[發(fā)明專利]一種免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法及試劑盒有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310375667.5 | 申請日: | 2013-08-23 |
| 公開(公告)號: | CN103436526A | 公開(公告)日: | 2013-12-11 |
| 發(fā)明(設計)人: | 岳巧云;胡佳;邱德義;陳健;劉德星;魏曉雅;吳可量;劉國雄 | 申請(專利權)人: | 岳巧云 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 廣州科粵專利商標代理有限公司 44001 | 代理人: | 劉明星 |
| 地址: | 528403 廣東省中山市中*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 提取 直接 擴增 極微 樣品 dna 條形碼 方法 試劑盒 | ||
1.一種免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)、DNA模板的制備:取一只極微小動物個體或動物個體的部分組織,加入裂解液,研磨,95℃放置10min,4000rpm短暫離心5s,然后加入緩沖液,所加入的緩沖液與裂解液的體積比為0~9:1,95℃放置10min,12000rpm離心1min,棄沉淀,所得的上清液即為極微量樣品的DNA溶液;所述裂解液為10~100mM的NaOH溶液,所述緩沖液,其成分及制備方法為:100mM?Tris,1M?KCl,10mM?EDTA,調pH為9.5,高壓滅菌;
(2)、DNA條形碼序列的擴增:以步驟(1)的極微量樣品的DNA溶液為模板,采用正向引物LCO1490:5’-GGTCAACAAATCATAAAGATATTGG-3’和反向引物HCO2198:5’-TAAACTTCAGGGTGACCAAAAAATCA-3’進行PCR擴增,即得到極微量樣品的DNA條形碼序列。
2.根據權利要求1所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,所述的動物個體的部分組織,重量為10μg。
3.根據權利要求1所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,所述的裂解液為50mM的NaOH溶液。
4.根據權利要求1所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,所述的緩沖液與裂解液的體積比為1:9。
5.根據權利要求1所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,所述的步驟(2)的PCR擴增,其擴增反應體系為:2×KOD?FX?DNA聚合酶buffer25μl,2mM?dNTP10μl,KOD?FX?DNA聚合酶1μl,20mM正向引物LCO1490和20mM反向引物HCO2198各1μl,DNA模板2μl,加ddH2O補足至50μl。
6.根據權利要求1所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,所述的步驟(2)的PCR擴增,其擴增反應條件為:95℃3min;98℃10s,50℃30s,68℃1min,35個循環(huán);68℃7min。
7.根據權利要求1所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的方法,其特征在于,所述的極微量樣品為螨、蚤、蜱的單個個體或蠅的部分組織。
8.一種免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的試劑盒,包括裂解液、緩沖液、DNA聚合酶buffer、正向引物LCO1490、反向引物HCO2198、dNTP、KOD?FX?DNA聚合酶,其特征在于,所述的裂解液為10~100mM的NaOH溶液,所述的緩沖液其成分及制備方法為:100mM?Tris,1M?KCl,10mM?EDTA,調pH為9.5,高壓滅菌。
9.根據權利要求8所述的免提取直接擴增極微量樣品DNA條形碼的試劑盒,其特征在于,所述的裂解液為50mM的NaOH溶液。
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