[發明專利]一種ROS1融合基因的篩查方法有效
| 申請號： | 201210507409.3 | 申請日： | 2012-11-30 |
| 公開（公告）號： | CN103352070A | 公開（公告）日： | 2013-10-16 |
| 發明（設計）人： | 陳海泉;孫藝華;王瑞;潘云建;胡海川;王磊;葉挺;羅曉陽;李航;張揚 | 申請（專利權）人： | 復旦大學附屬腫瘤醫院 |
| 主分類號： | C12Q1/68 | 分類號： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 上海元一成知識產權代理事務所(普通合伙) 31268 | 代理人： | 吳桂琴 |
| 地址： | 200032 *** | 國省代碼： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 ros1 融合 基因 方法 | ||
1.一種ROS1融合基因突變的篩查方法，其特征在于，其包括如下步驟：
（1）設計篩查ROS1融合基因的11對real-time?PCR聯合引物對或探針；
（2）提取樣本中的總RNA；
（3）以樣本中的總RNA為模板，通過逆轉錄方法合成cDNA；
（4）在11個real-time?PCR反應單位中，以（3）中所得的cDNA為模板，分別加入（1）中設計的11對引物或探針，以及包括熒光染料在內的反應預混液；
（5）在real-time?PCR反應儀上進行real-time?PCR反應，并分別記錄每個樣本的10個反應單位的熒光閾值；
（6）分別計算引物或探針I～IV所在反應體系的熒光閾值的均值CtABP，和引物或探針VI~XI所在反應體系的熒光閾值的均值CtBBP；
（7）計算ABP與BBP之差的絕對數，判定樣本是否具有ROS1融合基因突變。
2.按權利要求1所述的方法，其特征在于，所述的聯合引物對或探針的核苷酸編碼序列如SEQ?ID?NO?1-22所示。
3.按權利要求1所述的方法，其特征在于，所述的步驟（7）中，結果的判定標準為：
有ROS1融合基因：|CtABP-CtBBP|≥1.5；
無ROS1融合基因：|CtABP-CtBBP|<1.5。
4.按權利要求1所述的方法，其特征在于，所述的融合基因是ROS1融合基因。
5.SEQ?ID?NO?1-22的real-time?PCR聯合引物對或探針在制備篩查ROS1融合基因突變的制劑中的用途。
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