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[發明專利]一種檢測人HLA-B*57:01等位基因的試劑盒無效

專利信息
申請號: 201310116752.X 申請日: 2013-04-07
公開(公告)號: CN103184291A 公開(公告)日: 2013-07-03
發明(設計)人: 趙桐茂;詹申宏;羅振武 申請(專利權)人: 上海血液生物醫藥有限責任公司
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 上海世貿專利代理有限責任公司 31128 代理人: 嚴新德
地址: 200051 上海*** 國省代碼: 上海;31
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 檢測 hla 57 01 等位基因 試劑盒
【說明書】:

技術領域

本發明屬于生物技術領域,涉及一種基因分型檢測試劑盒,特別是一種檢測人HLA-B*57:01等位基因的試劑盒。

背景技術

人白細胞抗原(HLA)是細胞表面分子,是調控人體特異性免疫應答的主要基因系統,HLA基因位于第6號染色體短臂,由眾多復雜的等位基因構成,是目前所知多態性最復雜的遺傳系統。由HLA多態性的基因編碼的HLA蛋白對免疫介導或控制的疾病的易感性,個體變異,及藥物誘發的副反應中起重要作用。以前往往通過血清學檢測進行HLA分型,但結果并不精確?,F在一般則是通過HLA的序列來分析HLA的基因型。盡管測序的方法能得到最準確的序列信息,但是這會花費大量的時間,在臨床中并不適用。

近年的研究表明,HLA-B的基因的多態與藥物的不良反應密切相關。一些研究人員發現,在對HIV攜帶者進行治療時,一些患者對抗艾滋藥物阿巴卡韋(Abacavir,簡稱ABC)會產生嚴重的全身過敏性反應,甚至危及生命。進一步研究發現,HLA-B*57:01與ABC產生的嚴重的全身過敏反應存在密切關系,是目前發現的與藥物反應的相關性最好的遺傳標記物之一,此耐藥項目的研究人員SimonMallal于2003申請的專利WO03/068958A1中公開了使ABC產生藥物反應的基因座位置和檢測方法。因此,為此艾滋病治療指南要求患者在使用ABC藥物前,必須篩查HLA-B*57:01基因,當檢測結果為陰性,即患者不含HLA-B*57:01基因時方可使用ABC藥物。

雖然以前的研究證實了HLA-B*57:01基因與抗艾滋藥物阿巴卡韋的過敏反應存在相關性,艾滋病治療指南也要求患者在使用ABC藥物前必須篩查HLA-B*57:01基因,但目前缺乏對HLA-B*57:01基因檢測的試劑盒。同時,現在的測序方法雖然能得到精確的序列信息,但并不適合在檢測時大規模推廣。因此,獲得HLA檢測結果所需的高額費用和相對長的檢測時間就成為有效實施治療指南的主要障礙。對于能以低費用進行的簡單、精確且快速的HLA-B*57:01檢測存在巨大的需求。使用PCR序列特異性引物(sequence?specific?primer,SSP)分析技術檢測,這種方法是使用能夠特異識別特定等位基因的引物,以PCR擴增后檢測序列多態性。根據決定某等位基因的堿基性質,設計3′端第一個堿基分別與各等位基因的特異性堿基相匹配的序列特異性引物,在PCR反應過程中,只有引物3′端第一個堿基與決定特定等位基因的堿基互補時才能實現DNA片段的完全復制,根據PCR產物的有無進行等位基因的分型。這種方法可使我們目前開展的檢測手段的標準化,無需測序,通過序列條帶就能分辨特異性的HLA基因。

但是,雖然PCR-SSP只需要PCR就可以確定基因型的SNP,簡便、廉價,適合于分子標記的要求。但是該技術沒有被大量用于檢測基因型的SNP,其主要原因是引物的穩定性較差。

鑒于國內現在尚無HLA-B*57:01基因檢測試劑盒,國際上雖然有對HLA-B*57:01基因檢測的試劑盒,但是采用通用引物擴增后測序的方法進行HLA-B*57:01基因的檢測,導致了樣品檢測時間較長,檢測成本較高。

發明內容

本發明所要解決的技術問題是提供一種檢測人HLA-B*57:01等位基因的試劑盒,所述的這種檢測人HLA-B*57:01等位基因的試劑盒解決了現有技術中的試劑盒檢測HLA-B*57:01基因的時間長,檢測成本高的技術問題。

本發明提供了一種檢測人HLA-B*57:01等位基因的試劑盒,包括含有檢測HLA-B*57:01和所有HLA-B*57等位基因引物的PCR反應液,所述的檢測HLA-B*57:01的引物為引物B57F、引物B57R1、引物B57R2,所述的引物B57F的序列如SEQ?ID?NO:1所示,所述的引物B57R1的序列如SEQ?ID?NO:2所示,所述的引物B57R2的序列如SEQ?ID?NO:3所示,所述的檢測所有HLA-B*57的引物為引物BF11N和引物BIR57,所述的引物BF11N的序列如SEQ?ID?NO:4所示、所述的引物BIR57的序列如SEQ?ID?NO:5所示,所述的引物B57F、引物B57R1、引物B57R2、引物BF11N和引物BIR57在PCR反應液中的濃度分別為0.5μM。

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