[發明專利]艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因Bb-KS、其編碼蛋白質以及基因克隆方法有效
| 申請號: | 201310456535.5 | 申請日: | 2013-09-30 |
| 公開(公告)號: | CN103525848A | 公開(公告)日: | 2014-01-22 |
| 發明(設計)人: | 官玲亮;龐玉新;胡雄飛;吳麗芬;于福來;張影波;王丹;韋睿斌;陳振夏 | 申請(專利權)人: | 中國熱帶農業科學院熱帶作物品種資源研究所;龐玉新 |
| 主分類號: | C12N15/60 | 分類號: | C12N15/60;C12N9/88;C12N15/10 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 艾納香內根 貝殼 杉烯合酶 基因 bb ks 編碼 蛋白質 以及 克隆 方法 | ||
技術領域
本發明涉及基因及其克隆方法,同時也涉及到基因編碼蛋白質,屬于生物技術領域,具體涉及一種艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因Bb-KS、其編碼蛋白質以及基因克隆方法。?
背景技術
艾納香(Blumea?balsamifera?L.DC.)為菊科艾納香屬多年生木質草本植物,主要分布于我國海南、貴州、廣西、廣東、云南、臺灣等省。以其全草或地上部分入藥,具有鎮痛、發汗、祛風除濕、去痰止咳、通經止血等功效,在黎族、苗族、壯族等少數民族地區有著悠久的用藥歷史,是一種重要的民間藥物。同時艾納香也是獲取天然冰片(艾片)的重要植物來源之一。并且,在精制艾片過程中所產生的艾油具有擴張血管、降低血壓、抑制交感神經的作用,因而被廣泛應用于醫藥行業。另外,艾油因其獨特的芳香氣味,還被廣泛應用于香料以及化妝品行業。雖然以艾納香為原材料的產品眾多,然而關于其化學成分的研究較少。?
對于艾納香而言,其化學成分比較復雜,但具有藥理作用的主要集中在黃酮類和揮發油成分上。鄧芹英等(1996),曹家慶等(2008),陳銘等(2009)分別對艾納香中黃酮類成分進行了分析,主要含有艾納香素、木犀草素、槲皮素、兒茶素以及阿亞黃素等。關于艾納香揮發油成分的研究:周欣等(2001)、馬芝玉等(2009)采用GC/MS方法檢測到艾納香中揮發油成分主要為:L-龍腦、樟腦、β-石竹烯、芳樟醇、大葉香烯D、香木蘭烯、順-α-沒藥烯、β-蓽澄茄油烯、γ-依蘭?油烯、ent-貝殼杉烯等萜類化合物。除此之外,艾納香中還含有多其他種化合物,如小麥黃素、芹菜素、原兒茶酸(甲酯)、咖啡酸(甲酯)、香草酸等化合物。其中,ent-貝殼杉烯類二萜化合物具有廣泛的生理活性,主要表現為抗腫瘤活性。由于ent-貝殼杉烯類化合物主要來自于天然產物,化合物供應量非常有限。?
內根-貝殼杉烯合酶(KS)是貝殼杉烯類化合物合成過程中的關鍵酶之一,也是合成赤霉素等信號分子的關鍵酶,對植物的生長發育起著至關重要的作用。目前在研究植物生長發育及抗性中涉及較多研究,而從植物次生代謝及產物藥理藥效活性方面研究較少。KS過去被稱為內根-貝殼杉烯合酶B,位于前質體,具有引導序列,與古巴焦磷酸合酶(Copalyl?pyrophosphate?synthase,CPS)共同催化牻牛兒基牻牛兒基焦磷酸(GGPP)形成內根-貝殼杉烯(ent-kaurene)。KS最早是從南瓜未成熟的種子中得到的,其突變嚴重影響植株的發育。擬南芥中的GA2蛋白編碼KS基因,在擬南芥的研究中發現,ga2矮化突變體是由KS基因的功能缺失造成的,對突變體ga2-1的序列進行分析,發現其cDNA中單堿基發生突變導致終止密碼子提前出現,從而使得KS基因失活。目前,KS基因在擬南芥、蓖麻、甜葉菊、梨、蘋果等植物上成功克隆,但目前還沒有關于艾納香內根-貝殼杉烯合酶(KS)基因的相關報道。因此,對艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因的克隆以及對他們的生物學功能研究,將有助于明確艾納香中二萜類次生代謝的分子機理,為調控其艾納香中有效成分等奠定基礎。?
發明內容
鑒于上述問題,本發明的主要目的在于提供一種首次從艾納香種獲得的內根-貝殼杉烯合酶基因。?
本發明的另一個目的是提供艾納香內根-貝殼杉烯合酶編碼的氨基酸序列及編碼蛋白質性質生物信息學預測。?
同時,本發明還提供該艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因的克隆方法。?
為了達到上述目的,本發明提供:?
本發明所提供的艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因,從艾納香(Blumea?balsamifera?DC)中克隆,命名為Bb-KS基因,核苷酸序列如SEQ?ID?NO:1。?
上述艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因編碼的蛋白質,命名為Bb-KS蛋白質,其氨基酸序列如SEQ?ID?NO:2。?
一種艾納香內根-貝殼杉烯合酶基因Bb-KS的克隆方法,包括如下步驟:?
(1)選用艾納香葉片作為試驗材料,采用TRNzol法提取總RNA;?
(2)采用TaKaRa公司生產的PrimeScriptTM?1st?Strand?cDNA?Synthesis?Kit進行反轉錄獲得cDNA;?
(3)根據NCBI上其他植物KS基因保守區域,設計兼并引物PF1:TGGTCR(A/G)TTTGATCR(A/G)TATK(T/G)CAATC和?
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