[發明專利]一種改良的工業規模制造DNA的方法有效
| 申請號: | 201210549891.7 | 申請日: | 2012-12-18 |
| 公開(公告)號: | CN103865919A | 公開(公告)日: | 2014-06-18 |
| 發明(設計)人: | 邱蔚然;周潔;邱志云;祁妤琳 | 申請(專利權)人: | 南通秋之友生物科技有限公司 |
| 主分類號: | C12N15/10 | 分類號: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 上海金盛協力知識產權代理有限公司 31242 | 代理人: | 羅大忱 |
| 地址: | 226236 江蘇省*** | 國省代碼: | 江蘇;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 改良 工業 規模 制造 dna 方法 | ||
技術領域:
本發明涉及一種制造高純度DNA的方法。
背景技術:
小牛胸腺、魚類精子和植物種子的胚等含有豐富的DNA,是提取DNA的良好材料。從培養微生物著手,然后從微生物中提取DNA亦有報道,但尚未用于工業生產。故而,從小牛胸腺,或魚類精子(魚白)提取DNA的方法是目前工業規模制造DNA的主要方法。
一般制備方法是首先將新鮮(或冰凍)小牛胸腺或魚白先去除血水和結締組織,在冰浴上切成小塊,加緩沖液洗滌后用組織搗碎機(8000轉/分-12000轉/分)搗碎,用含0.14mol/L氯化鈉的檸檬酸緩沖液,洗滌多次,去除核糖核蛋白,然后獲得脫氧核糖核蛋白(或細胞核)。在工業制備時至少投料100KG或更多原料,故將只有幾十克小牛胸腺或魚白的血水、結締組織去除干凈是很困難的,特別是原料從外地,外單位采購時,一般都是冰凍的,里面夾雜雜質是必然的。另外組織搗碎機只能在實驗室使用,這些都是工業生產難關。本發明根據動物細胞特別是小牛胸腺、魚類精子等動物細胞因為沒有細胞壁,而且細胞較易破碎的特點。采用絞肉機破碎細胞,然后用緩沖液洗滌離心,很容易將脫氧核糖核蛋白或細胞核提取出來,血水可通過緩沖液洗滌時去除、結締組織用10-80目尼龍網或鋼絲網過濾便可留存在網上而去除。這樣可克服原料處理不好而帶來的影響。
在去蛋白時,由于考慮到成本和安全,工業生產一般不采用苯酚法提取DNA。大都采用SDS等去污劑使蛋白變性的方法。但此辦法,由于工業生產規模大,不可能非常嚴格地在低溫操作或保證DNA絕對不降解,工業制備DNA分子量相對要小一些。故而按照以前方法,在加入乙醇后,往往DNA沉淀不下來,而且得率和純度很低。
DNA制備方法很多,但大都是實驗室技術。例如文獻(1)《生化實驗方法和技術》(第二版,高等教育出版社)介紹的方法。即利用動物組織的脫氧核糖核蛋白可溶于水或鹽溶液(如1mol/L氯化鈉),但在0.14mol/L鹽溶液中溶解度很低,而核糖核蛋白則溶于0.14mol/L鹽溶液中,利用這一性質可將脫氧核糖核蛋白與核糖核蛋白以及其他雜質分開。分離得到脫氧核糖核蛋白后,再進一步將蛋白質等雜質除去。
經常采用的去除蛋白方法有三種:(1)用含辛醇或異戊醇的氯仿振蕩核蛋白溶液,使乳化,然后離心除去變性蛋白質,此時蛋白質凝膠停留在水相及氯仿相中間,而DNA溶于上層水相。用兩倍體積95%乙醇可將DNA鈉鹽沉淀出來。如果用酸性乙醇或冰乙酸來沉淀,得到的是游離DNA。(2)用十二烷基硫酸鈉(SDS)等去污劑使蛋白質變性,可以直接從生物材料中提取DNA。(3)苯酚法:用苯酚處理,然后離心分層,DNA或溶于上層水相中,或存在于中間殘留物中,蛋白質變性后停留在酚層內。由于苯酚能使蛋白質迅速變性,因而抑制了核酸酶活性,并且操作過程比較緩和,可以得到較好的DNA制品,所以實驗室除去蛋白的方法一般都采用苯酚法。
在采集小牛胸腺和魚類精子原料時,小牛胸腺往往會有較多結締組織、血水等雜質,而魚類精子較為干凈,雜質較少。故而國內外大都采用魚類精子提取DNA,一般國外產品可達85-90%含量,而國內一般只有70%左右。而用小牛胸腺制備因難度較高,故而未見產品供應。
發明內容:
本發明的目的是提供一種改良的工業規模制造高純度DNA的方法,以克服現有技術存在的缺陷。
本發明的方法,包括如下步驟:
將十二烷基硫酸鈉SDS解離后的DNA溶液,加入1-2mol/L?NaOH,調節pH至堿性,優選的,pH為8.5~12.0,特別優選的為10.0、11.0,靜置1-2小時,離心收集清液,加入1-2mol/L?HCL,將清液調pH至7.0~7.5,優選7.0,再加入等量95%酒精沉淀,收集沉淀,洗滌干燥,即可獲得所述的產品DNA,含量(W/W)可達91%。
所述DNA溶液的制備方法為常規的,如文獻:“生化實驗方法和技術”,(第二版,高等教育出版社)介紹的方法;
所述DNA來源于小牛胸腺、魚類精子(或魚白);
術語“加入等量95%酒精”,指的是pH7.0-7.5清液與95%酒精體積之比;
優選的,在制備脫氧核糖核蛋白時,考慮到沉淀量較多,工業生產時,可采用碟片式離心機;
而第二次去蛋白時沉淀量較少,離心時可采用高速管式離心機,這樣可以獲得較好效果,縮短操作時間,并提高收率。
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