[發明專利]TALE重復單元四聚體庫的構建方法、TALEN表達載體的構建方法及其應用無效
| 申請號: | 201210580350.0 | 申請日: | 2012-12-28 |
| 公開(公告)號: | CN103146735A | 公開(公告)日: | 2013-06-12 |
| 發明(設計)人: | 張智英;張志強;李鐸;辛穎;麻麗霞;王昕;張濤;徐華榮 | 申請(專利權)人: | 西北農林科技大學 |
| 主分類號: | C12N15/63 | 分類號: | C12N15/63;C12N15/66;C40B40/02;C40B50/06;C12N15/85 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 712100 陜西省咸*** | 國省代碼: | 陜西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | tale 重復 單元 四聚體庫 構建 方法 talen 表達 載體 及其 應用 | ||
1.TALE重復單元四聚體庫的構建方法,包括下述步驟:
(1)、PCR擴增TALE單個重復單元:以TALE單個重復片段monomer?NI為模板,用TALE-F1/TALE-R1為引物PCR擴增得到TALE單體NI1、NI2、NI3、NI4;以TALE單個重復片段monomer?NG為模板,用TALE-F2/TALE-R2為引物PCR擴增得到TALE單體NG1、NG2、NG3、NG4;以TALE單個重復片段monomer?HD為模板,用TALE-F3/TALE-R3為引物PCR擴增得到TALE單體HD1、HD2、HD3、HD4;以TALE單個重復片段monomer?NN為模板,用TALE-F4/TALE-R4為引物PCR擴增得到TALE單體NN1、NN2、NN3、NN4,其中monomer?NI識別A堿基、monomer?NG識別T堿基、monomer?HD識別C堿基、monomer?NN識別G堿基;
(2)、將步驟(1)構建所得的TALE單體插入線性化pGEM-T?easy載體中,得到相應的16個TALE單體質粒pGEM-T-NI1、pGEM-T-NI2、pGEM-T-NI3、pGEM-T-NI4、pGEM-T-NG1、pGEM-T-NG2、pGEM-T-NG3、pGEM-T-NG4、pGEM-T-HD1、pGEM-T-HD2、pGEM-T-HD3、pGEM-T-HD4、pGEM-T-NN1、pGEM-T-NN2、pGEM-T-NN3和pGEM-T-NN4;
(3)、在T4DNA連接酶緩沖液中加入TALE單體質粒,同時加入BsaI內切酶和T4DNALigase進行酶切-連接反應,所述TALE單體質粒為pGEMT-Momomer1,pGEMT-Monomer2,pGEMT-Monomer3和pGEMT-Monomer4,得到含256個四聚體質粒的TALE重復單元四聚體庫,其中pGEMT-Momomer1為pGEM-T-NI1、pGEM-T-HD1、pGEM-T-NG1或pGEM-T-NN1中的一個,pGEMT-Monomer2為pGEM-T-NI2、pGEM-T-HD2、pGEM-T-NG2或pGEM-T-NN2中的一個,pGEMT-Monomer3為pGEM-T-NI3、pGEM-T-HD3、pGEM-T-NG3或pGEM-T-NN3中的一個,pGEMT-Monomer4為pGEM-T-NI4、pGEM-T-HD4、pGEM-T-NG4或pGEM-T-NN4中的一個。
2.根據權利要求1所述的TALE重復單元四聚體庫的構建方法,其特征在于,步驟(1)中PCR擴增的體系為模板1μL、正向引物1μL、反向引物1μL、10×Taq?Buffer?5μL、2.5mmol/L?dNTPs?4μL、Taq?DNApolymerase?0.5μL和H2O?37.5μL;PCR擴增的反應條件為:95℃預變性5min;95℃變性30s,54℃退火30s,72℃延伸40s,擴增30個循環;72℃延伸10min。
3.根據權利要求1所述的TALE重復單元四聚體庫的構建方法,其特征在于,所述步驟(2)中TALE單體插入線性化pGEM-T?easy載體中的具體步驟為TALE單體與末端含T堿基的線性化pGEM-T?easy載體連接,連接體系為線性化pGEM-T?easy載體1μL、TALE單體1μL、10×T4DNA酶Buffer?1μL、T4連接酶1μL和H2O?6μL。
4.根據權利要求1所述的TALE重復單元四聚體庫的構建方法,其特征在于,步驟(3)中的酶切-連接反應體系為pGEMT-Momomer12μL、pGEMT-Momomer22μL、pGEMT-Momomer32μL、pGEMT-Momomer42μL、10×T4DNA酶Buffer?2μL、BsaI?0.5μL、T4連接酶0.5μL和H2O?9μL;反應條件為首先37℃5min,16℃5min,循環30次;16℃10h;65℃20min。
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