[發明專利]基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統和處理方法有效
| 申請號: | 201210513156.0 | 申請日: | 2012-12-04 |
| 公開(公告)號: | CN102934986A | 公開(公告)日: | 2013-02-20 |
| 發明(設計)人: | 李躍杰;趙金城;徐秋晶;劉巧艷;王立偉 | 申請(專利權)人: | 天津邁達醫學科技股份有限公司 |
| 主分類號: | A61B3/14 | 分類號: | A61B3/14 |
| 代理公司: | 天津市北洋有限責任專利代理事務所 12201 | 代理人: | 杜文茹 |
| 地址: | 300384 天津市南開*** | 國省代碼: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 基于 gpu 平臺 眼科 oct 系統 處理 方法 | ||
1.一種基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統,包括:依次連接的SLD光源(1)、光循環器(2)、光纖分束器(3)、第一偏振控制器(4)和參考臂(5),所述的光循環器(2)或光纖分束器(3)還連接第二偏振控制器(6),第二偏振控制器(6)又依次連接光譜儀(10)、高速相機數據線(14)、高速圖像采集卡(15)和計算機(16),所述的光纖分束器(3)還依次連接第三偏振控制器(7)和與被測眼(9)相連的樣品臂(8),所述的計算機(16)分別連接樣品臂(8)和圖像顯示單元(17),其特征在于,所述的計算機(16)還連接GPU圖像處理器(18)。
2.根據權利要求1所述的基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統,其特征在于,所述的計算機(16)是通過PCIE總線連接GPU圖像處理器(18)。
3.根據權利要求1所述的基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統,其特征在于,所述的參考臂(5)包括有依次連接的第一準直鏡(51)、參考臂光學組件(52)和反射鏡(53),其中,所述的第一準直鏡(51)的另一端連接第一偏振控制器(4)。
4.根據權利要求1所述的基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統,其特征在于,所述的樣品臂(8)包括有依次連接的第二準直鏡(81)、3D掃描振鏡(82)和眼部監測光學組件(83),其中,所述的第二準直鏡(81)另一端連接第三偏振控制器(7),所述的眼部監測光學組件(83)用于連接被測眼(9)。
5.根據權利要求1所述的基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統,其特征在于,所述的光譜儀(10)包括有依次連接的第三準直鏡(101)、光柵(102)、光譜儀透鏡組件(103)和線陣相機(104),其中,所述的第三準直鏡(101)還連接第二偏振控制器(6),所述的線陣相機(104)連接高速相機數據線(14)。
6.一種權利要求1所述的基于GPU平臺的眼科頻域OCT系統的處理方法,其特征在于,
首先規定:FrameNumber代表幀數,要處理的數據塊的大小為FrameNumber個B-scan數據量,每個B-scan由batch個A-scan組成;假設一次處理n*batch個A-scan,即n個B-scan,則共需要處理FrameNumber/n次;采樣數據f(λ,y)是由光譜儀里的線陣相機采集到、并經計算機里的圖像采集卡進行A/D轉換后的數據,是波長的函數,其中橫坐標為波長λ,縱坐標為數值y;該方法包括如下步驟:
1)對采樣數據f(λ,y)進行λ空間到k空間轉換,求出k值和kes值,將采樣數據塊f(k,y)、k和kes存儲在計算機內存中,為結果數據reslut分配內存;
2)初始化設j為1,j代表第j次處理,假設每次處理n*batch個A-Scan;
3)第j次處理開始時,為n個B-Scan所包含的n*batch個A-Scan的k、kes和fij(k,y)分配device端顯存空間,將k、kes和fij(k,y)從host端內存拷貝到device端顯存;為device端計算過程中的中間變量分配顯存;i為第j次處理的第i個A-Scan的序數;
4)并行將n*batch個A-Scan的fij(k,y)進行數據類型轉換和去噪運算,得到fij′(k,y);
5)并行將n*batch個A-Scan的fij′(k,y)進行三次樣條插值運算優化,通過迭代參量的預處理,將參與迭代運算的中間常量數組直接由內存導入迭代過程,經插值運算得到k空間等間隔化的值fij′(kes,y′);
6)調用CUFFT庫函數并行對n*batch個A-Scan的fij′(kes,y′)進行FFT變換,得到相應的Fij′(kes,Y′);
7)并行對n*batch個Fij′(kes,Y′)取模取對數進行歸一化,得到相應的log10|Fij′(kes,Y′)|,并將其按順序存儲在體積數組log10|F′(kes,Y′)|中,釋放device端計算過程中的中間變量空間;
8)設j=j+1;
9)判斷j>FrameNumber/n,是則進入下一步驟,否則返回第3)步驟;
10)根據不同成像平面的需要,抽取體積數組數據或對體積數組數據計算作為GPU結果數據result;
11)將result從device端拷貝回host端,并送到顯示器顯示,釋放所有未釋放的內存和顯卡空間。
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