[發明專利]用于可視化和評估數據的方法和系統

有效

• 申請號: 201280058576.2
• 申請日: 2012-09-28
• 公開（公告）號: CN104093853A
• 公開（公告）日: 2014-10-08
• 發明（設計）人: 戈登·亞納威;曼朱拉·阿利米納蒂;吳若云;大衛·方特斯丘;沈明
• 申請（專利權）人: 生命技術公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識產權代理有限責任公司 11204
• 代理人: 余朦;王艷春

1.生成數字聚合酶鏈反應(dPCR)結果的計算機實施的方法，所述方法包括：

在擴增周期期間的第一時間從多個樣本中檢測第一組發射數據，所述多個樣本中的每個包括在多個樣本區域的樣本區域中；

部分地基于所述第一組發射數據為所述多個樣本的每個樣本確定正擴增確定或負擴增確定；以及

基于所述多個樣本的所述正擴增確定或負擴增確定生成dPCR結果。

2.根據權利要求1所述的計算機實施的方法，還包括：

在擴增周期期間的第二時間從所述多個樣本中檢測第二組發射數據，其中所述第一組發射數據和所述第二組發射數據包括在用于所述多個樣本中的每個的擴增曲線數據中。

3.根據權利要求2所述的計算機實施的方法，還包括：

在所述擴增周期中的熱循環的每個階段之后從所述多個樣本中檢測發射數據以生成所述擴增曲線數據。

4.根據權利要求2所述的計算機實施的方法，還包括：

在所述擴增周期期間檢測實時發射數據以生成所述擴增曲線數據。

5.根據權利要求2所述的計算機實施的方法，其中為所述多個樣本的每個樣本確定正擴增確定或負擴增確定包括：

為所述多個樣本中的每一個確定定量循環；

二進制化所述多個確定的定量循環；以及

為所述多個樣本顯示所述二進制定量循環的直方圖。

6.根據權利要求2所述的計算機實施的方法，還包括：

基于所述樣本的擴增曲線數據確定所述多個樣本中的樣本的有效測試。

7.根據權利要求2所述的計算機實施的方法，還包括：

向用戶顯示所述擴增曲線數據和所述正確定或所述負確定。

8.根據權利要求5所述的計算機實施的方法，其中所述擴增曲線數據與所述直方圖一起顯示給用戶。

9.根據權利要求5所述的計算機實施的方法，其中低于預定的閾值的定量循環被確定為無效測試。

10.根據權利要求5所述的計算機實施的方法，其中高于預定的閾值的定量循環被確定為有效測試。

11.根據權利要求5所述的計算機實施的方法，其中在預定的范圍中的定量循環被確定為有效測試。

12.計算機可讀介質，所述計算機可讀介質編碼有指令，所述指令可由處理器執行，所述指令包括：

用于在擴增周期期間的第一時間從多個樣本中檢測第一組發射數據的指令，所述多個樣本中的每個包括在多個樣本區域的樣本區域中；

用于在擴增周期期間的第二時間從所述多個樣本中檢測第二組發射數據的指令，其中所述第一組發射數據和所述第二組發射數據包括在用于所述多個樣本中的每個的擴增曲線數據中；

用于部分地基于所述相應的擴增曲線數據為所述多個樣本的每個樣本確定正擴增確定或負擴增確定的指令；以及

用于基于所述多個樣本的所述正擴增確定或負擴增確定生成dPCR結果的指令。

13.根據權利要求12所述的計算機可讀介質，其中用于為所述多個樣本的每個樣本確定正擴增確定或負擴增確定的指令包括：

用于為所述多個樣本中的每個確定定量循環的指令；

用于二進制化所述多個確定的定量循環的指令；以及

用于為所述多個樣本顯示所述二進制定量循環的直方圖的指令。

14.根據權利要求12所述的計算機可讀介質，還包括：

用于基于所述樣本的擴增曲線數據確定所述多個樣本中的樣本的有效測試的指令。

15.根據權利要求12所述的計算機可讀介質，其中所述指令還包括用于向用戶顯示所述擴增曲線數據和所述正確定或所述負確定的指令。

16.根據權利要求13所述的計算機可讀介質，其中所述擴增曲線數據與所述直方圖一起顯示給用戶。

17.根據權利要求13所述的計算機可讀介質，其中低于預定的閾值的定量循環被確定為無效測試。

18.根據權利要求13所述的計算機可讀介質，其中高于預定的閾值的定量循環被確定為有效測試。

19.根據權利要求13所述的計算機可讀介質，其中在預定的范圍中的定量循環被確定為有效測試。