[發(fā)明專利]一種抗菌肽及其制備方法與應用無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310386556.4 | 申請日: | 2013-08-30 |
| 公開(公告)號: | CN103436538A | 公開(公告)日: | 2013-12-11 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 茆振川;張文玥;凌鍵;陳國華;楊宇紅;謝丙炎 | 申請(專利權(quán))人: | 中國農(nóng)業(yè)科學院蔬菜花卉研究所 |
| 主分類號: | C12N15/29 | 分類號: | C12N15/29;C07K14/415;C12N15/70;A01N47/44;A01P5/00 |
| 代理公司: | 北京東正專利代理事務(wù)所(普通合伙) 11312 | 代理人: | 蔡仲德 |
| 地址: | 100081 北*** | 國省代碼: | 北京;11 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 抗菌 及其 制備 方法 應用 | ||
1.一種抗菌肽,其特征在于,該抗菌肽的基因序列為抗菌肽Snakin中無信號肽的基因編碼序列,該基因序列為:attcaaactg?atcatgttgc?cagcaatgct??atttctgaag??ctgcttattc??ctacaagaaa??atcgattgtg?ggggaaagtg??ttcagcgagg??tgccgattat??cgtcaaggcc??aagattgtgt?aagagggcat??gtggaacttg??ctgtgctaga??tgcaactgtg??ttcctcctgg?cacttctggc??aacactcaga??cttgcccttg??ctatgccaat??atgactactc?acggcaacag??acgcaaatgc??ccttaa。?
2.一種制備權(quán)利要求1所述抗菌肽的方法,其特征在于,該方法包括如下步驟,(1)采用trizol方法提取辣椒葉片組織的總RNA,并采用反轉(zhuǎn)錄酶獲得第一鏈cDNA備用;?
(2)根據(jù)已知抗菌肽Snakin基因的序列,設(shè)計上游引物、下游引物,以第一鏈cDNA為模板,經(jīng)過PCR技術(shù)克隆得到抗菌肽Snakin中無信號肽的基因編碼序列,并進行測序得到全長的基因序列,記為Sn基因序列;所述上游引物序列為5′ATT?CAA?ACT?GAT?CAT?GTT?GC3′,下游引物序列為5′TTA?AGG?GCA?TTT?GCG?TCT3′;?
(3)將(2)步得到的Sn基因序列克隆到原核表達載體pET28a(+)形成重組質(zhì)粒;?
(4)再將(3)步得到的全部重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到DH5α細菌感受態(tài)細胞中,從中篩選出重組成功的質(zhì)粒,記為pET-Sn;?
(5)將上步重組成功的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細胞中,并采用IPTG進行誘導表達,使感受態(tài)細胞表達出抗菌肽,記為抗菌肽Sn,同時分泌出蛋白質(zhì);?
(6)對(5)步分泌出蛋白的感受態(tài)細胞進行超聲波破碎,離心后收集上清液中的抗菌肽。?
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述制備抗菌肽的方法,其特征在于,所述步驟(2)的具體操作方法為:①根據(jù)已經(jīng)發(fā)表的馬鈴薯及擬南芥中的snakin家族基因序列,經(jīng)過生物信息學軟件分析出共同的保守區(qū)域,設(shè)計出上?游引物序列為5′ATT?CAA?ACT?GAT?CAT?GTT?GC3′、下游引物序列為5′TTA?AGG?GCA?TTT?GCG?TCT3′;?
②以第一鏈cDNA為模板,經(jīng)過PCR技術(shù)克隆得到抗菌肽Snakin中無信號肽的基因編碼序列,PCR技術(shù)所使用的試劑盒,其成份包括:?
PCR擴增反應程序為,94℃預變性5min;94℃變性40?sec;63℃退火30?sec;72℃延伸1?min;35次循環(huán),72℃延伸10?min;?
③對得到的PCR產(chǎn)物經(jīng)過切膠回收,進行測序分析,確定出抗菌肽Snakin中無信號肽的基因編碼序列的全長序列,記為Sn基因序列,并推測獲得相應的氨基酸序列。?
4.根據(jù)權(quán)利要求2所述制備抗菌肽的方法,其特征在于,所述步驟(3)得到重組質(zhì)粒的具體操作方法為,①提取原核表達載體pET-28a(+)的質(zhì)粒,并采用Eag?I和BamHI對質(zhì)粒進行雙酶切處理,同時將抗菌肽Snakin中的Sn基因序列采用相同的酶酶切下來,在37℃酶切4小時,然后通過瓊脂糖凝膠電泳將切下的質(zhì)粒與Sn基因序列條帶切膠回收,酶切質(zhì)粒的試劑包括:?
酶切Sn基因的試劑包括:?
②將酶切后的Sn基因與質(zhì)粒進行連接得到重組質(zhì)粒,在16℃反應過夜,連接所使用的試劑包括如下成份:?
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