[發明專利]一種microRNA的二次循環擴增檢測方法及試劑盒有效
| 申請號: | 201310007183.5 | 申請日: | 2013-01-09 |
| 公開(公告)號: | CN103088128A | 公開(公告)日: | 2013-05-08 |
| 發明(設計)人: | 夏帆;段瑞雪;陳志飛;左小磊 | 申請(專利權)人: | 華中科技大學 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 華中科技大學專利中心 42201 | 代理人: | 夏惠忠 |
| 地址: | 430074 湖北*** | 國省代碼: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 microrna 二次 循環 擴增 檢測 方法 試劑盒 | ||
1.一種miRNAs的二次方循環擴增檢測方法,包括以下步驟:
步驟一:37℃條件下的標準曲線:取5-8個1.5ml的離心管,分別加入分子信標探針、8個堿基的引物、dNTPs、Bst聚合酶、Nb.BbvCI切刻內切酶、lambda核酸外切酶、BSA、RRI,另外設計5-8個濃度梯度(10fM-100nM)的miRNA樣品分別加入到以上離心管中37℃恒溫孵育2h;所述的分子信標探針的核苷酸序列為:
其5′端的兩個堿基有硫代標記,3′端標記有淬滅基團DABCYL,另外還含有Nb.BbvCI切刻酶的切刻位點GCTGAGG(下劃線);靠近5′端第10個堿基處標記有熒光基團FAM;所述的8個堿基的引物的核苷酸序列為:其5′端的兩個堿基也是硫代標記。
步驟二:熒光儀上進行檢測,即可得到不同濃度的miRNA樣品對應的熒光強度,熒光儀的設置參數如下:激發和發射狹峰寬度均為5nm,電壓PMT?700v,激發波長為490nm,發射波長掃描范圍500~600nm,根據熒光強度和miRNA樣品濃度可得37℃條件下的檢測標準曲線;
步驟三:改變步驟一中的反應條件為4℃恒溫孵育50h,其它條件不變,可得4℃條件下的檢測標準曲線;
步驟四:對于乳腺癌細胞的檢測,首先利用mirVanaTM試劑盒提取出細胞中的miRNA,作為待檢測的樣品,利用步驟一中的條件可以得到乳腺癌細胞的檢測標準曲線;
步驟五:將分子信標探針、8個堿基的引物、dNTPs、Bst聚合酶、Nb.BbvCI切刻內切酶、lambda核酸外切酶、BSA、RRI、以及待測樣品加入到1.5ml的EP離心管中恒溫孵育2h,在熒光儀上進行檢測,熒光儀的參數設置與步驟二中熒光儀的參數設置相同,得到的熒光強度和檢測標準曲線相對應即可得到樣品中含有的miRNA的濃度。
2.根據權利要求1所描述的miRNAs的二次方循環擴增檢測方法,其特征在于,反應總體積為50μL,反應成份的濃度為:
分子信標探針:500nM;
引物:2μM;
dNTPs:400μM;
Bst聚合酶:16U;
Nb.BbvCI切刻內切酶:15U;
lambda核酸外切酶:12.5U。
3.根據權利要求1所描述的miRNAs的二次方循環擴增檢測方法,其特征在于,對于一個未知樣品可以先在37℃恒溫下反應2h,若得到的信號和本底相同,則可能有兩種情況,一是樣品中不含miRNA或者是其含量在10fM以下,這時可以改反應條件為4℃下反應50h;如果樣品的濃度是在10aM以上的可以被檢測出。
4.一種miRNA熒光檢測試劑盒,包括:
分子信標探針,8個堿基引物,Bst聚合酶,Nb.BbvCI切刻內切酶,Lambda核酸外切酶,NEB?buffer?3,dNTPs,DEPC水,BSA,RRI。
所述的分子信標探針的核苷酸序列為:
其5′端的兩個堿基有硫代標記,3′端標記有淬滅基團DABCYL,另外還含有Nb.BbvCI切刻酶的切刻位點GCTGAGG(下劃線);靠近5′端第10個堿基處標記有熒光基團FAM;所述的8個堿基引物的核苷酸序列為:其5′端的兩個堿基也是硫代標記。
5.根據權利要求4所述的miRNA熒光檢測試劑盒,其特征在于,還包括使用說明書。
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