[發明專利]水稻白葉枯病菌中的酸性還原酮加雙氧酶的鑒定方法有效
| 申請號: | 201310207831.1 | 申請日: | 2013-05-29 |
| 公開(公告)號: | CN103276049A | 公開(公告)日: | 2013-09-04 |
| 發明(設計)人: | 夏更壽 | 申請(專利權)人: | 麗水學院 |
| 主分類號: | C12Q1/26 | 分類號: | C12Q1/26;C12Q1/02;C12N15/70;C12N1/21;C12R1/19;C12R1/64 |
| 代理公司: | 浙江永鼎律師事務所 33233 | 代理人: | 陸永強 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 水稻 白葉枯 病菌 中的 酸性 還原 酮加雙氧酶 鑒定 方法 | ||
技術領域
本發明屬于分子生物學技術領域,涉及一種水稻白葉枯病菌中的酸性還原酮加雙氧酶的鑒定方法。
背景技術
甲硫氨酸急救途徑(the?methionine?salvage?pathway,MSP)廣泛存在于真核和原核生物中錯誤!未找到引用源。。酸性還原酮加雙氧酶(E2)催化很多原核和真核生物中的甲硫氨酸急救途徑(MSP)倒數第二步。目前研究該酶的代表性生物主要是酵母,但很多物種中該酶并沒有被鑒定和驗證。
MSP是甲硫氨酸再循環途徑,調節一些重要代謝物,其中包括S-腺苷酰甲硫氨酸(S-adenosylmethionine,簡稱SAM或AdoMet)和甲硫基腺苷(methylthioadenosine,簡稱MTA)。SAM由甲硫氨酸合成,提供不同的基團生成其它代謝產物,調節甲基化或者基因表達錯誤!未找到引用源。。SAM合成多氨過程中生成MTA,MTA是多氨合成和轉甲基反應的抑制子錯誤!未找到引用源。。多氨是細胞生長和增殖所必需的錯誤!未找到引用源。。因此,細胞內MTA濃度必須得通過MSP嚴格控制。
酸性還原酮加雙氧酶(ARD)催化MSP倒數第二步錯誤!未找到引用源。??死撞暇鷮伲↘lebsiella)菌株8724中一種形式的酸性還原酮加雙氧酶(FeARD′)含有一個二價鐵離子(Fe2+),轉變1,2-二羥基-3-酮-5-甲硫基-1-戊烯
(1,2-dihydroxy-3-oxo-5-(methylthio)pent-1-ene,酸性還原酮)生成甲酸鹽和2-酮-4-甲硫基丁酸鹽(2-keto-4-methylthiobutyrate,KMTB)。KMTB是MSP中甲硫氨酸的前體。8724菌株中另一種形式的酸性還原酮加雙氧酶(NiARD)含有一個二價鎳離子Ni2+,催化與FeARD′相同底物的氧化支路生成一氧化碳、甲酸鹽和甲硫基丙酮酸鹽(methylthiopropionate)錯誤!未找到引用源。。這兩種形式的酶多肽序列相同,且都是稱為cupins的結構超家族成員錯誤!未找到引用源。,唯一的不同之處是含有不一樣的金屬離子錯誤!未找到引用源。。FeARD′和NiARD中與鐵離子和鎳離子作用的四個殘基也相同,分別是His96,His98,Glu102和His140錯誤!未找到引用源。。NiARD催化的反應生成產物之前形成一個四個原子的過氧化物環,而FeARD′催化的反應生成產物前形成一個五個原子的過氧化物環錯誤!未找到引用源。。這兩個酶的活性在枯草芽孢桿菌(Bacillus?subtilis)中都已被證實錯誤!未找到引用源。。
真核生物ARD的同源物表現出除ARD活性以外許多不同的作用錯誤!未找到引用源。。人類的ARD同源物——MTCBP1(membrane-type1matrix?metalloproteinase?cytoplasmic?tail?binding?protein-1,也被稱為hADI1),在酵母中被證實有ARD活性錯誤!未找到引用源。。過表達MTCBP1抑制由MT1-MMP(membrane-type1?matrix?metalloproteinase)促進的細胞移動和侵入錯誤!未找到引用源。。老鼠中ARD同源物——ALP1(ARD-like?protein1),有促進凋亡的活性并且被雄性荷爾蒙強烈誘導錯誤!未找到引用源。。MTCBP1和ALP1分別在人腫瘤細胞和鼠前列腺腫瘤細胞中表達下調錯誤!未找到引用源。。hADI1很可能在信使RNA(mRNA)加工過程中起作用錯誤!未找到引用源。。
水稻白葉枯病菌Xanthomonas?oryzae?pv.oryzae(Xoo)推測的MSP中已經鑒定了稀醇化酶-磷酸酯酶xep(Xanthomonas?enolase-phosphatase)基因錯誤!未找到引用源。。但Xoo推測的MSP中其它基因的功能還沒有被證實,這些基因對Xoo在水稻上致病性有沒有影響,影響程度有多大均不明確。
發明內容
本發明的目的是,提供了一種水稻白葉枯病菌中的酸性還原酮加雙氧酶的鑒定方法,用于克隆和鑒定水稻白葉枯病菌(Xanthomonas?oryzae?pv.Oryzae)中的酸性還原酮加雙氧酶E2,填補了水稻白葉枯病菌甲硫氨酸急救途徑中所涉及的酶的一個空白。
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