[發(fā)明專利]包括1014T>C突變的CYP2D6基因片段、所編碼的蛋白質(zhì)片段及其應(yīng)用

無效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 201310398162.0
• 申請(qǐng)日: 2013-09-04
• 公開（公告）號(hào): CN103614389A
• 公開（公告）日: 2014-03-05
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 蔡劍平;胡國新;戴大鵬;耿培武;蔡杰
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 蔡劍平
• 主分類號(hào): C12N15/53
• 分類號(hào): C12N15/53;C12N15/11;C12N9/02;C12Q1/68
• 代理公司: 北京邦信陽專利商標(biāo)代理有限公司 11012
• 代理人: 陳悅軍

1.核酸片段，所述核酸片段包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1014位的突變位點(diǎn)，且是SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列中的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸，其中第1014位的核苷酸是C；或者所述核酸片段包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.2的第311位的突變位點(diǎn)，且是SEQ?ID?NO.2所示的核苷酸序列中的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸，其中第311位的核苷酸是C；或者為上述核酸片段的反向互補(bǔ)序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的核酸片段，其特征在于，所述核酸片段的長度是10-100、101-200、201-500或501-1000個(gè)核苷酸；優(yōu)選地，所述核酸片段的長度是10-20、21-30、31-40、41-50、51-60、61-100或101-300個(gè)核苷酸；進(jìn)一步優(yōu)選地，所述核酸片段是SEQ?ID?NO.1、2或14-18所示的序列。

3.等位基因特異性寡核苷酸，所述寡核苷酸與含有對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1014位或?qū)?yīng)于SEQ?ID?NO.2的第311位的突變位點(diǎn)的等位基因片段或其反向互補(bǔ)序列全部或部分雜交，其中SEQ?ID?NO.1的第1014位或SEQ?ID?NO.2的第311位的突變位點(diǎn)的核苷酸是C；所述等位基因片段是SEQ?ID?NO.1或SEQ?ID?NO.2所示的核苷酸序列中的至少10個(gè)連續(xù)核苷酸或其反向互補(bǔ)序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的等位基因特異性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是探針或引物；優(yōu)選地，當(dāng)所述寡核苷酸是探針時(shí)，所述寡核苷酸的長度是5-100個(gè)核苷酸；當(dāng)所述寡核苷酸是引物時(shí)，所述寡核苷酸的長度是15-40個(gè)核苷酸；優(yōu)選地，當(dāng)所述寡核苷酸是探針時(shí)，所述突變位點(diǎn)位于探針序列的中心或大約中心處；當(dāng)所述寡核苷酸是引物時(shí)，所述突變位點(diǎn)位于引物的3’末端。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的等位基因特異性寡核苷酸，其特征在于，所述寡核苷酸是如SEQ?ID?NO.19-23所示的序列。

6.一種用于檢測和/或分析單堿基突變的試劑盒，包括根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的核酸片段或根據(jù)權(quán)利要求3-5任一項(xiàng)所述的等位基因特異性寡核苷酸，或包含能夠作為引物擴(kuò)增所述單堿基突變但不包含該單堿基的核酸片段；所述單堿基對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1014位或SEQ?ID?NO.2的第311位；優(yōu)選地，所述試劑盒包含SEQ?ID?NO.4和/或SEQ?ID?NO.5和/或SEQ?ID?NO.9所示的序列片段。

7.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的核酸片段或根據(jù)權(quán)利要求3-5任一項(xiàng)所述的等位基因特異性寡核苷酸在檢測CYP2D6基因突變中的應(yīng)用，其中所述核酸片段或寡核苷酸用作探針或引物；或者在制備檢測CYP2D6基因突變的藥物中的應(yīng)用；或者用作檢測CYP2D6基因突變的檢驗(yàn)標(biāo)志物的應(yīng)用。

8.一種用藥指導(dǎo)，包括檢測待測樣品中CYP2D6基因的對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的第1014位或SEQ?ID?NO.2的第311位的堿基，當(dāng)所述位點(diǎn)的堿基是C時(shí)，調(diào)整經(jīng)CYP2D6代謝的藥物的給藥量。

9.一種分析核酸的方法，所述方法包括分析待測樣品中的包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.1的序列的核酸中對(duì)應(yīng)于第1014位的核苷酸或分析待測樣品中的包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.2的序列的核酸中對(duì)應(yīng)于第311位的核苷酸；優(yōu)選地，所述方法是測序法、限制性片段長度多態(tài)性分析或探針雜交法。

10.CYP2D6蛋白或其片段或變異體，所述蛋白序列為SEQ?ID?NO.3所示的序列；所述片段或變異體包含對(duì)應(yīng)于SEQ?ID?NO.3的第104位的丙氨酸，且為SEQ?ID?NO.3所示的氨基酸序列的至少10個(gè)連續(xù)氨基酸。