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[發明專利]一種先導化合物的合成及篩選方法與試劑盒有效

專利信息
申請號: 201210555548.3 申請日: 2012-12-20
公開(公告)號: CN103882532A 公開(公告)日: 2014-06-25
發明(設計)人: 李進;江洋;陳湜;瞿慶喜;萬金橋;鐘麗娜;葛嘯虎;黃奇 申請(專利權)人: 成都先導藥物開發有限公司
主分類號: C40B40/04 分類號: C40B40/04;C40B50/04;C40B20/04;C40B70/00
代理公司: 成都高遠知識產權代理事務所(普通合伙) 51222 代理人: 李高峽;張娟
地址: 610041 四川省成都市高新區*** 國省代碼: 四川;51
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 先導 化合物 合成 篩選 方法 試劑盒
【說明書】:

技術領域

本發明涉及化學領域,特別是涉及一種先導化合物的合成及篩選方法與試劑盒。?

背景技術

自80年代末期,隨著分子生物學研究的突破—高通量篩選技術的發展,新藥開發所需要的新分子實體的數目越來越多,科學家們把注意力從尋找天然產物轉入合成大數目的化合物群——化學庫,化學庫是由諸多不同屬性的有機化合物組成的。組合化學方法是一種合成化學庫的技術,運用這項技術,不同系列的合成砌塊——反應成分有序地排列起來以組成大系列的多樣化分子實體群。組合化學合成法經常被人們稱為數字游戲,也就是如何排列眾多的合成砌塊的問題,從理論上講,組合合成的總反應產物數N是由兩個因素決定的,每一步的合成砌塊數目b和合成的步驟x,例如,對于一個三步的線性組合反應,如果每步的反應物數目分別是b1、b2、b3,那么理論上的總反應產物的數目是N=b1b2b3。組合化學研究的目標就是怎樣有效地得到這一反應的所有產物N。近年來,從固相合成到快速液相平行合成,組合化學在合成方法上取得了突破性的進展,常用的幾種合成方法有固相有機合成和液相有機合成,固相有機合成包括混合裂分法和平行合成法,液相有機合成包括多組分液相合成法和官能團轉化法。?

組合化學合成技術建立的化學庫中,產物成千上萬,甚至上億,像經典有機合成那樣一個一個的純化分離鑒定已不再可能。高通量篩選(High?throughput?screening,HTS)技術是指以分子水平和細胞水平的實驗方法為基礎,以微板形式作為實驗工具載體,以自動化操作系統執行試驗過程,以靈敏快速的檢測儀器采集實驗結果數據,以計算機對實驗數據進行分析處理,同一時間對數以千、萬計的樣品檢測,并以相應的數據庫支持整個體系運轉的技術體系。高通量篩選方法極大地提高了小分子化合物篩選的速度和效率,可以從組合化學文庫中篩選作用于靶標分子的化合物。但是,用傳統的高通量篩選方法將化合物從化學文庫中篩選出來后,純化并確定目標化合物的結構非常困難,需要的時間長,成本高,隨著化合物文庫的擴大,難度更大。?

為了解決該問題,申請號:95193518.6,發明名稱:“用標記編碼的復雜組合化學文庫”的專利申請公開了一種方法,即在合成的每個階段,?在化合物進行合成的載體(例如顆粒)上,專一地進行標記,以定義隨同該載體上化合物合成時伴隨的特定事項(通常指所加化學試劑)。所述標記使用鑒定劑分子來完成,該分子記錄合成期間載體顆粒所經歷的按順序的事項,由此提供在該載體上生產化合物的反應歷程。但是該申請并未提供實現該方法的技術方案。?

現有技術中有報道使用寡核苷酸標記化合物的合成單元,根據生物領域的常識,在常規條件下,雙鏈DNA較單鏈DNA穩定,因此通常選擇雙鏈的寡核苷酸對化合物的合成單元進行標記,如:?

公告號:EP0643778,發明名稱:“encoded?combinatorial?chemical?libraries”的專利公開了用單鏈寡核苷酸標記氨基酸或多肽的方法;公告號:US7935658,發明名稱:“methods?for?synthsis?of?encoded?libraries”的專利公開了一種用雙鏈DNA片段標記合成砌塊,形成化合物文庫的方法;申請號:WO/2010/094036,發明名稱:“METHODS?OF?CREATING?ANDSCREENING?DNA-ENCODED?LIBRARIES”的專利申請公開了用寡核苷酸標記化合物,形成化合物文庫的方法,其寡核苷酸為發卡結構的雙鏈DNA。?

但是,用雙鏈DNA標記合成砌塊或者化合物時,在連接延伸過程中,雙鏈DNA容易交聯,形成卷曲的三級結構,測序時,需要解鏈,操作較復雜,用雙鏈DNA標記三步以上的線性組合反應時,雙鏈DNA的測序結果誤差較大,導致該方法只能停留在兩維,因而只能通過增加每一步反應的合成砌塊數目來增加文庫中化合物數量,制得的化合物文庫多樣性差,不易合成得到目標化合物。?

需要尋找新的,操作簡便,結果更準確的標記方法。?

發明內容

為了解決上述問題,本發明提供了一種先導化合物的合成及篩選的試劑盒和方法,以及一種新的組合化學文庫。?

名詞解釋:?

合成砌塊(Synthetic?Building?Block),又叫合成子,是指具備各種理化性質以及特定生物化學性質的、在新藥(西藥、農藥)研發過程中必須使用的小分子化合物。?

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