[發(fā)明專利]來源于灰蓋鬼傘菌的漆酶2基因及其應(yīng)用無效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201210592335.8 | 申請(qǐng)日: | 2012-12-31 |
| 公開(公告)號(hào): | CN103045620A | 公開(公告)日: | 2013-04-17 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 田永生;許晶;彭日荷;金曉芬;韓洪娟;韓靜;王波;王麗娟 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院 |
| 主分類號(hào): | C12N15/53 | 分類號(hào): | C12N15/53;C12N9/02;C12N15/81;C02F3/00 |
| 代理公司: | 上海開祺知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 31114 | 代理人: | 費(fèi)開逵 |
| 地址: | 201106 *** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 來源于 灰蓋鬼傘菌 基因 及其 應(yīng)用 | ||
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬微生物基因工程領(lǐng)域,涉及一種來源于灰蓋鬼傘菌(Coprinopsis?cinereaokayama)的漆酶2基因及其應(yīng)用。
背景技術(shù)
漆酶(EC1.10.3.2)是一種含銅的氧化還原酶,屬于氧化酶的藍(lán)銅家族(Eur?J?Biochem187:341-352)。漆酶的應(yīng)用范圍很廣,目前研究它的應(yīng)用主要集中在它降解各種化工染料(J?Ind?Microbiol?Biotechnol31:127-132)、芳香族類化合物(Microbial?Cell?Factories5:31)以及二酚、多酚類化合物(Process?Biochemistry45:507-513)的功能。除此之外,漆酶在不同的物種發(fā)揮不同的功能:在昆蟲中,它們參與甲殼的硬化;在植物中,參與細(xì)胞壁形成,還與木質(zhì)素化和去木質(zhì)素有關(guān);在芽孢桿菌中,則是和抗紫外線的孢子組裝有關(guān);在一些植物致病性真菌利用這類酶免除植物抗毒素和鞣酸的作用。眾所周知,漆酶給工業(yè)生產(chǎn)方面帶來了巨大的貢獻(xiàn)。大量的漆酶基因從植物(J?Chem?Soc43:472)、動(dòng)物(萬云洋,博士論文,武漢大學(xué))和微生物(Microbiology148:4003–4014)中分離出來,進(jìn)行了系統(tǒng)的研究。
在NCBI數(shù)據(jù)庫中,收集了很多微生物的全基因組的信息,其中編碼蛋白的序列都被注釋了。但是大部分的蛋白的生化功能和生理功能都是未知的。因此研究注釋蛋白的功能可以完善這些酶學(xué),并運(yùn)用到工業(yè)應(yīng)用中去。
灰蓋鬼傘菌屬于層菌綱家族,是亞洲很受歡迎的藥用菌類。它的化學(xué)成分已經(jīng)研究的相當(dāng)透徹。雖然灰蓋鬼傘菌有8個(gè)漆酶基因,但是來自灰蓋鬼傘菌的漆酶2的生理生化特性研究和對(duì)染料的脫色效果的研究目前還沒有報(bào)道。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題在于提供一種來源于灰蓋鬼傘菌(Coprinopsis?cinereaokayama)的漆酶2基因及其應(yīng)用。即通過化學(xué)合成方法得到所述的漆酶2基因,并將其應(yīng)用于真核生物中進(jìn)行表達(dá)和純化,研究其生理生化特性和對(duì)甲基橙、結(jié)晶紫和孔雀石綠的脫色效果。
所述的漆酶2基因,其核苷酸序列如SEQ?ID?No1所示,它是根據(jù)畢氏酵母密碼子偏愛通過化學(xué)合成方法制得的。即采用大量重疊的引物通過兩步PCR進(jìn)行全基因的合成(PTDS)(Nucleic?Acids?Research,2004,32:e98)。該方法是通過重疊延伸獲得合成基因的片段,再通過最外側(cè)的引物將全長的基因擴(kuò)增得到。該方法的一個(gè)明顯優(yōu)勢(shì)就是不需要對(duì)引物進(jìn)行磷酸化處理。而且通過高通量的DNA合成儀器,可以較為便利地獲得大量的引物。
所述的漆酶2基因,其具體合成方法如下:
1、根據(jù)畢氏酵母密碼子偏愛設(shè)計(jì)引物
設(shè)計(jì)長度大概為60mer左右的覆蓋整個(gè)漆酶2基因的寡核苷酸的序列50個(gè),作為引物。利用PCR進(jìn)行漆酶2基因擴(kuò)增,在100μl反應(yīng)體系中,P2~P29共48個(gè)引物的添加量為2ng,外側(cè)引物P1和P50添加量為30ng,擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)熱1min;94℃30s,52℃30s,72℃1.5min,72℃10min,使用的Taq?DNA聚合酶為KOD?FX?taq酶(Toyobo公司,日本),共30個(gè)循環(huán)。
PCR結(jié)束后,1%瓊脂糖膠回收片段,取10μl直接與T/A克隆載體相連(大連寶生物公司)。4℃連接過夜,高效轉(zhuǎn)化于DH5α感受態(tài)中,獲得長度為1500bp的陽性克隆,即為本發(fā)明的漆酶2基因,其核苷酸序列如SEQ?ID?No1所示,其編碼的蛋白質(zhì)的氨基酸序列如SEQID?No2所示。
將上述制得的漆酶2基因轉(zhuǎn)入真核生物細(xì)胞中。即將該漆酶2基因直接與真核表達(dá)載體pYM7909(Molecular?Biology?Report,2012Apr;39(4):3807-14)相連,經(jīng)過DH5α克隆過的環(huán)形質(zhì)粒單酶切使其線性化,取約1μl的線性DNA與80μl畢赤酵母感受態(tài)細(xì)胞混合后進(jìn)行點(diǎn)擊轉(zhuǎn)化,然后涂布于固體SD山梨醇培養(yǎng)基(20g/L瓊脂,20g/L葡萄糖,146g/L山梨醇,SD)上,28℃繼續(xù)培養(yǎng)3天后獲得白色菌落。挑取經(jīng)測(cè)活呈陽性的畢赤酵母進(jìn)行細(xì)胞外分泌表達(dá)純化,即獲得純化后的漆酶2基因蛋白。然后對(duì)其進(jìn)行酶動(dòng)力學(xué)特性分析和生理生化特性分析。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明,本發(fā)明合成的漆酶2基因是一類應(yīng)用非常廣泛的生物用酶,通過克隆,可以高效人工合成,通過對(duì)該基因真核表達(dá)和純化,可以將其應(yīng)用于染料脫色工業(yè)生產(chǎn)中。
附圖說明
圖1為本發(fā)明的以pYM7909質(zhì)粒構(gòu)建DNA表達(dá)單元的結(jié)構(gòu)示意圖。
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