[發明專利]STUB1基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201310465540.2
• 申請日: 2013-09-30
• 公開（公告）號: CN104513822B
• 公開（公告）日: 2017-12-19
• 發明（設計）人: 戴蘭蘭;蔣慧;許予明;史長河;汪建;楊煥明
• 申請（專利權）人: 深圳華大基因股份有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C12N15/63;C12N1/21;C12N5/10;C12Q1/68;C12M1/34;C07K14/47
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙)11201
• 代理人: 李志東

技術領域

本發明涉及STUB1基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離編碼STUB1突變體的核酸，分離的多肽，篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的方法，篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的系統，用于篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的試劑盒，構建體以及重組細胞。

背景技術

性腺發育不全合并小腦共濟失調是一類臨床罕見的綜合征，其常表現為隱性遺傳模式或者散發，其發病特點包括：1、病人幼兒或青春期起病；2、病人主要表現為性腺發育不全，不育，及逐漸進展的行走不穩；3、可合并其他癥狀如：癡呆、視網膜色素變性、腦白質病變、錐體束受損、耳聾等，也可不合并上述癥狀；4、輔助檢查結果可發現相關病人可表現為低促性腺激素分泌不全性性腺發育不全或者高促性腺激素分泌不全性性腺發育不全，頭部MRI或者CT往往合并小腦萎縮。本類疾病自100余年前被英國著名學者Gordon Holmes描述過之后，不斷被報道，但相關機制尚不明確，致病基因的相關報道較少。

因而，目前對性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的研究尤其是致病基因的確定仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的方法。

本發明是基于發明人的下列工作完成的：發明人通過外顯子組測序聯合候選基因突變驗證的方法確定了性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的一個致病基因及其突變——STUB1基因的c.737C>T突變。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的編碼STUB1突變體的核酸。根據本發明的實施例，所述核酸與SEQ ID NO：1相比，具有c.737C>T突變，即相對于野生型STUB1基因，本發明的STUB1基因突變體的第737位堿基從C突變為T。根據本發明的實施例，發明人確定了STUB1基因的突變體，該突變體與性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的發病密切相關，從而通過檢測該突變體在生物樣品中是否存在，可以有效地檢測生物樣品是否易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，與SEQ ID NO：2相比，所述分離的多肽具有p.T246M突變，即該突變是由于c.737C>T的雜合錯義突變而引起的，具體地，相對于野生型STUB1，本發明的分離的多肽（即STUB1突變體）的第246位T突變為M。通過檢測生物樣品中是否表達該多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該方法包括以下步驟：從所述生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO：1相比，具有c.737C>T突變是所述生物樣品易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的指示。通過根據本發明實施例的篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的方法，可以有效地篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品。

根據本發明的第四方面，本發明提出了一種篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的系統。根據本發明的實施例，該系統包括：核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO：1相比，是否具有c.737C>T突變，判斷所述生物樣品是否易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥。利用該系統，能夠有效地實施前述篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品。

根據本發明的第五方面，本發明提出了一種用于篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品的試劑盒。根據本發明的實施例，該試劑盒含有：適于檢測STUB1基因突變體的試劑，其中與SEQ ID NO：1相比，該STUB1基因突變體具有c.737C>T突變。利用根據本發明的實施例的試劑盒，能夠有效地篩選易患性腺發育不全合并小腦共濟失調癥的生物樣品。