[發明專利]TERT啟動子的單核苷酸多態性序列

無效

• 申請號: 201310512895.2
• 申請日: 2013-10-28
• 公開（公告）號: CN103540589A
• 公開（公告）日: 2014-01-29
• 發明（設計）人: 蔡志明;吳松;黃毅;王波;張蒙;楊雷
• 申請（專利權）人: 深圳市第二人民醫院
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68
• 代理公司: 深圳市合道英聯專利事務所(普通合伙) 44309
• 代理人: 廉紅果;謝成毅

技術領域

本發明屬于生物技術領域，具體涉及TERT啟動子的單核苷酸多態性序列。

-背景技術

膀胱癌是排在第九位的全球最常見的腫瘤。2013年,在美國有超過73000名患者被診斷為膀胱癌，其中死亡人數約15000人。其中超過90%的患者最初診斷為原發性膀胱癌，大約75%的患者目前為表淺膀胱腫瘤,20%的為浸潤性膀胱腫瘤,剩下的5%初診為轉移性腫瘤。先前的研究表明,膀胱癌有著多變的臨床表現和遺傳背景。最近的膀胱腫瘤研究報道了8個相關基因(UTX,MLL-MLL3,CREBBP-EP300,NCOR1,?ARID1A,CHD6)。

目前檢測“膀胱癌”采用的腫瘤標記物主要有以下幾種，但是各腫瘤標志物都存在不同的缺點：

(1)、膀胱腫瘤抗原(BTA)：BTA試劑分為BTA?stat和BTA?test兩種；首先，這兩種試劑都不能獨立用于確診膀胱癌；另外，BTA試劑價格昂貴，目前尚難以全面推廣使用；

(2)、Lewis?X抗原檢測：Lewis?X是一種ABO血型相關抗原，在正常尿路上皮中不存在該抗原；而5%～89%的移行細胞癌可檢出Lewis?X，但Lewis?X與腫瘤的分級無關；

(3)、核基質蛋白22(nuclear?matrix?protein22，NMP22)：NMP22是核有絲分裂器蛋白，診斷膀胱癌的敏感性為48%～90%，特異性為70%～92%，NMP22對高級，高期膀胱癌敏感性較高；

(4)、纖維蛋白/纖維蛋白降解產物(fibrin?degradation?products，FDP)：用快速免疫檢測法測定尿中FDP診斷膀胱癌的敏感性為68%，對T2～T4期膀胱癌的敏感性更是高達100%；

(5)、玻璃酸酶檢測hyaluronidase,HAase：玻璃酸酶是一種細胞外降解基質透明質酸的內源性糖苷酶，在腫瘤進展中起重要作用，應用凝膠技術檢測G2，G3級膀胱癌尿液中玻璃酸酶活性，敏感性達92%～100%；

(6)、端粒酶活性(telomerase)：端粒是位于染色體末端的保護性結構，隨細胞分裂逐步縮短，直至細胞死亡，端粒酶的作用就是延長端粒，現已發現多種腫瘤細胞中端粒酶活性增強，該法診斷包括低級，低期腫瘤在內的膀胱癌，敏感性可達91%。

然而，導致膀胱腫瘤發生的關鍵點仍未完全闡明，同時由于這些個體標記的靈敏性較低以至于未被應用于臨床實踐中，這表明需要新的靈敏性高的生物標記。

發明內容

在本發明的試驗過程中，在超過85%的人類腫瘤研究中發現端粒酶逆轉錄酶(TERT，?TERT通過Human?Genome?Browser獲取?NCBI發布版本37的人類基因組序列：Feb.2009(GRCh37/hg19?)；>hg19_ensGene_ENST00000310581_0?range=chr5:1295163-

1296562?5'pad=400?3'pad=0?strand=-?repeatMasking=none)活躍,我們認為是一個人類腫瘤發生的重要機制。TERT是端粒酶的催化部分，位于5號染色體短臂?,?在人類腫瘤中調節端粒酶活性。最近人們應用全基因組測序在黑素瘤中發現TERT啟動子突變。人們在一些膀胱癌樣本中證實了高頻率的TERT啟動子突變。一些研究發現,?具有活性的端粒酶或TERT表達增加與腫瘤的病理分期以及臨床分期是相關聯的。然而,人們還未獲得TERT基因拷貝，TERT的表達或活性對膀胱癌的臨床影響仍然是有爭議的。在本發明中，我們通過試驗得到TERT啟動子的高頻突變位點，并進行了相關的體外功能分析試驗來證實：這些啟動子的突變可提高ETRT活性，是導致惡性腫瘤發生的關鍵點所在，這些突變對泌尿生殖系統惡性腫瘤的診斷和預后具有重要的意義。

本發明的目的在于公開了一種TERT啟動子的單核苷酸多態性序列。

本發明的目的是通過以下技術方案實現的：

一種TERT啟動子的單核苷酸多態性序列，其中，單核苷酸多態性序列為：

TERT啟動子chr5,1,295,228位為C或T(即反鏈第chr5,?1,295,228位為G或A)的堿基多態性序列；

TERT啟動子chr5,1,295,242-1,295,243位為CC或TT(即反鏈第chr5,1,295,242-1,295,243位為GG或AA)的堿基多態性序列；