[發明專利]用于篩選有瘤/無瘤黃瓜果實類型的顯性分子標記有效
| 申請號: | 201310013138.0 | 申請日: | 2013-01-14 |
| 公開(公告)號: | CN103074338A | 公開(公告)日: | 2013-05-01 |
| 發明(設計)人: | 楊緒勤;蔡潤;何歡樂;朱文瑩;潘俊松 | 申請(專利權)人: | 上海交通大學 |
| 主分類號: | C12N15/11 | 分類號: | C12N15/11;C12N15/29;C12Q1/68 |
| 代理公司: | 上海科盛知識產權代理有限公司 31225 | 代理人: | 楊元焱 |
| 地址: | 200240 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 篩選 黃瓜 果實 類型 顯性 分子 標記 | ||
1.用于篩選有瘤/無瘤黃瓜果實類型的顯性分子標記,命名為Y68,其核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示,有瘤黃瓜品種含有該標記,無瘤黃瓜品種不含有該標記。
2.根據權利要求1所述的用于篩選有瘤/無瘤黃瓜果實類型的顯性分子標記,其特征在于:由SEQ?ID?NO.2所示的上游引物和SEQ?ID?NO.3所示的下游引物擴增得到,其擴增程序為:94℃5min;35cycles,94℃25s;54℃25s;72℃30s;72℃5min。
3.用于控制黃瓜果瘤性狀的果瘤基因,其蛋白編碼序列由SEQ?ID?NO.4所示的213個氨基酸組成,無瘤品種不含有該213個氨基酸。
4.根據權利要求3所述的用于控制黃瓜果瘤性狀的果瘤基因,其特征在于:所述果瘤基因為鋅指蛋白基因,該鋅指蛋白基因的蛋白編碼序列含有6個C2H2鋅指蛋白的特異氨基酸序列結構-QALGGH,是一個轉錄因子,該蛋白能促進黃瓜果實表皮緊靠表皮毛基部部位的細胞的分裂。
5.根據權利要求3所述的用于控制黃瓜果瘤性狀的果瘤基因,其特征在于:所述蛋白編碼序列存在于黃瓜品種9930基因組序列Scaffold000083和黃瓜品種Gy14黃瓜基因組序列Scaffold02633中。
6.根據權利要求3所述的用于控制黃瓜果瘤性狀的果瘤基因的鑒定,其特征在于:利用有瘤親本和無瘤親本雜交獲得F1,F1再自交獲得F2群體,再利用F2群體的2808株個體,根據果瘤基因初步定位結果,結合公布的黃瓜基因組序列開發多態性標記,使用染色體步移技術將果瘤基因定位于SSR42和SNP18之間的候選區域含有41.6kb的核苷酸序列內,該含有41.6kb的核苷酸序列包含磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因和C2H2鋅指蛋白基因,其中C2H2鋅指蛋白基因CDNA區域序列在兩親本之間存在巨大差異,而磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因不存在差異,最后得出C2H2鋅指蛋白基因就是控制黃瓜果瘤性狀的果瘤基因。
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