[發明專利]一種基因蛋白質序列關系分析系統及方法

無效

• 申請號: 201210492701.2
• 申請日: 2012-11-27
• 公開（公告）號: CN102968577A
• 公開（公告）日: 2013-03-13
• 發明（設計）人: 史衛峰;柏佳寧;李先斌;凌誠;郭雪平;鄭為民;黃錫鴻
• 申請（專利權）人: 廣州中國科學院先進技術研究所
• 主分類號: G06F19/16
• 分類號: G06F19/16
• 代理公司: 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205
• 代理人: 譚英強

1.一種基因蛋白質序列關系分析系統，其特征在于，包括：

文件選擇模塊，用于選擇要讀取的文件；

序列文件分析模塊，用于對序列文件進行分析；

序列距離分析模塊，用于計算序列間的距離，得出距離關系矩陣；

MDS分析模塊，用于對距離關系矩陣進行分析；

結果顯示模塊，用于對分析的結果進行分類和顯示。

2.根據權利要求1所述的一種基因蛋白質序列關系分析系統，其特征在于：所述的序列文件分析模塊包括：

文件讀取模塊，用于讀取序列文件；

頭文件分析模塊，用于將頭文件存入數據結構，并對其進行分隔；

字段選擇模塊，用于選擇后續結果顯示時需要的字段。

3.根據權利要求1所述的一種基因蛋白質序列關系分析系統，其特征在于：所述的MDS分析模塊包括：

算法選擇模塊，用于選擇要調用的算法；

降維模塊，用于對距離關系矩陣進行降維。

4.根據權利要求1所述的一種基因蛋白質序列關系分析系統，其特征在于：所述的結果顯示模塊包括：

標識選擇模塊，用于選擇標識的形狀和顏色；

序列顯示模塊，用于以選擇的形狀和顏色標識出各個序列在二維坐標系中的位置；

序列分類模塊，用于對序列進行分類。

5.一種基因蛋白質序列關系分析方法，其特征在于，包括以下步驟：

A、選擇要讀取的文件；

B、對序列文件進行分析；

C、計算序列間的距離，得出距離關系矩陣；

D、對距離關系矩陣進行分析；

E、對分析的結果進行分類和顯示。

6.根據權利要求5所述的一種基因蛋白質序列關系分析方法，其特征在于：所述的步驟B包括：

B1、讀取序列文件；

B2、將頭文件存入數據結構，并對其進行分隔；

B3、選擇后續結果顯示時需要的字段。

7.根據權利要求5所述的一種基因蛋白質序列關系分析方法，其特征在于：所述的步驟D包括：

D1、選擇要調用的算法；

D2、對距離關系矩陣進行降維。

8.根據權利要求5所述的一種基因蛋白質序列關系分析方法，其特征在于：所述的步驟E包括：

E1、選擇標識的形狀和顏色；

E2、以選擇的形狀和顏色標識出各個序列在二維坐標系中的位置；

E3、對序列進行分類。