[發明專利]用于Smad3靶基因相關miRNA的回收和鑒定的探針、試劑盒和方法有效
| 申請號: | 201310202597.3 | 申請日: | 2013-05-27 |
| 公開(公告)號: | CN103320432A | 公開(公告)日: | 2013-09-25 |
| 發明(設計)人: | 蘇小平;曹雪濤 | 申請(專利權)人: | 中國人民解放軍第二軍醫大學 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海專利商標事務所有限公司 31100 | 代理人: | 陶家蓉 |
| 地址: | 200433 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 smad3 基因 相關 mirna 回收 鑒定 探針 試劑盒 方法 | ||
1.一種核酸探針,其特征在于,其核苷酸序列是SEQ?ID?NO:26。
2.一種包含權利要求1所述的核酸探針的用于分離和/或鑒定miRNA的試劑盒或套盒,其中所述miRNA能與細胞中特定的靶基因mRNA特異性結合,所述靶基因是Smad3基因,所述試劑盒或套盒中還包含:
(i)細胞交聯試劑;
(ii)RNA提取試劑;
(iii)解交聯劑;
(iv)核酸探針偶聯物回收試劑;
(v)miRNA分離和/或鑒定試劑。
3.一種從細胞中回收和/或鑒定miRNA,用于靶基因mRNA的檢測的方法,所述靶基因是Smad3基因mRNA,其中所述miRNA能與細胞中所述靶基因mRNA特異性結合,其特征在于,所述方法包括:
(a)使得權利要求1所述的核酸探針進入細胞并與所述靶基因mRNA結合;
(b)對所述細胞進行交聯,以使得連接有所述核酸探針的所述靶基因mRNA和與之特異性結合的miRNA保持結合狀態;
(c)從所述細胞中回收核酸探針-靶基因mRNA結合物、核酸探針-靶基因mRNA-miRNA結合物;
(d)對步驟(c)的回收產物進行解交聯;
(e)分離和/或鑒定與所述靶基因mRNA特異性結合的miRNA。
4.如權利要求3所述的方法,其特征在于,所述核酸探針進入細胞是通過電刺激、化學方法或機械方法實現的,優選化學刺激法、脂質體介導法、電擊法、電穿孔、激光致孔或DEAE一葡聚糖介導,更優選脂質體介導法。
5.如權利要求3所述的方法,其特征在于,所述交聯的方式選自:紫外線交聯、多聚甲醛交聯或它們的組合,優選多聚甲醛交聯。
6.如權利要求3所述的方法,在步驟(b)和(c)之間還包括破碎細胞。
7.如權利要求6所述的方法,其特征在于,所述破碎細胞是通過選自下組的方式進行的:用細胞裂解液裂解、超聲波破碎、研磨破碎,優選超聲波破碎方式。
8.如權利要求3所述的方法,其特征在于,步驟(c)中的所述回收是通過親和吸附或親和層析進行的,所用載體選自:交聯瓊脂糖凝膠、交聯磁珠,優選交聯磁珠。
9.如權利要求3所述的方法,其特征在于,所述解交聯是通過選自下組的一種或多種方式進行的:用蛋白酶K處理、30~90℃處理、或它們的組合,優選65℃處理。
10.如權利要求3所述的方法,其特征在于,所述miRNA的分離和/或鑒定采用選自下組中的一種或多種方式進行:miRNA芯片檢測、miRNA定量PCR檢測、miRNA定量PCR芯片檢測或miRNA大規模測序,優選miRNA定量PCR芯片檢測。
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