[發明專利]禽流感病毒H7型RT-PCR檢測試劑盒及檢測方法無效
| 申請號: | 201310175739.1 | 申請日: | 2013-05-10 |
| 公開(公告)號: | CN103276108A | 公開(公告)日: | 2013-09-04 |
| 發明(設計)人: | 夏時暢;張嚴峻;李輝 | 申請(專利權)人: | 浙江省疾病預防控制中心 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司: | 杭州九洲專利事務所有限公司 33101 | 代理人: | 王洪新 |
| 地址: | 310051 浙*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 禽流感 病毒 h7 rt pcr 檢測 試劑盒 方法 | ||
技術領域
本發明涉及禽流感病毒H7型核酸熒光定量RT-PCR檢測試劑盒及檢測方法,可應用于禽流感病毒H7型引起暴發疫情的實驗室應急檢測。
背景技術
禽流感病毒屬正粘病毒科甲型流感病毒屬。禽甲型流感病毒顆粒呈多形性,其中球形直徑80~120nm,有囊膜。基因組為分節段單股負鏈RNA。依據其外膜血凝素(H)和神經氨酸酶(N)蛋白抗原性不同,目前可分為16個H亞型(H1~H16)和9個N亞型(N1~N9)。禽甲型流感病毒除感染禽外,還可感染人、豬、馬、水貂和海洋哺乳動物。以往研究發現可感染人的禽流感病毒亞型為H5N1、H9N2、H7N7、H7N2、H7N3。目前,全球首次發現人感染H7N9禽流感病毒。人感染H7N9禽流感是由H7N9亞型禽流感病毒引起的急性呼吸道傳染病。據報道,自2013年2月以來,我國上海市、安徽省、江蘇省先后發生不明原因重癥肺炎病例,其中確診人感染H7N9禽流感3例,2例死亡。3例均為散發病例,目前尚未發現3例病例間有流行病學關聯。此次報道的為人感染H7N9禽流感病毒。該病毒為新型重配病毒,其內部基因來自于H9N2禽流感病毒。
流行病學調查顯示H9N2禽流感病毒的傳染源目前尚不明確,根據以往經驗及本次病例流行病學調查,推測可能為攜帶H7N9禽流感病毒的禽類及其分泌物或排泄物。H7N9禽流感病毒經呼吸道傳播,也可通過密切接觸感染的禽類分泌物或排泄物等被感染,直接接觸病毒也可被感染,現尚無人與人之間傳播的確切證據。根據流感的潛伏期及現有H7N9禽流感病毒感染病例的調查結果,潛伏期一般為7天以內。患者一般表現為流感樣癥狀,如發熱,咳嗽,少痰,可伴有頭痛、肌肉酸痛和全身不適。重癥患者病情發展迅速,表現為重癥肺炎,體溫大多持續在39℃以上,出現呼吸困難,可伴有咯血痰;可快速進展出現急性呼吸窘迫綜合征、縱隔氣腫、膿毒癥、休克、意識障礙及急性腎損傷等。
根據流行病學調查結果發現,H7N9禽流感病毒感染致死率較高,且暫時并沒有相應的保護性疫苗可供使用。因此,疾病防控機構強烈需要快速、有效的H7N9禽流感病毒檢測方法來加強對禽流感感染疑似病例及相關禽類中的H7N9禽流感病毒檢測,從而提高我們對H7N9禽流感病毒感染的防制能力。目前,實驗室病原學檢測方法主要是病毒分離:從患者呼吸道標本中分離H7N9禽流感病毒。上述檢測方法的不足是檢測速度尚不能滿足要求(通常需要5天左右);而且操作比較復雜。
發明內容
本發明的目的是提供一種禽流感病毒H7型的熒光定量RT-PCR檢測試劑盒,該檢測試劑盒應具有使用方便、檢測準確的特點。
本發明的另一目的是提供一種禽流感病毒H7型的熒光定量RT-PCR檢測方法,該方法應具有檢測準確性高、檢測簡單方便的特點。
本發明采用的技術方案是:
禽流感病毒H7型熒光定量RT-PCR檢測試劑盒,包括脫氧三磷酸核苷、MgCl2、RT-PCR緩沖液、禽流感病毒H7基因標準品、RNA酶抑制劑、MMLV逆轉錄酶以及DNA聚合酶;其特征在于所述熒光定量RT-PCR檢測試劑盒還包括上游引物、下游引物和特異性探針,所述上游引物、下游引物和特異性探針的序列如下:
上游引物H7-FP:5’-CACTGCARAATAGAATACAGATWGAC-3’
下游引物H7-RP:5’-GTGCACYGCATGTTTCCATT-3’
探針特異性H7-P:5’-FAM-TTATGGTTTAGCTTCGGGGCATCATG-BHQ1-3’,其中FAM-為熒光報告基團,BHQ1為熒光淬滅基團;
所述流感病毒H7基因標準品的序列如下:
CAATGCAAAATAGAATACAGATTGACCCAGTCAAACTAAGCAGCGGCTACAAAGATGTGATACTCTGG?TTTAGCTTCGGGGCATCATGTTTCATACTTCTAGCCATTGCAATGGGCCTTGTTTTCATATGTGTGAA?GAATGGAAACATGCGGTGCAC。
所述檢測試劑盒中各組分的含量是:
一種禽流感病毒H7型熒光定量RT-PCR檢測方法,按以下步驟進行:
(1)提取待測樣品RNA;
(2)以待測樣品RNA為模板,與下列物質混合配制成反應體系進行RT-PCR反應:上游引物、下游引物、特異性探針、RT-PCR緩沖液、脫氧三磷酸核苷、MgCl2、RNA酶抑制劑、MMLV逆轉錄酶、DNA聚合酶;
所述特異性引物和特異性探針序列如下:
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