[發(fā)明專利]一種傳統(tǒng)藥物毒性評(píng)價(jià)方法及其系統(tǒng)無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201310031141.5 | 申請(qǐng)日: | 2013-01-26 |
| 公開(公告)號(hào): | CN103049675A | 公開(公告)日: | 2013-04-17 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 劉延淮;劉海波;徐峻;劉志強(qiáng) | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 北京東方靈盾科技有限公司 |
| 主分類號(hào): | G06F19/00 | 分類號(hào): | G06F19/00;G06F17/30 |
| 代理公司: | 北京金知睿知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11379 | 代理人: | 林俐;阿蘇娜 |
| 地址: | 100080 北京市海淀*** | 國(guó)省代碼: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 傳統(tǒng) 藥物 毒性 評(píng)價(jià) 方法 及其 系統(tǒng) | ||
1.一種傳統(tǒng)藥物毒性的評(píng)價(jià)方法,所述方法的步驟包括:
步驟一,確定待評(píng)測(cè)傳統(tǒng)藥物的化學(xué)成分:
步驟二,根據(jù)該傳統(tǒng)藥物的化學(xué)成分評(píng)價(jià)其毒性。
2.如權(quán)利要求1所述的評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)方法,其特征在于:
在步驟一中,通過(guò)確定所述傳統(tǒng)藥物的成分,進(jìn)而得出所述傳統(tǒng)藥物的化學(xué)成分;
在步驟二中,采用化學(xué)信息學(xué)的方法,對(duì)于傳統(tǒng)藥物的化學(xué)成分逐一進(jìn)行毒性評(píng)價(jià)預(yù)測(cè),得出評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)結(jié)論。
3.如權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于,所述化學(xué)信息學(xué)的方法包括:
分子結(jié)構(gòu)相似性比較方法,基于待測(cè)傳統(tǒng)藥物化學(xué)成分的分子結(jié)構(gòu)與已知毒性的分子結(jié)構(gòu)相似度判斷,預(yù)測(cè)化合物具有相關(guān)毒性的概率;
特征結(jié)構(gòu)辨識(shí)方法,基于待測(cè)傳統(tǒng)藥物的化合物是否具有已知毒性特征結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)化合物是否具有相關(guān)毒性。
4.一種用傳統(tǒng)藥物毒性的評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)方法對(duì)傳統(tǒng)藥物組方進(jìn)行改良的方法,所述方法的步驟為:
步驟一,確定待測(cè)評(píng)傳統(tǒng)藥物組方的藥物成分,根據(jù)所述藥物成分確定其化學(xué)成分集合;采用化學(xué)信息學(xué)的方法,對(duì)所述化學(xué)成分逐一評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)其毒性,得出評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)結(jié)果;
步驟二,根據(jù)評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)結(jié)果,對(duì)于毒性較大的化學(xué)成分,找到傳統(tǒng)藥物中對(duì)應(yīng)的藥物成分,采用治療作用類似的傳統(tǒng)藥物成分替換所述傳統(tǒng)藥物組方中毒性較大的藥物成分。
5.一種傳統(tǒng)藥物毒性的評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)系統(tǒng),其特征在于,所述評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)系統(tǒng)至少包括:
輸入模塊,用于輸入和分析傳統(tǒng)藥物和傳統(tǒng)藥物組方信息,并響應(yīng)用戶的各種操作;
輸出模塊,用于計(jì)算過(guò)程信息的顯示,以及預(yù)測(cè)結(jié)果輸出;
