[發明專利]嗜水氣單胞菌適體及其篩選方法與應用有效
申請號: | 201310363780.1 | 申請日: | 2012-01-05 |
公開(公告)號: | CN103468684A | 公開(公告)日: | 2013-12-25 |
發明(設計)人: | 李元躍;王雷;段博文;陳融斌;黎中寶 | 申請(專利權)人: | 集美大學 |
主分類號: | C12N15/115 | 分類號: | C12N15/115;C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/01 |
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摘要: | |||
搜索關鍵詞: | 水氣 單胞菌適體 及其 篩選 方法 應用 | ||
技術領域
本發明涉及水產養殖中常見的致病病原菌——嗜水氣單胞菌,特別涉及嗜水氣單胞菌適體及其篩選方法與應用。
背景技術
嗜水氣單胞菌(Aeromonas?hydrophila)在自然界分布廣泛,是多種水生動物的原發性致病菌,可產生多種致病因子,對水產動物,畜禽和人類均有致病性,可引起多種動物的敗血癥和人類腹瀉,給人類健康帶來了威脅,同時也給養殖業造成較大的經濟損失(1.張翠娟,于宙亮,趙寶華,何宏軒.嗜水氣單胞菌研究進展[J].中國獸醫雜志,2008,42(7):46-50.)。因此,對于作為水源污染指示菌的嗜水氣單胞菌污染,其檢測力度仍需進一步加強。目前嗜水氣單胞菌的檢測一直是個棘手的問題,傳統的化學病理檢測過程繁瑣,耗費時間;酶聯免疫、多重PCR技術則成本過高(2.王利.魚類嗜水氣單胞菌的幾種檢測方法[J].內陸水產,2006,(2):22-23.)。因此,開發一種操作簡便,成本低廉,快速方便的嗜水氣單胞菌檢測方法,成為本領域技術人員迫切需要解決的技術難題。
SELEX(?Systematic?Evolution?of?Ligands?by?Exponential?Enrichment)即指數富集配體系統進化技術,是1990年由美國的Tuerk和Gold創建的一種體外合成篩選寡核苷酸適體的化學組合技術(3.孟慶玲,陳創夫.SELEX技術及其應用前景[J].塔里木大學學報,2008,20(3):44-48.?4.廖世奇,劉巍,王黎.SELEX技術應用研究進展[J].甘肅醫藥,2009,(02):96-97.)。由于適體具有特異性高、庫容量大、合成時間短(5.王聰艷,孫偉,李建國,等.SELEX技術應用研究進展[J].生物技術通報?,2006,(S1):232-236.)等優點,?SELEX技術現在廣泛應用在疾病防控、藥物篩選、臨床診斷等不同的技術領域,隨著技術的不斷創新與發展,逐漸產生了一些新的SELEX篩選方法,如導向SELEX技術、復合靶分子SELEX技術、基因組SELEX技術等新的研究手段(6.孟慶玲,陳創夫.SELEX技術及其應用前景[J].塔里木大學學報,2008,20(3):44-48.)。
發明內容
本發明的第一目的在于提供嗜水氣單胞菌適體。
本發明的第二目的在于提供所述嗜水氣單胞菌適體的篩選方法。
本發明的第三目的在于提供所述嗜水氣單胞菌適體在檢測述嗜水氣單胞菌中的應用。
所述嗜水氣單胞菌適體的核酸序列如序列表中1-22號中的序列所示。
所述嗜水氣單胞菌適體的篩選方法是將指數富集配體系統進化技術(即SELEX?篩選)應用于嗜水氣單胞菌適體的篩選,所述SELEX?篩選的具體步驟包括:
1)?構建并合成待篩選的嗜水氣單胞菌適體ssDNA文庫,并設計合成相應的引物;
2)?取適量所述ssDNA文庫與嗜水氣單胞菌進行結合;
3)??分離獲得與嗜水氣單胞菌結合的ssDNA,以該ssDNA為模板進行PCT擴增,擴增產物再次進行SELEX?篩選直至獲得相應適體。
在步驟1)中,所述ssDNA文庫可為::5′-GGG?AGC?TCA?GAA?TAA?ACG?CTC?AA-N35-TT?CGA?CAT?GAG?GCC?CGG?ATC-3′。
所述引物可為:
引物Ⅰ:5′-GGG?AGC?TCA?GAA?TAA?ACG?CTC?AA-3′;
引物Ⅱ:5′-GAT?CCG?GGC?CTC?ATG?TCG?AA-3′;
引物Ⅲ:5′-地高辛-GGG?AGC?TCA?GAA?TAA?ACG?CTC?AA-3′;
引物Ⅳ:5′-生物素-GAT?CCG?GGC?CTC?ATG?TCG?AA-3′。
在步驟3)中,所述SELEX?篩選共進行12輪。
本發明采用SELEX技術篩選出致病性嗜水氣單胞菌的高親和力寡核苷酸適體,所述適體為嗜水氣單胞菌的快速檢測技術的開發以及在水產病害控制方面的應用提供參考,可廣泛應用于嗜水氣單胞菌的檢測與分析。
附圖說明
圖1為?PCR產物3%瓊脂糖凝膠電泳圖。在圖1中,M為50bp?DNA?marker,1、3、5、7、9、11、12分別表示第1、3、5、7、9、11、12輪的PCR產物。
圖2為適體與嗜水氣單胞菌結合的吸光度。在圖2中,橫坐標為篩選輪數,縱坐標為A450nm時的吸光度。
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