專用 引物
【說明書】:

技術領域

發明涉及一種病原微生物的檢測方法及其專用引物,具體來說就是一種采用巢式PCR檢測脊柱結核分枝桿菌的方法及其專用引物。?

背景技術

據世界衛生組織統計,全世界現有結核病人2000萬,每年新發生約800萬例,全世界平均每15秒就有一人死于結核病,每天有5000人因此喪生,僅2006年,就有200萬人死于該病,約1/3人群有潛伏性結核分枝桿菌(mycobacterium?tuberculosis,?MTB)感染。在發展中國家,由于耐藥結核菌株的出現,人口劇增、移民增加、旅游業發展、酗酒與貧困、吸毒、合并獲得性免疫缺陷病毒(HIV)感染、以及治療性免疫抑制癥導致的傳染性結核病發病率逐年上升,從而使結核病控制趨勢更加嚴峻。結核是成年人最主要的傳染病殺手,也是HIV攜帶人群死亡的最主要感染原因。全球每年在結核方面的經濟支出至少在120億美元以上。?

骨關節結核是最常見的繼發肺外結核,約占肺外結核發病率的10%,脊柱結核俗稱脊柱癆、龜背痰,在骨結核中最為常見,發病率約為50%,而45%脊柱結核病人常常因為椎體逐漸破壞、塌陷,后凸畸形進行性加重,最后導致脊髓或神經根損害,嚴重者發生遲發性麻痹,甚至截癱。?

因此對結核病的檢測變得尤為重要,目前對脊柱結核的臨床診斷主要依靠臨床癥狀、實驗室及影像學檢查。影像學檢查包括X片、CT和MRI等,特別是重建CT的應用,可獲得椎體隱匿病變的立體印象;平片在脊柱結核的診斷是首選的,但是其敏感性不高,在許多脊柱結核患者,臨床癥狀很明顯時,X平片可無表現,而在平片中被發現時,椎體50%的骨礦已丟失,MRI作為較好的診斷技術之一,但做為普查及初篩時的檢查,因其價格高而不能廣泛使用。許多脊柱結核的臨床癥狀和影像學表現多在疾病的中晚期出現,有的甚至不典型,故其診斷的及時性有限。結核的實驗室檢查包括涂片,菌培養及免疫學檢查。結核病的細菌學檢查,是發現傳染源的主要途徑和手段,是確定結核病診斷和化療方案的重要依據,但由于MTB的生長緩慢,脊柱結核患者排菌量少,致使作為“金標準”的結核細菌學培養存在著靈敏度低,操作復雜,需時較長,影響因素多,不易標準化等缺點;另外,由于脊柱、脊髓的解剖特性,脊柱結核起病隱匿,對脊柱結核,病灶取材多為有創檢查,且椎體或深部膿腫的穿刺需要一定的技術要求,從而限制了其廣泛應用;免疫學中的純化蛋白衍生物(PPD)試驗陽性率低,特異性差。因此,一種快速、靈敏、準確的早期脊柱結核診斷方法顯得十分重要的意義。?

自1985年美國PE?Cetus公司的Kary?Mullis建立聚合酶鏈反應(Polymerase?chain?reaction,?PCR)技術以來,PCR技術因其靈敏、特異、快速,已被廣泛應用于遺傳診斷、基因研究及病原體的檢測等各方面,極大推動了生命科學的研究進展。而PCR自1989年引入結核病的檢測以來,該技術對于難以培養、生長緩慢的結核分枝桿菌的分子生物學研究有著獨特的意義,近年來,以PCR為基礎的新型基因診斷技術發展很快,目前,不少學者正在探索如將特異性強的DNA探針與敏感性高的PCR技術相結合,并已成功用于臨床標本結核分枝桿菌的檢測。PCR技術目前在檢測肺結核患者的痰液及其外周血中結核分枝菌DNA含量方面已較成熟,在脊柱結核患者膿液中檢測結核分枝桿菌DNA含量方面也有很多研究,但用巢式PCR探討快速檢測結核分枝桿菌DNA及其含量的研究及臨床應用,國內外文獻報道較少。?

發明內容

本發明的目的是提供一種采用巢式聚合酶鏈式反應(簡稱巢式PCR)來檢測結核分枝桿菌DNA的方法及其專用引物。?

其中兩對引物為以SEQ?ID?No.1和SEQ?ID?No.2為上游引物,以SEQ?ID?No.3和SEQ?ID?No.4為下游引物;所述引物對組的核苷酸序列分別為:?

上游引物A:TB(5,-GGCGGGACAACGCCAATTGCG-3,)

上游引物B:TB(5,-ACGACCACATCAACC-3,)

下游引物C:TB(5,-AGTTTGGTGTCATCAGCC-3,)

下游引物D:TB(5,-CGAGCTAGGCGTCGGTGACAAAG-3,)。

????上述引物的含量分別為:?

上游引物A:?290bp(SEQ?ID?No.1)

上游引物B:?856bp(SEQ?ID?No.2)

下游引物C:?505bp(SEQ?ID?No.3)

下游引物D:?670bp(SEQ?ID?No.4)。

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