[發(fā)明專利]用于檢測H4亞型禽流感病毒的RT-LAMP引物組應(yīng)用及試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310499617.8 | 申請日: | 2013-10-22 |
| 公開(公告)號: | CN103614490A | 公開(公告)日: | 2014-03-05 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 王友令;楊金興;袁小遠(yuǎn);徐懷英;張玉霞;劉軍河;韓曉珺;董偉峰 | 申請(專利權(quán))人: | 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院家禽研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
| 代理公司: | 濟(jì)南舜源專利事務(wù)所有限公司 37205 | 代理人: | 徐槐 |
| 地址: | 250131 山東省濟(jì)南市歷*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 檢測 h4 禽流感 病毒 rt lamp 引物 應(yīng)用 試劑盒 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,涉及禽流感病毒的檢測,尤其涉及用于檢測H4亞型禽流感病毒的RT-LAMP引物組、該引物組的應(yīng)用以及檢測H4亞型禽流感病毒的RT-LAMP試劑盒。
背景技術(shù)
流感病毒(Influenza?virus)屬于正粘病毒科流感病毒屬,根據(jù)NP?蛋白和M?蛋白的不同可將其分為甲、乙和丙三型。流感病毒基因組是由8?條負(fù)鏈RNA?節(jié)段組成,編碼11?或12?個蛋白,其中兩個糖蛋白血凝素蛋白HA?和神經(jīng)氨酸酶蛋白NA?較為重要,二者位于病毒粒子表面。病毒RNA?與核糖核蛋白及三個RNA?依賴的RNA?聚合酶亞基PB2、PB1?和PA?相連。已知甲型流感病毒已在多種動物體內(nèi)分離到,包括人、豬、馬、鯨、海豹和鳥類等。根據(jù)其血清學(xué)檢測,現(xiàn)已經(jīng)鑒定出17?個HA?亞型(H1-17)和9?個NA?亞型(N1-9)。
根據(jù)毒力大小的不同,流感病毒可分為低致病性禽流感(LPAI)和高致病性禽流感(HPAI),已知的17個HA?和9?個NA?亞型均能在水禽中分離到,其中僅H5?和H7?亞型的部分毒株屬于HPAI,其余均屬于LPAI。所有人類的流感病毒都可以引起禽類流感,但不是所有的禽流感病毒都可以引起人類流感。禽流感病毒中,H5、H7、H9可以傳染給人,其中H5為高致病性。2005?年,中國西部青海湖地區(qū)發(fā)生了水禽感染HPAI?的H5N1,導(dǎo)致野鳥大面積死亡,所以要注意到遷徙鳥中的HPAI??H5N1?流感病毒的潛在危險(xiǎn)。隨后,在東南亞不同地區(qū)都出現(xiàn)了基因型和抗原性不同的新型HPAI??H5N1,并在家禽中廣泛流行。同時(shí)亦不能忽視家禽轉(zhuǎn)運(yùn)和鳥類遷徙過程在HPAI?H5N1?的遠(yuǎn)距離傳播中的作用,這也解釋了歐洲、中東和非洲地區(qū)等地區(qū)頻繁暴發(fā)禽流感的可能原因。
流感病毒的HA?蛋白對受體的特異性和親和力是決定宿主嗜性和傳播能力的關(guān)鍵因素之一。1918?年H1N1?流感病毒會受HA?蛋白上190?和225?位氨基酸的影響;D225G?突變體下降了α2,6?唾液酸結(jié)合的親和力,導(dǎo)致與人氣管中杯狀細(xì)胞的結(jié)合力下降,從而使病毒在雪貂中的傳播能力下降。同時(shí)H5N1?病毒在識別不同的受體結(jié)合特性是由不同的氨基酸殘基引起的。同樣,在受體結(jié)合位點(diǎn)附近的殘基差異使其它禽或流行的流感病毒的受體結(jié)合特性變得更加復(fù)雜,表明在不同的HA?亞型中受體的特異性是不同的。
我國一直被認(rèn)為是禽流感的高發(fā)和易發(fā)地,經(jīng)常是多種亞型AIV并存的情形。LPAIV?不像HPAIV?可引起野鳥和家禽的大面積死亡,但仍然存在較多的潛在危險(xiǎn),如重組變異形成新的病毒等。因此LPAIV?仍然需要相當(dāng)?shù)闹匾暋?/p>
H4?亞型AIV?屬于LPAIV,國內(nèi)分離到的毒株較少,因此對之研究較少。國際上目前有韓國、俄羅斯等國家均報(bào)道分離到該亞型。哺乳動物分離到的該病毒是1999?年在加拿大豬體內(nèi)分離到一株H4N6?病毒,序列分析表明,其各病毒節(jié)段均為禽源,但HA?基因的226L的特征使該病毒具有了感染豬的能力,由此暗示H4亞型病毒可能在哺乳動物體內(nèi)逐漸適應(yīng)。
目前,H4流感病毒檢測主要依賴病毒分離和分子生物學(xué)檢測,但是不能進(jìn)行敏感特異快速的檢測方法。所以目前為止還沒有確定一種最具有臨床使用價(jià)值的基層分子生物學(xué)診斷方法。
發(fā)明內(nèi)容
為了解決上述的技術(shù)問題,本發(fā)明提供了用于檢測H4亞型禽流感病毒的RT-LAMP引物組,還提供了上述的用于檢測H4亞型禽流感病毒RT-LAMP的試劑盒。
用于檢測H4亞型禽流感病毒的RT-LAMP引物組,該RT-LAMP引物組其核苷酸序列分別如SEQ?ID?NO.1、SEQ?ID?NO.2?、SEQ?ID?NO.3、?SEQ?ID?NO.4所示。
上述的RT-?LAMP引物組在制備檢測或診斷H4亞型禽流感病毒的生物試劑中的用途、在制備檢測或診斷鴨坦布蘇病毒的生物試劑中的應(yīng)用也是本發(fā)明所要保護(hù)的范圍。
用于檢測H4亞型禽流感病毒RT-LAMP的試劑盒,包括反應(yīng)混合液、酶混液和蒸餾水,該試劑盒還包括熒光檢測試劑及權(quán)利要求1所述的引物組。
H4亞型禽流感病毒RT-LAMP檢測的試劑盒在制備檢測或診斷H4亞型禽流感病毒的生物試劑中的應(yīng)用、制備檢測或診斷鴨坦布蘇病毒的生物試劑中的應(yīng)用也是本發(fā)明所要保護(hù)的范圍。
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