[發明專利]SACS基因突變體及其應用

有效

• 申請號: 201310188366.1
• 申請日: 2013-05-20
• 公開（公告）號: CN104178486B
• 公開（公告）日: 2017-12-15
• 發明（設計）人: 沈璐;詹自雄;王俊嶺;唐北沙;戴梅枝;管李萍;王俊
• 申請（專利權）人: 中南大學湘雅醫院;深圳華大基因股份有限公司
• 主分類號: C12N15/12
• 分類號: C12N15/12;C12N15/63;C12N1/21;C12N5/10;C12Q1/68;C12M1/34;C07K14/47
• 代理公司: 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙)11201
• 代理人: 李志東

技術領域

本發明涉及SACS基因突變體及其應用。具體地，本發明涉及分離的核酸、分離的多肽、篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的方法、篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的系統以及用于篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的試劑盒。

背景技術

遺傳性痙攣性共濟失調（spastic ataxia of the Charlevoix-Saguenay type，SACS）是一種罕見的常染色體隱性遺傳的神經退行性疾病，以進行性小腦功能障礙，伴反射亢進痙攣狀態的錐體束征及伴肌萎縮的感覺運動性周圍神經病為臨床表現。SACS病多在1-5歲發病，最初臨床表現為行走能力較同齡兒童推遲，步態不穩和頻繁跌倒，在發病早中期，構音障礙和痙攣性截癱是其主要的臨床表現，隨著病情的發展，下肢的周圍神經病變逐漸明顯，錐體束征逐漸被日益嚴重的周圍神經病變所掩蓋，在疾病的后期常可看到遠端肌萎縮、弓形足和槌狀趾，而下肢的病理征甚至會被這些癥狀所掩蓋，部分患者可伴發有輕度的智力發育障礙或精神行為異常。病情進展相對緩慢，在發病30-40年后，多數患者需要做輪椅。頭顱MRI可顯示小腦蚓部萎縮，神經電圖和神經活檢顯示嚴重的軸性神經病變伴隨輕度的脫髓鞘，感覺神經纖維往往較運動神經纖維損傷嚴重，肌肉活檢常可看到組織總線粒體DNA的缺失。

現階段，尋找致病基因對疾病診斷或治療意義重大。目前已知SACS為痙攣性共濟失調病的致病相關基因，且已發現多個致病基因位點，但仍存在著相當一部分未知致病基因位點。

因而，目前對痙攣性共濟失調病的研究仍有待深入。

發明內容

本發明旨在至少解決現有技術中存在的技術問題之一。為此，本發明的一個目的在于提出一種能夠有效篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的方法。

本發明是基于發明人的下列工作而完成的：發明人通過高通量外顯子組測序聯合候選基因突變驗證的方法確定了痙攣性共濟失調病的致病基因上的新突變。

根據本發明的第一方面，本發明提出了一種分離的核酸。根據本發明的實施例，與SEQ ID NO：1相比，該核酸具有c.1229delT突變，或者c.5840C>G突變。根據本發明的實施例，發明人確定了SACS基因突變體，這些新突變體與痙攣性共濟失調病的發病密切相關，從而通過檢測這些新突變體在生物樣品中是否同時存在，可以有效地檢測生物樣品是否易感痙攣性共濟失調病。

根據本發明的第二方面，本發明提出了一種分離的多肽。根據本發明的實施例，與SEQ ID NO：2相比，該分離的多肽具有p.Leu410X突變，或者p.Pro1947Arg突變。通過檢測生物樣品中是否同時表達上述多肽，可以有效地檢測生物樣品是否易感痙攣性共濟失調病。

根據本發明的第三方面，本發明提出了一種篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的方法。根據本發明的實施例，該方法包括以下步驟：從生物樣品提取核酸樣本；確定所述核酸樣本的核酸序列；所述核酸樣本的核酸序列或其互補序列，與SEQ ID NO：1相比具有c.1229delT和c.5840C>G的復合雜合突變，是所述生物樣品易感痙攣性共濟失調病的指示。通過根據本發明實施例的篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的方法，可以有效地篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品。

根據本發明的第四方面，本發明提出了一種篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的系統。根據本發明的實施例，該系統包括：核酸提取裝置，所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本；核酸序列確定裝置，所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連，用于對所述核酸樣本進行分析，以便確定所述核酸樣本的核酸序列；判斷裝置，所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連，以便基于所述核酸樣本的核酸序列或其互補序列，與SEQ ID NO：1相比具有c.1229delT和c.5840C>G的復合雜合突變，判斷所述生物樣品是否易感痙攣性共濟失調病。利用該系統，能夠有效地實施前述篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品的方法，從而可以有效地篩選易感痙攣性共濟失調病的生物樣品。