[發明專利]用于人乳頭瘤病毒16基因檢測的生物試劑有效
| 申請號: | 201310294133.X | 申請日: | 2013-07-12 |
| 公開(公告)號: | CN103540682A | 公開(公告)日: | 2014-01-29 |
| 發明(設計)人: | 鐘建;方平科 | 申請(專利權)人: | 鐘建 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 北京攀騰專利代理事務所(普通合伙) 11374 | 代理人: | 彭蓉 |
| 地址: | 美國麻*** | 國省代碼: | 美國;US |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 乳頭 病毒 16 基因 檢測 生物 試劑 | ||
1.一種用于人乳頭瘤病毒16(HPV16)基因檢測的試劑盒,其包括DNA提取液,HPV16PCR反應液,HPV16強陽性質控品和陰性質控品,其中:
所述HPV16PCR反應液包括超純水,緩沖液,dNTP,引物16F1和16R1,以及探針16P1;
所述引物16F1的序列為TCCTGTCCCAGTATCTAAGGTTGTAA,所述引物16R1的序列為TGTCCAACTGCAAGTAGTCTGGAT,所述探針16P1的序列為FAM-CACGGATGAATATGTTGCAC-MGB?NFQ。
2.根據權利要求1所述的試劑盒,其中所述試劑盒包括:DNA提取液2管;HPV16PCR反應液20管;HPV16強陽性質控品1管;陰性質控品1管。
3.根據權利要求2所述的試劑盒,其中所述試劑盒包括:DNA提取液2管,500μl/管;HPV16PCR反應液20管,19μl/管;HPV16強陽性質控品1管,200μl/管;陰性質控品1管,150μl/管;其中,所述HPV16PCR反應液包括超純水14.3μl,10×buffer緩沖液2μl,d?NTP0.4μl,引物16F10.4μl,16R10.4μl,探針16P10.4μl。
4.根據權利要求1所述的試劑盒,其中所述引物是由包括CPG、四氮唑、乙酸酐和1-甲基咪唑、碘、dNTP的原料合成,并且根據HPV的不同分型而設計。
5.用于制備權利要求1所述的試劑盒的方法,其包括下述步驟:
1)確定待測基因片段:根據科技文獻的方向性報道初步選定候選基因片斷,然后經研發過程中與待檢樣本病理相關性的比較,最終確認與臨床疾病最具相關性的待測基因片斷;
2)根據所述待測基因片段設計并生產引物和探針,采用多核苷酸合成儀生產所述引物;
3)提取細胞基因組DNA:用DNA提取液提取病人基因組及對照組基因組DNA;
4)確定PCR擴增條件,其包括酶、探針、引物、基因組DNA用量及PCR的擴增條件:不同組合的引物片斷,根據實驗結果的特異性,敏感性等技術特征,反復試驗,同時進行多條所述待測基因片斷的檢測反應,最終確定包括所述引物、探針最佳濃度及酶的最佳反應條件,其中,PCR基因擴增的結果由熒光PCR儀來檢測;
5)進行重復性檢測以進一步確定反應條件:通過大量實驗,反復比較實驗結果中包括清晰度和靈敏性的因素,最終確定反應條件;
6)根據最終確定的所述反應條件,制備試劑盒,其組分包括:引物、探針、dNTP、10×buffer緩沖液、Taq聚合酶、試驗標準品、陰性質控品和超純水。
6.采用權利要求1所述的試劑盒進行HPV基因檢測的方法,其包括:
以用基因組提取試劑盒提取的患者的細胞基因組DNA為模板,用試劑盒提供的引物、探針、dNTP、酶、試劑標準品等組分,20μL反應體系,按照特定的比例分別加入;
采用PCR基因擴增技術,進行PCR反應,實現對HPV的基因檢測;
PCR結束后,采用瓊脂糖專用電泳儀進行電泳、EB染色、成像并進行基因分型,從而實現對HPV的基因檢測。
7.根據權利要求6所述的檢測方法,其中所述PCR反應進一步包括:
在0.2mL的PCR管里面,加入患者模板(50ng/μl),瞬時離心混勻后放入PCR儀中,在設定的PCR反應體系和擴增程序條件下獲得針對正常對照組和感染HPV16基因擴增的對照結果。
8.根據權利要求7所述的檢測方法,其中所述PCR反應體系和反應條件包括:
PCR反應體系(20μl),包括:HPV16PCR反應液18μl,模板2μl;其中PCR反應液的配置:超純水14.3μl,10×buffer2μl,d?NTP0.4μl,引物16F10.4μl,16R10.4μl,探針16P10.4μl;
擴增程序,包括:60°C30s→95°C2min→95°C15s→60°C1min(共40個循環)。
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