[發明專利]利用RT-LAMP快速檢測甘蔗黃葉病毒的方法無效
| 申請號: | 201310502520.8 | 申請日: | 2013-10-23 |
| 公開(公告)號: | CN103509881A | 公開(公告)日: | 2014-01-15 |
| 發明(設計)人: | 陳保善;司慧娟;溫榮輝;呂榜麗;周龍武 | 申請(專利權)人: | 廣西大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
| 代理公司: | 廣西南寧公平專利事務所有限責任公司 45104 | 代理人: | 黃永校 |
| 地址: | 530004 廣西壯族*** | 國省代碼: | 廣西;45 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 利用 rt lamp 快速 檢測 甘蔗 黃葉 病毒 方法 | ||
1.利用RT-LAMP快速檢測甘蔗黃葉病毒的方法,其特征在于,包括如下步驟:
1)根據NCBI已報道的甘蔗黃葉病毒的CP蛋白的核苷酸序列,通過多序列比對選擇相對保守序列,通過在線LAMP引物設計軟件primerExplorer?V4設計4條引物,其中包括2條外引物F3/B3和2條內引物FIP/BIP;
2)利用RNAiso?Plus法提取甘蔗植株的總RNA;
3)利用M-MLV反轉錄酶把提取的RNA轉化為cDNA;
4)設置不同的Mg2+濃度、dNTPs的濃度以及甜菜堿的濃度,確定最佳反應體系;分別改變反應的溫度進行RT-LAMP擴增反應,RT-LAMP反應溫度為61-63℃,反應時間為60-80min;
5)在最佳反應參數的條件下,以未感染樣品作為陰性對照驗證這一方法的特異性;
6)實驗結果通過肉眼判斷和利用1.5%的電泳檢測進行驗證或者熒光染料檢測可以檢測出甘蔗黃葉病毒。
2.根據權利要求1所述的利用RT-LAMP快速檢測甘蔗黃葉病毒的方法,其特征在于,所述2條外引物F3/B3和2條內引物FIP/BIP的序列為:
F3:5-GCAATCGCACTTGAAGTGGA-3
B3:5-GCATTCAAATCGGCAGACG-3
FIP:5-TTCTTGGCGTTCCTCTTGACGG-TGCTCCCAAACAACAACAGG-3
BIP:5-ACGTCAGCTGACCAGTTTTGGT-TTGTCCTGCTAGGCTCGA-3。
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