[發(fā)明專利]TERT啟動子的單核苷酸多態(tài)性序列

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201310512895.2
• 申請日: 2013-10-28
• 公開（公告）號: CN103540589A
• 公開（公告）日: 2014-01-29
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 蔡志明;吳松;黃毅;王波;張蒙;楊雷
• 申請（專利權(quán)）人: 深圳市第二人民醫(yī)院
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 深圳市合道英聯(lián)專利事務(wù)所(普通合伙) 44309
• 代理人: 廉紅果;謝成毅

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及TERT啟動子的單核苷酸多態(tài)性序列。

-背景技術(shù)

膀胱癌是排在第九位的全球最常見的腫瘤。2013年,在美國有超過73000名患者被診斷為膀胱癌，其中死亡人數(shù)約15000人。其中超過90%的患者最初診斷為原發(fā)性膀胱癌，大約75%的患者目前為表淺膀胱腫瘤,20%的為浸潤性膀胱腫瘤,剩下的5%初診為轉(zhuǎn)移性腫瘤。先前的研究表明,膀胱癌有著多變的臨床表現(xiàn)和遺傳背景。最近的膀胱腫瘤研究報道了8個相關(guān)基因(UTX,MLL-MLL3,CREBBP-EP300,NCOR1,?ARID1A,CHD6)。

目前檢測“膀胱癌”采用的腫瘤標(biāo)記物主要有以下幾種，但是各腫瘤標(biāo)志物都存在不同的缺點(diǎn)：

(1)、膀胱腫瘤抗原(BTA)：BTA試劑分為BTA?stat和BTA?test兩種；首先，這兩種試劑都不能獨(dú)立用于確診膀胱癌；另外，BTA試劑價格昂貴，目前尚難以全面推廣使用；

(2)、Lewis?X抗原檢測：Lewis?X是一種ABO血型相關(guān)抗原，在正常尿路上皮中不存在該抗原；而5%～89%的移行細(xì)胞癌可檢出Lewis?X，但Lewis?X與腫瘤的分級無關(guān)；

(3)、核基質(zhì)蛋白22(nuclear?matrix?protein22，NMP22)：NMP22是核有絲分裂器蛋白，診斷膀胱癌的敏感性為48%～90%，特異性為70%～92%，NMP22對高級，高期膀胱癌敏感性較高；

(4)、纖維蛋白/纖維蛋白降解產(chǎn)物(fibrin?degradation?products，F(xiàn)DP)：用快速免疫檢測法測定尿中FDP診斷膀胱癌的敏感性為68%，對T2～T4期膀胱癌的敏感性更是高達(dá)100%；

(5)、玻璃酸酶檢測hyaluronidase,HAase：玻璃酸酶是一種細(xì)胞外降解基質(zhì)透明質(zhì)酸的內(nèi)源性糖苷酶，在腫瘤進(jìn)展中起重要作用，應(yīng)用凝膠技術(shù)檢測G2，G3級膀胱癌尿液中玻璃酸酶活性，敏感性達(dá)92%～100%；

(6)、端粒酶活性(telomerase)：端粒是位于染色體末端的保護(hù)性結(jié)構(gòu)，隨細(xì)胞分裂逐步縮短，直至細(xì)胞死亡，端粒酶的作用就是延長端粒，現(xiàn)已發(fā)現(xiàn)多種腫瘤細(xì)胞中端粒酶活性增強(qiáng)，該法診斷包括低級，低期腫瘤在內(nèi)的膀胱癌，敏感性可達(dá)91%。

然而，導(dǎo)致膀胱腫瘤發(fā)生的關(guān)鍵點(diǎn)仍未完全闡明，同時由于這些個體標(biāo)記的靈敏性較低以至于未被應(yīng)用于臨床實(shí)踐中，這表明需要新的靈敏性高的生物標(biāo)記。

發(fā)明內(nèi)容

在本發(fā)明的試驗(yàn)過程中，在超過85%的人類腫瘤研究中發(fā)現(xiàn)端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(TERT，?TERT通過Human?Genome?Browser獲取?NCBI發(fā)布版本37的人類基因組序列：Feb.2009(GRCh37/hg19?)；>hg19_ensGene_ENST00000310581_0?range=chr5:1295163-

1296562?5'pad=400?3'pad=0?strand=-?repeatMasking=none)活躍,我們認(rèn)為是一個人類腫瘤發(fā)生的重要機(jī)制。TERT是端粒酶的催化部分，位于5號染色體短臂?,?在人類腫瘤中調(diào)節(jié)端粒酶活性。最近人們應(yīng)用全基因組測序在黑素瘤中發(fā)現(xiàn)TERT啟動子突變。人們在一些膀胱癌樣本中證實(shí)了高頻率的TERT啟動子突變。一些研究發(fā)現(xiàn),?具有活性的端粒酶或TERT表達(dá)增加與腫瘤的病理分期以及臨床分期是相關(guān)聯(lián)的。然而,人們還未獲得TERT基因拷貝，TERT的表達(dá)或活性對膀胱癌的臨床影響仍然是有爭議的。在本發(fā)明中，我們通過試驗(yàn)得到TERT啟動子的高頻突變位點(diǎn)，并進(jìn)行了相關(guān)的體外功能分析試驗(yàn)來證實(shí)：這些啟動子的突變可提高ETRT活性，是導(dǎo)致惡性腫瘤發(fā)生的關(guān)鍵點(diǎn)所在，這些突變對泌尿生殖系統(tǒng)惡性腫瘤的診斷和預(yù)后具有重要的意義。

本發(fā)明的目的在于公開了一種TERT啟動子的單核苷酸多態(tài)性序列。

本發(fā)明的目的是通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn)的：

一種TERT啟動子的單核苷酸多態(tài)性序列，其中，單核苷酸多態(tài)性序列為：

TERT啟動子chr5,1,295,228位為C或T(即反鏈第chr5,?1,295,228位為G或A)的堿基多態(tài)性序列；

TERT啟動子chr5,1,295,242-1,295,243位為CC或TT(即反鏈第chr5,1,295,242-1,295,243位為GG或AA)的堿基多態(tài)性序列；