[發明專利]寡糖轉移酶催化的天冬酰胺連接的糖基化的組分的合理設計

有效

• 申請號: 201280021372.1
• 申請日: 2012-05-03
• 公開（公告）號: CN103620053A
• 公開（公告）日: 2014-03-05
• 發明（設計）人: M.阿伊比;K.洛徹爾;C.里扎克
• 申請（專利權）人: 瑞士蘇黎世聯邦理工學院
• 主分類號: C12Q1/48
• 分類號: C12Q1/48
• 代理公司: 中國專利代理(香港)有限公司 72001
• 代理人: 劉健;梁謀

1.用于鑒定寡糖轉移酶(OST)-催化的天冬酰胺-連接(“N-連接”)的糖基化的潛在組分的方法，所述潛在組分選自

(a)?潛在寡糖供體，優選脂質-連接的寡糖(LLO)或焦磷酸十一異戊二烯酯結合的寡糖供體，

(b)?潛在寡糖轉移酶(OST),

(c)?潛在共有序列基序多肽，和

(d)?潛在糖基化抑制劑，

所述方法包括步驟

(i)?使用表1的原子坐標，所述原子坐標距離骨架原子優選+2??、更優選+1.5??、最優選+1.0??均方根偏差(rmsd)，用于生成紅嘴鷗彎曲桿菌的寡糖轉移酶(OST)的催化結構域的三維模型，所述催化結構域包含氨基酸D56、R147、D154、D156、E319、R375、Y468、和H485中的至少三個、優選至少四個、更優選至少六個、最優選所有氨基酸，和/或，優選并且

(ii)?使用表1的原子坐標，所述原子坐標距離骨架原子優選+2??、更優選+1.5??、最優選+1.0??均方根偏差(rmsd)，用于生成紅嘴鷗彎曲桿菌的寡糖轉移酶(OST)的多肽結合位點的三維模型，所述多肽結合位點包含氨基酸M318、R331、W463、W464、D465、和I572中的至少兩個、優選至少三個、更優選至少四個、最優選所有氨基酸，

(iii)?優選在(i)和/或(ii)的三維模型的氨基酸的坐標上進行全身平移和/或旋轉，

(iv)?使用所述(i)、(ii)和/或(iii)的三維模型用于設計或選擇潛在組分(a)至(d)中的至少一種，

(v)?提供所述潛在組分(a)至(d)中的至少一種，并且

(vi)?將所述潛在組分(a)至(d)中的至少一種與對于寡糖轉移酶(OST)-催化的天冬酰胺-連接(“N-連接”)的糖基化必需的進一步功能組分接觸，

(vii)?鑒定選自以下的功能組分

?????(A)?功能性寡糖供體，優選功能性脂質-連接的寡糖(LLO)或焦磷酸十一異戊二烯酯結合的寡糖供體，

?????(B)?功能性寡糖轉移酶(OST),

?????(C)?功能性共有序列基序多肽，和

?????(D)?功能性糖基化抑制劑。

2.權利要求1的方法，其中在步驟(ii)中，紅嘴鷗彎曲桿菌的寡糖轉移酶(OST)的多肽結合位點的三維模型包含氨基酸M318、A331、W463、W464、D465?和I572中的至少兩個、優選至少三個、更優選至少四個、最優選所有氨基酸。