[發明專利]用于GROMACS計算程序的處理方法

在審

• 申請號: 201310263793.1
• 申請日: 2013-06-27
• 公開（公告）號: CN103294483A
• 公開（公告）日: 2013-09-11
• 發明（設計）人: 田相桂;馬少杰;李斌;楊亮;何滄平;姜金良;沈杰;易成;范娟;曹征;苗春葆;侯雪峰;趙明坤
• 申請（專利權）人: 曙光信息產業（北京）有限公司
• 主分類號: G06F9/44
• 分類號: G06F9/44
• 代理公司: 北京德恒律治知識產權代理有限公司 11409
• 代理人: 章社杲;孫征

1.一種用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，包括：

根據應用類型選擇與所述應用類型相對應的應用配置文件；

利用所述應用配置文件和集群系統的可用資源顯示web界面，并通過所述web界面接收多個參數；以及

根據包括所述多個參數的所述web界面生成作業任務并將所述作業任務提交給所述集群系統。

2.根據權利要求1所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，利用所述應用配置文件和集群系統的可用資源顯示web界面進一步包括：

利用所述應用配置文件和所述集群系統的所述可用資源配置web頁面信息并將所述web頁面信息提供給頁面生成器；

根據接收到的所述web頁面信息配置所述web界面上的功能模塊；以及

顯示具有所述功能模塊的所述web界面。

3.根據權利要求1所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，根據包括所述多個參數的所述web界面生成作業任務并將所述作業任務提交給所述集群系統進一步包括：

從所述web界面中提取所述多個參數并根據所述多個參數收集所述多個參數的提交信息；

利用所述提交信息生成所述作業任務的腳本程序；

將所述作業任務的腳本程序提交到所述集群系統的隊列中；以及

由所述集群系統的作業調度模塊接收所述作業任務的腳本程序并返回作業號。

4.根據權利要求3所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，所述多個參數包括輸入文件目錄、所述GROMACS計算程序的路徑、申請的計算資源和網絡協議。

5.根據權利要求4所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，進一步包括：對所述提交信息進行檢查，并且當所述提交信息不正確時，顯示錯誤提示信息。

6.根據權利要求5所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，根據所述多個參數收集所述多個參數的提交信息進一步包括：根據所述輸入文件目錄獲取輸入文件作為部分所述提交信息，其中，預先建立用于所述GROMACS計算程序的數學模型，并且將所述數學模型作為所述輸入文件。

7.根據權利要求6所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，對所述輸入文件進行檢查，并且當所述輸入文件的格式不正確時，通過文本框或者突出顯示的形式顯示所述錯誤提示信息。

8.根據權利要求1所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，

在根據應用類型選擇與所述應用類型相對應的所述應用配置文件之前，檢查所述集群系統的可用資源，所述可用資源包括：可用節點數、單個節點的CPU核心數、隊列名、所述集群系統的隊列中的任務數量。

9.根據權利要求3所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，在所述GROMACS計算完成以后，將計算結果存儲在所述集群系統的全局共享存儲區中。

10.根據權利要求9所述的用于GROMACS計算程序的處理方法，其特征在于，進一步包括：根據所述作業號，從所述全局共享存儲區中下載所述計算結果并查看所述計算結果。