[發(fā)明專利]一種HSD11B1基因的原位雜交的探針制定及檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310091240.2 | 申請日: | 2013-03-09 |
| 公開(公告)號(hào): | CN103320505A | 公開(公告)日: | 2013-09-25 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 章文羿;李江超;陳東海;李晶;崔航 | 申請(專利權(quán))人: | 北京安必奇生物科技有限公司 |
| 主分類號(hào): | C12Q1/68 | 分類號(hào): | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
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| 地址: | 100080 北京市海淀*** | 國省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 hsd11b1 基因 原位雜交 探針 制定 檢測 方法 | ||
1.一種HSD11B1基因mRNA原位雜交的探針,其特征在于,該探針的序列為:
5’CGAGTTCAAGGCAGCGAGACACTACCTTCTGGAGACC???3’。
2.一種如權(quán)利要求1所述探針的設(shè)計(jì)方法,其特征在于:
(1)根據(jù)HSD11B1的Gene?bank序列設(shè)計(jì)HSD11B1特異的探針序列;
(2)合成HSD11B1的mRNA原位雜交的探針,并將探針標(biāo)記上地高辛;
(3)檢測HSD11B1的mRNA探針的原位雜交
3.如權(quán)利要求2所述的設(shè)計(jì)方法,其特征在于,所述步驟(2)按照如下步驟進(jìn)行:
(a)按照步驟(1)設(shè)計(jì)的序列合成探針;
(b)將探針用HPLC純化;
(c)將純化后的產(chǎn)物標(biāo)記上非放射性標(biāo)記物-地高辛。
4.如權(quán)利要求2所述的設(shè)計(jì)方法,其特征在于,所述步驟(3)按照如下步驟進(jìn)行:
(a)將小鼠用0.4%戊巴比妥鈉深麻后,經(jīng)左心室插管至升主動(dòng)脈,用0.01mol/L的DEPC-PBS的快速?zèng)_洗去除血液,再以4%多聚甲醛灌注固定;所述的0.01mol/L?DEPC-PBS是2.9克磷酸氫二鈉,0.29克磷酸二氫鈉,9.0克氯化鈉用超純水定容至1L后,再加入體積百分比為0.1%的DEPC1ml放置過夜后,高壓滅菌制成的磷酸鹽緩沖液;所述4%的多聚甲醛是40.0克多聚甲醛加入500.0ml蒸餾水加熱使之解聚溶解后,再加入500.0ml的0.2mol/L?PB緩沖液定容至1000ml;所述0.2mol/L?PB緩沖液是用29.01克磷酸氫二鈉,2.96克磷酸二氫鈉加超純水定容至500ml配制而成;
(b)取材后進(jìn)行組織的后固定:于4℃,用4%的多聚甲醛后固定24小時(shí);
(c)將固定好的組織進(jìn)行切片:將組織切成25~30μm組織切片,并將切好的切片保存于0.01mol/L的DEPC-PBS中,放于4℃冰箱備用;
(d)將切好的組織片用0.01mol/L的DEPC-PBS清洗1次,室溫,每次5-10分鐘;
(e)將上述清洗過的片子用5x?SSC清洗2次,室溫,每次5-10分鐘;所述5x?SSC是由20xSSC用超純水稀釋的,20x?SSC為一種檸檬酸緩沖液;
(f)將5x?SSC清洗后的組織片浸入預(yù)雜交液中,于55℃,在雜交爐孵育1-2小時(shí);所述預(yù)雜交液是由5ml的去離子甲酰胺,2.5ml的20x?SSC溶液,200μl的50x?Denhardt’s溶液,50μl的濃度為200mg/ml的Heparin溶液,100μl的濃度為10mg/ml的tRNA溶液,100μl的濃度為10%的CHAPS溶液,100μl的濃度為10%的Tween-20溶液,100μl的濃度為0.5mol/L的pH8.0的EDTA溶液和1.85ml的DEPC-H2O混合配制而成;所述50x?Denhardt’s為一種常用的雜交試劑;所述200mg/ml的Heparin為200mg的Heparin粉末溶于1ml的DEPC-H2O中配制而成;所述10mg/ml的tRNA為10mg的tRNA粉末溶于1ml的DEPC-H2O中配制而成;所述10%的CHAPS為1g的CHAPS溶于1ml的DEPC-H2O中配制而成;所述10%的Tween-20為100μl的Tween-20溶于900μl的DEPC-H2O中配制而成;所述0.5mol/L的pH8.0的EDTA為186.1g二水乙二胺四乙酸二鈉加入800ml的DEPC-H2O中在磁力攪拌器上劇烈攪拌,用NaOH調(diào)pH值至8.0然后定容至1L配制而成高壓滅菌備用;所述DEPC-H2O為1L超純水加入體積百分比為0.1%的DEPC1ml,放置過夜并高壓滅菌處理后的水;
(g)將預(yù)雜交孵育后的組織切片浸入雜交液中,于55℃,在雜交爐中孵育16-20小時(shí);
所述雜交液是上述預(yù)雜交液中加入終濃度為1.0ug/ml的mRNA探針配置成的;
(h)雜交后用1x?SSC洗滌雜交的組織切片,37℃,2次,每次10分鐘;
(i)用2x?SSC洗滌上述的組織切片,37℃,2次,每次10-15分鐘;
(j)用10ug/ml的RNase?A處理,37℃,1次,每次30-40分鐘;
(k)用2x?SSC洗滌上述的組織切片,室溫,1次,每次10分鐘;
(1)用0.01mol/L?PBS洗滌上述的組織切片,室溫,1次,每次10分鐘;所述0.01mol/L?PBS是2.9克磷酸氫二鈉,0.29克磷酸二氫鈉,9.0克氯化鈉用超純水定容至1L配置的磷酸
緩沖液;
(m)按1∶2000的抗體效價(jià),在PBS溶液中加入Anti-Digoxigenin-AP抗體,對洗滌后的組織切片進(jìn)行孵育,室溫,放置過夜;
(n)將經(jīng)過上步抗體孵育的組織片用0.01mol/L?PBS洗滌,于室溫,清洗3次,每次10-15分鐘;
(o)用TS9.5洗滌上述PBS洗滌后的組織片,室溫,清洗2次,每次15-20分鐘;所述TS9.5為是由終濃度為摩爾濃度為0.1mol/L?Tris-HCl(PH9.5),摩爾濃度為0.1mol/L?NaCl溶液和摩爾濃度為50mmol/LMgCL2用超純水配制而成;
(p)將上述切片放于NBT-BCIP反應(yīng)液中避光孵育4~6小時(shí),在此過程中觀察切片呈色強(qiáng)度;所述NBT-BCIP是一種Roche公司生產(chǎn)的呈色反應(yīng)液;
(q)當(dāng)呈色完成后,將切片用PBS清洗3次,室溫,每次10-15分鐘;
(r)將上述洗滌后切片表于載玻片上;
(s)晾干切片,再經(jīng)過二甲苯脫色,復(fù)染核固紅,封片,以備觀察。
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