[發(fā)明專利]考察含鯉IGF2b基因慢病毒影響鯉魚體格的聚類方法

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 201310516509.7
• 申請日: 2013-10-28
• 公開（公告）號: CN103555791A
• 公開（公告）日: 2014-02-05
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 蘇勝彥;董在杰;袁新華
• 申請（專利權(quán)）人: 中國水產(chǎn)科學研究院淡水漁業(yè)研究中心
• 主分類號: C12P19/14
• 分類號: C12P19/14
• 代理公司: 南京經(jīng)緯專利商標代理有限公司 32200
• 代理人: 李紀昌

?

技術(shù)領(lǐng)域

????本發(fā)明提供了一種用于考察含鯉IGF2b基因慢病毒影響鯉魚體格的聚類方法，屬于漁業(yè)養(yǎng)殖技術(shù)領(lǐng)域。

?

背景技術(shù)

在科研試驗和技術(shù)開發(fā)中，常常設(shè)置幾個處理組，用來確定主要的試驗影響因子，影響因子的劑量及影響程度等。這類試驗中處理的指標往往不只一個，比如一個營養(yǎng)因素試驗中，測定指標有血液指標、基因表達量指標、生長性狀指標、免疫學指標等多個方面的指標。然而，對于這方面的數(shù)據(jù)處理主要通過方差分析和回歸分析，而如何確定不同處理組之間對這些指標的綜合影響，鮮見報道。

以鯉魚養(yǎng)殖為例，中國專利201210087621.9公開了一種利用含有鯉IGF2b基因的慢病毒來提高鯉魚產(chǎn)肉量的方法，該方法結(jié)果顯示：用已檢測的含有鯉IGF2b基因的慢病毒感染鯉魚幼體，3個月后，感染組相比對照組，鯉體重獲得了顯著增加，同時鯉魚血液各項指標沒有影響，安全性好。

但是由于鯉魚的生長指標不僅有體重，還有其它的例如體長、體高、體厚等，這些體格指標也在實際過程中有著重要的價值，但是這些指標在測量時又會受到體重的影響，導致采用常規(guī)的歸類、回歸等分析方法無法準確考察慢病毒注入量對于體格參數(shù)的影響。

?

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的目的是：提供一種可以避免體重指標的干擾而能判斷出含有鯉IGF2b基因的慢病毒注入量對鯉魚體格指標影響的方法，并且可以解決不同注入量的試驗組之間多個指標相互干擾的問題，該方法可以用于通過調(diào)整慢病毒注射量來達到篩選不同體格鯉魚樣本的目的。技術(shù)方案如下：

一種考察含鯉IGF2b基因慢病毒影響鯉魚體格的聚類方法，其特征在于，包括如下步驟：

第一步、準備鯉魚樣本，分組；在不同樣本組的鯉魚樣本體內(nèi)注射不同濃度的含有鯉IGF2b基因的慢病毒，養(yǎng)殖；

第二步、對養(yǎng)殖后的鯉魚樣本測定以下7個指標：體重、體長、體高、體厚、魚尾柄長、尾柄厚、背脊前距；

第三步、以體重為因變量，以體長、體高、體厚、魚尾柄長、尾柄厚、背脊前距為參變量，進行回歸分析，找到對體重有顯著性影響的體格指標；

第四步、以第三步得到的對體重有顯著性影響的體格指標作為特征值，對不同樣本組進行聚類分析，根據(jù)不同劑量組的樣本被聚類到不同類的結(jié)果來考察含鯉IGF2b基因慢病毒對于體格參數(shù)的影響。

本發(fā)明中，所述的背脊前距是指鯉吻部到第一根背脊的距離；所述的體格指標是指體長、體高、體厚、魚尾柄長、尾柄厚、背脊前距。

作為本發(fā)明的優(yōu)選，第三步中所述的對體重有顯著性影響的體格指標是指體長、體厚和尾柄長。

作為本發(fā)明的優(yōu)選，第三步中所述的回歸分析是指線性回歸。

作為本發(fā)明的優(yōu)選，第三步中所述的回歸分析中，判定是否具有顯著性影響的標準是：相關(guān)性分析中當P≤0.05，則認為是具有顯著性影響。

本發(fā)明的實現(xiàn)原理：在鯉魚樣本中注射慢病毒會對體重產(chǎn)生明顯的影響，另外又由于體格指標會與體重相關(guān)性較大，而且體重和體長、體高、體厚等存在共線性問題，因此在常規(guī)的分析方法中無法測定不同劑量組中注射劑量對于體格的影響；本發(fā)明通過找到對于體重有明顯影響的指標，利用這些篩選出的指標作為特征值，可以避免體重對于體格結(jié)果判定的影響，接下來對這些篩選的體格指標作為特征值，對于不同注射劑量的樣本進行聚類分析，就可以得到注射劑量是否能夠?qū)τ隗w格產(chǎn)生影響。

?

附圖說明

圖1是背脊前距測量方法的示意。

圖2是實施例的第2步中進行聚類分析的結(jié)果示意圖。

圖3是實施例的第4步中進行聚類分析的結(jié)果示意圖。

?

具體實施方式

1.?將鯉魚樣本隨機分為5組，每組200尾，根據(jù)專利號為201210087621.9的方法進行含鯉IGF2b基因慢病毒的注射，陰性對照不做任何處理，陽性對照制作注射處理，3個處理組的注射劑量分別是10μL、20μL、40μL；再養(yǎng)殖5個月后，進行第二次數(shù)據(jù)測量，測量指標為體重、體長、體高、體厚，增加測量魚尾柄長、尾柄厚，并且首次測量鯉吻部到第一根背脊的距離（命名為背脊前距），見圖1。