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[發明專利]Leber病之線粒體T3866C檢測試劑盒及應用有效

專利信息
申請號: 201310069330.1 申請日: 2013-03-05
公開(公告)號: CN103173544A 公開(公告)日: 2013-06-26
發明(設計)人: 蔣萍萍;管敏鑫;冀延春;梁敏;張娟娟;徐靜 申請(專利權)人: 浙江大學
主分類號: C12Q1/68 分類號: C12Q1/68
代理公司: 杭州求是專利事務所有限公司 33200 代理人: 張法高;趙杭麗
地址: 310027 浙*** 國省代碼: 浙江;33
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摘要:
搜索關鍵詞: leber 線粒體 t3866c 檢測 試劑盒 應用
【權利要求書】:

1.一種Leber病之線粒體T3866C檢測試劑盒,其特征在于,由置于盒體(8)內的DNA提取混合液(1)、擴增T3866C的PCR混合液(2)、針對T3866C設計的一對外引物(3)、針對T3866C設計的一對內引物(4)、限制性內切酶(5)、陽性對照(6)和陰性對照(7)構成,其中DNA提取混合液(1)由細胞裂解液和溶液Ⅰ組成,擴增T3866C的PCR混合液由脫氧單核苷酸、10×PCR緩沖液、MgCl2、三蒸水和DNA聚合酶組成,針對T3866C設計的一對外引物有外前向引物F:?TACTTCACAAAGCGCCTTCC和外反向引物R:?AAGGATTATGGATGCGGTTG,針對T3866C設計的一對內引物有內前向引物F:?CAACACAAGAACACCTCTGATTACTCCTGCCAT?CATGACCCTTGGCCATAATATGATAGA和內反向引物R:?GAGAGTGCGTCATATGTTGTTCCT?AGGAAGA,限制性內切酶為限制性內切酶BglⅡ,陽性對照(6)是含有線粒體序列第3866位點發生T>C突變的酶切樣本,陰性對照(7)是不含有線粒體序列第3866位點發生T>C突變的酶切樣本,溶液Ⅰ的成分是蛋白酶K。

2.根據權利要求1所述的一種Leber病之線粒體T3866C檢測試劑盒,其特征在于,在擴增T3866C的PCR混合液(2)中添加0.1-0.2μl二甲基亞砜。

3.根據權利要求1或2所述的一種Leber病之線粒體T3866C檢測試劑盒在檢測與母系遺傳原發性Leber氏病相關的線粒體基因ND1T3866C突變中的應用。

4.根據權利要求3所述的應用,其特征在于,通過以下步驟實現:

(1)基因組DNA的提取:運用蛋白酶K消化裂解法,從少量的血液標本、帶毛囊的毛發、口腔粘膜刮片或唾液的樣本中提取基因組DNA;

(2)特異性PCR擴增:使用Primer?5.0軟件和Oligo7.0軟件根據SEQ?ID?NO:5所示的人類線粒體基因序列所設計的引物F/R、F/R是能擴增出包含上述原發性Leber氏病的線粒體突變位點的片段,F外/R外擴增出為線粒體DNA的核苷酸3150-4679,其序列為序列表中的SEQ?ID?NO:1、2;F/R擴增出為線粒體DNA的核苷酸3806-4058,其序列為序列表中的SEQ?ID?NO:3、4;

(3)酶切鑒定:將上述PCR產物用限制性內切酶BglⅡ對T3866C突變位點處進行酶切;

(4)突變檢測:聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,直接根據酶切PCR產物產生的DNA片段數量及DNA片段大小,檢測mtDNA是否發生T3866C突變。

5.根據權利要求4所述的應用,其特征在于,步驟(1)所述從血標本、帶毛囊的毛發、口腔粘膜刮片或唾液的樣本中快速提取基因組DNA,通過以下方法獲得:

(1)血標本:取20~200μl血標本或1cm2的血濾紙片放入1.5ml離心管,加入900μl紅細胞裂解緩沖液,20mmol/L三羥甲基氨基甲烷-鹽酸緩沖液,pH?7.6,室溫靜置10min,充分裂解紅細胞,12000rpm離心1min,收集白細胞沉淀;

(2)帶毛囊的毛發:用體積比70%乙醇洗帶毛囊的毛發1?次,后再用蒸餾水沖洗毛發2次,在1.5ml離心管中分別放入2~4?根毛發,毛囊置于離心管底部,用干凈的剪刀剪去毛發高于離心管的部分;

(3)口腔粘膜刮片或唾液:收集唾液前,必須讓被收集者漱口,以除去口腔中過多的老化細胞、食物殘渣、牙膏、咖啡、煙等物質,半小時內不要喝水、進食、吸煙,然后開始收集口腔粘膜刮片或唾液,選擇如下方法收集唾液樣本:①舌頭圍繞口腔刮取粘膜細胞,將約0.1ml唾液直接吐進EP管內;②生理鹽水漱口,吐進離心管內,吸取PBS溶液至裝有通過上述任一種方法收集的唾液樣本的離心管中,反復吹打后,12000rpm離心5min,除去上清,重復該過程一次;③用棉拭子反復刮拭面頰內壁6次,空氣中干燥,然后用滅菌過的鑷子小心撕去其外表面,放入離心管中;④將唾液吐在濾紙上,空氣中干燥后形成唾液斑,再用干凈的剪刀剪成大小約1cm2碎紙片置于離心管中;

然后用細胞裂解液和蛋白酶K對上述樣本進行消化裂解,利用鹽析法去除雜質,異丙醇沉淀DNA,最后用高壓滅菌水或TE緩沖液溶解后于-20℃保存備用。

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