[發明專利]新的短核苷酸串聯重復序列位點及其應用

有效

• 申請號: 201310041317.5
• 申請日: 2013-02-01
• 公開（公告）號: CN103966207B
• 公開（公告）日: 2017-10-13
• 發明（設計）人: 姜正文;馬瑞曉;張希
• 申請（專利權）人: 天昊生物醫藥科技（蘇州）有限公司
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/68;C12N15/10
• 代理公司: 上海一平知識產權代理有限公司31266
• 代理人: 馬莉華,崔佳佳

1.一種分離的短串聯重復序列基因座G2S0002，其特征在于，所述基因座的序列如SEQ ID NO.:1所示。

2.一種分離的核苷酸序列，其特征在于，所述核苷酸序列的結構如下：

X1-X2-X3

式中，X1為SEQ ID NO.:2中第1-782位；

X2為含有≥10個重復單元aaag的遺傳多態區，并且所述的遺傳多態區是SEQ ID NO.:1所示的多核苷酸，或者所述的遺傳多態區是在SEQ ID NO.:1基礎上缺失或插入一個或幾個重復單元而形成的多核苷酸，并且所述重復單元為aaag；

X3為SEQ ID NO.:2中第873-1652位。

3.如權利要求1所述的短串聯重復序列基因座G2S0002的用途，其特征在于，用于制備：

(a)用于遺傳關系分析的試劑或試劑盒；

(b)用于個體識別的試劑或試劑盒；

(c)用于親子鑒定或血緣分析的試劑或試劑盒；

(d)用于檢測抽提羊水中是否存在母血污染的試劑或試劑盒；和/或

(e)用于檢測骨髓移植后受體中的白細胞是否被供體細胞取代的試劑盒。

4.如權利要求3所述的用途，其特征在于，所述的試劑包括(i)引物或引物對；(ii)探針；(iii)核酸芯片。

5.如權利要求4所述的用途，其特征在于，所述的引物對的序列如SEQ ID NO.:3和SEQ ID NO.:4所示。

6.一種特異性擴增短串聯重復序列基因座G2S0002的引物對，其特征在于，所述的引物對的序列如SEQ ID NO.:3和SEQ ID NO.:4所示。

7.一種試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包括：

(a)用于特異性擴增短串聯重復序列基因座G2S0002的引物對，所述引物對的序列如SEQ ID NO.:3和SEQ ID NO.:4所示；和

(b)使用說明書。

8.如權利要求7所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還包括(c)特異性擴增選自下組的一種或多種基因座的引物對：

D3S1358、vWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO。

9.一種擴增體系，其特征在于，所述擴增體系包括：

(a)用于特異性擴增短串聯重復序列基因座G2S0002的引物對，所述引物對的序列如SEQ ID NO.:3和SEQ ID NO.:4所示；和

(b)任選的、特異性擴增選自下組的一種或多種基因座的引物對：

D3S1358、vWA、D16S539、D5S818、D7S820、CSF1PO、D13S317、TPOX、D8S1179、D21S11、D18S51、TH01、FGA、D2S1338、D19S433、AMELO；

并且所述引物對(a)和任選的引物對(b)位于同一擴增體系。

10.如權利要求9所述的擴增體系，其特征在于，所述的擴增體系為復合擴增體系，其中，所述的引物對(b)包括1，2，3，4，5，6，7，8，9，10，11，12，13，14，15，或16對特異性引物對；和/或

所述復合擴增體系為熒光標記的復合擴增體系，其中，所述熒光標記是指選用下組的一種或多種熒光標記試劑標記所述基因座的引物：FAM、HEX、VIC、NED、PET、TAMRA、ROX、熒光素、FITC、IRD-700/800、CY3、CY5、CY3.5、CY5.5、TET、TAMRA、JOE、BODIPY TMR、俄勒岡綠、羅丹明綠、羅丹明紅、德克薩斯紅或雅基馬黃。

11.一種擴增方法，其特征在于，包括步驟：

在權利要求9-10中任一所述的擴增體系中，以待檢測樣本為模板，利用聚合酶鏈式反應進行基因座的擴增，從而獲得基因座擴增產物。

12.一種遺傳關系分析方法，其特征在于，包括步驟：

(1)在權利要求9-10中任一所述的擴增體系中，以待檢測樣本為模板，利用聚合酶鏈式反應進行基因座的擴增，從而獲得基因座擴增產物；和

其中，所述待檢測樣本包括分別來自不同個體的核酸樣本S1,S2,……,Si，式中i為≥2的正整數；

(2)對來自不同核酸樣本S1,S2,……,Si的基因座擴增產物進行檢測，從而獲得對應于不同核酸樣本的檢測結果；

(3)對步驟(2)獲得的檢測結果進行比較，從而確定不同個體之間的遺傳關系。