[發明專利]檢測哺乳動物基因組三核苷酸重復序列的方法及其應用

在審

• 申請號: 201310390859.3
• 申請日: 2013-08-30
• 公開（公告）號: CN104419756A
• 公開（公告）日: 2015-03-18
• 發明（設計）人: 胡榮貴;徐星星;傅興;陳侃;于濤
• 申請（專利權）人: 中國科學院上海生命科學研究院
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C07K14/47;C12N15/12;C12N15/70;C12N1/21
• 代理公司: 上海專利商標事務所有限公司 31100
• 代理人: 韋東

1.一種基因組特殊序列測序或檢測基因組特殊序列的方法，該方法包括：

混合特殊序列結合物和含DNA的樣品，和

對富集的DNA或DNA片段進行測序分析。

2.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法包括：

（1）在適合所述特殊序列結合物與所述DNA結合的條件下孵育所述特殊序列結合物與DNA；

（2）分離出結合的特殊序列結合物-DNA；

（3）從步驟（2）獲得的特殊序列結合物-DNA分離純化得到DNA；和

（4）對步驟（3）分離純化得到的DNA進行測序。

3.如權利要求1或2所述的方法，其特征在于，該方法還包括，將測序信息與基因組信息匹配，獲得基因組特殊序列的位置信息。

4.如權利要求1－3中任一項所述的方法，其特征在于，所述特殊序列為三核苷酸重復序列。

5.如權利要求1－4中任一項所述的方法，其特征在于，所述特殊序列結合物包括鋅指蛋白或轉錄激活子樣效應因子。

6.如權利要求5所述的方法，其特征在于，所述鋅指蛋白是C₂H₂型鋅指蛋白。

7.一種檢測哺乳動物基因組三核苷酸重復序列的方法，所述方法包括：

混合鋅指蛋白和含DNA的樣品，和對富集的DNA或DNA片段進行測序分析，

從而檢測哺乳動物基因組中的三核苷酸重復序列。

8.如權利要求1－7中任一項所述的方法，其特征在于，所述三核苷酸重復序列選自(GCT)n、(CTG)n、(TGC)n、(AGC)n、(GCA)n、(CAG)n、(GGC)n、(GCG)n、(CGG)n、(GCC)n、(CCG)n、（CGC）n、(GAA)n、（AAG）n、（AGA）n、（TTC）n、（TCT）n和（CTT）n，其中，n≥3。

9.如權利要求5－8中任一項所述的方法，其特征在于，所述鋅指蛋白是C2H2型鋅指蛋白。

10.如權利要求5－9中任一項所述的方法，其特征在于，所述鋅指蛋白包括SEQ?ID?NO：1、2或3所示的氨基酸序列。

11.一種分離的多肽，其特征在于，所述多肽選自：

（1）SEQ?ID?NO：1、2或3所示的氨基酸序列；或

（2）在SEQ?ID?NO：1、2或3所示的氨基酸序列中經過一個或幾個氨基酸插入、缺失或突變而獲得的保留了SEQ?ID?NO：1、2或3的生物學活性的蛋白。

12.如權利要求11所示的多肽，其特征在于，所述插入、缺失或突變發生在SEQ?ID?NO：1、2和3的識別螺旋氨基酸殘基之外。

13.一種分離的多核苷酸，其特征在于，所述多核苷酸選自：

（1）編碼權利要求11或12所述的多肽的多核苷酸；和

（2）與（1）互補的多核苷酸。

14.如權利要求13所述的多核苷酸，其特征在于，所述多核苷酸選自：SEQ?IDNO:11、12和13。

15.一種多核苷酸構建物，其特征在于，所述多核苷酸構建物含有權利要求13或14所述的多核苷酸。

16.如權利要求15所述的多核苷酸構建物，其特征在于，所述多核苷酸構建物是一種表達載體。

17.一種細胞，其特征在于，所述細胞含有權利要求11或12所述的多肽，或權利要求13或14所述的多核苷酸，或權利要求15和16所述的多核苷酸構建物。

18.權利要求11或12所述的多肽，或權利要求13或14所述的多核苷酸，或權利要求15和16所述的多核苷酸構建物，或權利要求17所述的細胞在基因組三核苷酸重復序列測序或檢測基因組三核苷酸重復序列中的應用。

19.權利要求11或12所述的多肽，或權利要求13或14所述的多核苷酸，或權利要求15和16所述的多核苷酸構建物，或權利要求17所述的細胞在制備用于疾病的診斷和篩查的藥物或試劑中的用途。