存儲(chǔ)模塊,用于存儲(chǔ)、讀取和管理計(jì)算機(jī)程序文件、化合物結(jié)構(gòu)文件、活性數(shù)據(jù)文件、配置文件、臨時(shí)文件和歷史文件;
傳統(tǒng)藥物數(shù)據(jù)庫(kù),用于存儲(chǔ)和管理傳統(tǒng)藥物相關(guān)數(shù)據(jù);
毒性化合物庫(kù),用于存儲(chǔ)和管理已知的具有毒性的化合物分子結(jié)構(gòu);
化合物毒性預(yù)測(cè)模塊,用于評(píng)價(jià)預(yù)測(cè)待測(cè)傳統(tǒng)藥物的化學(xué)成分的毒性;
數(shù)據(jù)處理模塊,用于連接上述各個(gè)模塊及數(shù)據(jù)庫(kù),實(shí)時(shí)管理數(shù)據(jù)流向,是系統(tǒng)核心模塊。
6.如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng),其特征在于,所述輸入模塊還包括:
傳統(tǒng)藥物名詞表,用于存儲(chǔ)每種傳統(tǒng)藥物的正名、別名和數(shù)據(jù)庫(kù)登錄號(hào),對(duì)輸入的數(shù)據(jù)進(jìn)行實(shí)時(shí)分析,將用戶輸入的傳統(tǒng)藥物名轉(zhuǎn)化為登錄號(hào)序列,用于后期的檢索;
傳統(tǒng)藥物名提示子模塊,用于根據(jù)上述傳統(tǒng)藥物名詞表中的數(shù)據(jù),在用戶輸入傳統(tǒng)藥物名的過(guò)程中給出實(shí)時(shí)提示。
7.如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng),其特征在于,所述輸出模塊包括:
化合物分子結(jié)構(gòu)顯示子模塊,用于結(jié)果輸出的過(guò)程中提供化合物的分子結(jié)構(gòu)瀏覽功能。
8.如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng),其特征在于,所述傳統(tǒng)藥物數(shù)據(jù)庫(kù)由多個(gè)數(shù)據(jù)子庫(kù)組成,所述數(shù)據(jù)子庫(kù)包括:傳統(tǒng)藥物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù)、科技文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)、FDA藥物數(shù)據(jù)庫(kù)、世界傳統(tǒng)藥物專利數(shù)據(jù)庫(kù)、藥政法規(guī)數(shù)據(jù)庫(kù)多個(gè)數(shù)據(jù)子庫(kù)。
9.如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng),其特征在于,
所述傳統(tǒng)藥物數(shù)據(jù)庫(kù)包括傳統(tǒng)藥物天然產(chǎn)物數(shù)據(jù)庫(kù),用于存儲(chǔ)傳統(tǒng)藥物的化合物的分子結(jié)構(gòu)信息和生物活性信息;
所述毒性化合物庫(kù),用于存儲(chǔ)已知的具有毒性的化合物的分子結(jié)構(gòu)信息和生物活性信息;
所述分子結(jié)構(gòu)信息以化學(xué)編碼格式進(jìn)行存儲(chǔ),編碼格式包括:mol文件、mol2文件、sdf文件、smiles碼、inchi碼;
所述分子結(jié)構(gòu)信息在庫(kù)中的存儲(chǔ)方式包括:每個(gè)分子結(jié)構(gòu)特征單獨(dú)存儲(chǔ)為一個(gè)文件、多個(gè)分子結(jié)構(gòu)特征存儲(chǔ)為一個(gè)文件、通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)存儲(chǔ)管理。
10.如權(quán)利要求5所述的系統(tǒng),其特征在于,所述化合物毒性預(yù)測(cè)模塊包括:
化合物結(jié)構(gòu)相似性評(píng)價(jià)模塊,所述模塊基于比較化合物與已知毒性分的結(jié)構(gòu)相似度,預(yù)測(cè)化合物具有毒性的概率;
特征結(jié)構(gòu)辨識(shí)模塊,所述模塊基于辨識(shí)化合物是否具有已知化合物毒性特征結(jié)構(gòu),預(yù)測(cè)化合物是否具有毒性;
預(yù)測(cè)結(jié)果匯總子模塊:用于對(duì)化合物結(jié)構(gòu)相似性評(píng)價(jià)模塊和特征結(jié)構(gòu)辨識(shí)模塊的預(yù)測(cè)結(jié)論予以匯總,給出最終預(yù)測(cè)報(bào)告。
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