[發(fā)明專利]一種鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒及檢測方法無效
| 申請?zhí)枺?/td> | 201310019403.6 | 申請日: | 2013-01-18 |
| 公開(公告)號: | CN103045764A | 公開(公告)日: | 2013-04-17 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 曾令兵;范玉頂;張輝;周勇;徐進 | 申請(專利權(quán))人: | 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 武漢宇晨專利事務(wù)所 42001 | 代理人: | 王敏鋒 |
| 地址: | 430223 湖北省武*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 皰疹病毒 lamp 檢測 試劑盒 方法 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于魚類病毒檢測技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒,還涉及一種利用鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒檢測鯉皰疹病毒2型的方法。
背景技術(shù)
在我國的鯽魚主養(yǎng)區(qū),2009年零星發(fā)生鯽魚病毒性出血病,發(fā)病情況出現(xiàn)逐年上升的趨勢,死亡率高,目前尚未有有效的控制措施,初步研究表明其病原為鯉皰疹病毒Ⅱ型(Cyprinid?herpesvirus?II,CyHV-2),初步命名該病為鯽造血器官壞死癥(Crucian?Carp?Hematopoietic?Necrosis)。2011年在匈牙利養(yǎng)殖的銀鯽也發(fā)現(xiàn)了CyHV-2感染的病例。
CyHV-2在幾種魚類細胞系中的增殖均不能超過4代,需要盡快建立快速、敏感、特異、適宜現(xiàn)場診斷的方法,為疾病的診斷與防控提供技術(shù)手段,也為鯽魚養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展提供技術(shù)保障。
環(huán)介導(dǎo)等溫擴增(Loop-mediated?isothermal?amplification,LAMP)技術(shù)是Notomi等于2000年報道的一種新型等溫核酸擴增方法(國際專利公開號WO00/28082),針對靶基因的6個位點設(shè)計4條LAMP引物,利用一種具有鏈置換活性的DNA聚合酶(Bst?DNA聚合酶),在恒溫條件下快速、高效、高特異、高靈敏地擴增靶序列,適合于現(xiàn)場和實驗條件較簡單的實驗室進行快捷檢測。引入一對環(huán)狀引物的改進方法,進一步縮短了反應(yīng)時間。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的一個目的是在于提供了一種鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒,根據(jù)GenBank公布的CyHV-2毒株的解旋酶基因編碼區(qū)序列(KC245087),應(yīng)用PrimerExplorer?V4?(http://primerexplorer.jp/elamp4.0.0/index.html)在線軟件設(shè)計特異性引物,利用LAMP技術(shù)擴增靶基因的特定區(qū)域,從分子水平對鯉皰疹病毒2型進行快速檢測,具有簡便、快速、高特異性和靈敏性的特點。
本發(fā)明的另一個目的是在于提供了一種利用鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒檢測鯉皰疹病毒2型的方法,本方法僅需一個水浴鍋或金屬浴即可在2小時內(nèi)準(zhǔn)確檢測出樣品中的CyHV-2,能檢測CyHV-2感染的病魚組織,能檢測CyHV-2感染的細胞(例如Koi-Fin細胞),非常適用于CyHV-2的現(xiàn)場快速檢測。
為了實現(xiàn)上述目的,本發(fā)明采用以下技術(shù)方案:
一種鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒,包括以下成分:
該試劑盒包括以下成分:10×ThermoPol?Reaction?Buffer;Bst?DNA聚合酶(NEB);dNTPs;外引物F3和B3、內(nèi)引物FIP和BIP、Betaine(Sigma),MgCl2,1000×SYBR?Green?I(Invitrogen)。
F3:5’-TTGGATCTGAACGCTTCGG-3’;
B3:5’-CGTTGGTCTGTATGGGAGC-3’;
FIP:5’-GCGATGTAAGCCCTGTGAGACTTTTTACGAGACGTGGTTCCTAGC-3’;
BIP:5’-AACGCACGAGTGCGAGTCTCTTTTGCTGTGGATCGTCCATCC-3’。
一種利用鯉皰疹病毒2型LAMP檢測試劑盒檢測鯉皰疹病毒2型的方法,其步驟是:
1、病毒DNA的獲取:
采用試劑或Viral?DNA?Kit試劑盒等提取樣本總DNA模板,DNA在95℃5分鐘后迅速置于冰浴中的預(yù)處理可以增加檢測的靈敏度。
2、LAMP擴增:
采用25μl反應(yīng)體系,包括:內(nèi)引物FIP和BIP各0.8μM,外引物F3和B3各0.1μM,dNTPs1mM,Betaine0.5M,MgCl22-10mM,Bst?DNA聚合酶8U,模板DNA5μl,10×ThermoPol?Reaction?Buffer2.5μl,去離子水補足余量。選擇55-65℃的溫度范圍和30-120分鐘的時間范圍進行LAMP反應(yīng)之后,80℃滅活2分鐘。
3、檢測結(jié)果判定,可用下述三種方法之一進行結(jié)果的判定:
1)發(fā)生擴增反應(yīng)時,從dNTPs析出的焦磷酸根離子和反應(yīng)液中的鎂離子形成白色焦磷酸鎂沉淀,通過肉眼判斷:檢測管出現(xiàn)明顯渾濁為陽性,未見渾濁為陰性。
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