[發明專利]Citrin缺陷病致病基因SLC25A13高頻突變篩查試劑盒

無效

• 申請號: 201210556771.X
• 申請日: 2012-12-19
• 公開（公告）號: CN103060441A
• 公開（公告）日: 2013-04-24
• 發明（設計）人: 宋元宗;張占會
• 申請（專利權）人: 暨南大學
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11
• 代理公司: 廣州市華學知識產權代理有限公司 44245
• 代理人: 裘暉;陳燕嫻

技術領域

本發明屬于生物技術領域，涉及Citrin缺陷病致病基因SLC25A13高頻突變(I型、III型、X型和XIX型)篩查引物及試劑盒。

背景技術

Citrin蛋白是由SLC25A13基因編碼的一種位于線粒體內膜上的鈣調節載體蛋白，主要在肝臟中表達。Citrin蛋白作為鈣結合性線粒體溶質載體(Aspaetate-Glutamate?Carrier,AGC)，其功能一是作為天冬氨酸的運載體向細胞質內轉運天冬氨酸，提供尿素、蛋白及核苷酸合成材料；二是作為線粒體內膜上天冬氨酸-蘋果酸屏障的組成部分向線粒體內提供還原型煙酰胺腺嘌吟二核甙酸(NADH)應用于糖的分解代謝；三是通過調節還原型煙酰胺腺嘌吟二核甙酸(NADH)的比例參與糖異生過程。

SLC25A13基因突變導致其所編碼的citrin蛋白功能不足或喪失，引發一系列生化代謝紊亂，并最終形成臨床表型及預后各不相同的以肝臟損害為突出臨床表現的常染色體隱性遺傳病-Citrin缺陷病(Citrin?Deficiency,CD)。CD主要臨床表型可分為三種，分別為Citrin缺陷導致的新生兒肝內膽汁淤積癥(NeonatalIntrahepatic?Cholestasis?caused?by?Citrin?Deficiency,NICCD,OMIM#605814)、成人發病瓜氨酸血癥II型(Adult-onset?CitrullinemiaType?II,CTLN2,OMIM#603471)和Citrin缺陷導致的生長發育落后和血脂異常(Failure?to?Thrive?and?Dyslipidemia?caused?by?Citrin?Deficiency,FTTDCD)。NICCD主要發病于新生兒或小嬰兒，以圓胖臉、肝大、黃疸及肝功能異常為主要表現，若早期干預治療大部分預后良好；CTLN2主要發病于11歲以上的兒童或是成人，以高氨血癥導致的神經精神癥狀為突出臨床表現，往往預后不良，需要肝臟移植；FTTDCD是不同于NICCD及CTLN2的一種新的臨床表現型，它主要表現為生長發育落后和血脂異常。

流行病學調查研究顯示SLC25A13基因變異頻率在中國分布呈現明顯的地區差異，長江以南地區人群SLC25A13基因突變攜帶率(1/48)明顯高于長江以北地區(1/940)，提示該病在我國有較高的發病率，尤其是長江以南及長江沿線地區。在已發現的SLC25A13基因突變類型中，I型(851del4)、III型(1638-1660dup)、X型(IVS6+5G>A)和XIX型(IVS16ins3kb)這四種突變類型約占總突變的85%，為我國人群的高頻突變類型。

Citrin缺陷病的臨床表現復雜多樣，至今尚未建立成熟的臨床和生化診斷標準，SLC25A13基因突變分析被認為是診斷該病的必要手段。以往此基因的分析主要依靠基因測序，耗時且費用高。

發明內容

本發明的首要目的在于提供Citrin缺陷病致病基因SLC25A13高頻突變(I型、III型、X型和XIX型)篩查引物。

本發明的另一目的在于提供一種Citrin缺陷病致病基因SLC25A13高頻突變篩查試劑盒。

本發明的目的通過下述技術方案實現：

Citrin缺陷病致病基因SLC25A13高頻突變篩查引物，所述的高頻突變為I型、III型、X型和XIX型突變，

I型突變的篩查引物為：

IF：5’-ggtatatttgttgcttgtgtttg-3’，IA：5’-tcttccagaggagcaatccg-3’；正常擴增片段長度為82bp，突變后擴增片段長度為78bp。

III型突變的篩查引物為：

IIIF：5’-tgttgtgtctctcctgcagg-3’，IIIA：5’-gcagtctatcactccgctgt-3’；正常擴增片段長度為123bp，突變后擴增片段長度為146bp。

X型突變的篩查引物為：

XF：5’-tgagggcttgttagatcaagat-3’，XA：5’-ttacccagacaacaaattaacct-3’；正常擴增片段長度為467bp，突變后擴增片段長度為467bp。

XIX型突變的篩查引物為：

XIXF：5’-gtatgcctgcagcatctttag-3’，XIXA：5’-tgcttcattcccaggaggga-3’；正常擴增片段長度為881bp，突變后擴增片段長度為3565bp。