[發明專利]同步檢測TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法無效
| 申請號: | 201210492173.0 | 申請日: | 2012-11-28 |
| 公開(公告)號: | CN102952901A | 公開(公告)日: | 2013-03-06 |
| 發明(設計)人: | 李凡;劉芳;陳海如;譚冠林;蘭平秀;王海寧;李曉靜;朱靜;吳德喜;蔡紅 | 申請(專利權)人: | 云南農業大學 |
| 主分類號: | C12Q1/70 | 分類號: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/94 |
| 代理公司: | 暫無信息 | 代理人: | 暫無信息 |
| 地址: | 650201 云南*** | 國省代碼: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 同步 檢測 tbtv tvdv sat tvdvarna 方法 | ||
1.同步檢測TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法,其特征在于,同步檢測按照下面步驟進行:
(1)引物設計合成:
(a)分別設計合成檢測TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的正向引物TBTVdF、TVDVdF、SatTBTVdF和TVDVaRNAdF,引物序列如下:
TBTVdF:5’-TACCACACCTAAACAGCGTTG-3’,
TVDVdF:5’-GCAACAGCGAGACTTTCATCT-3’,
SatTBTVdF:5’-TGTTGGCCGTGGGCAGCAA-3’,
TVDVaRNAdF:5’-GCGTACTGCGGAAGTCTCAC-3’,
????(b)分別設計合成檢測TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的反向引物TBTVdR、TVDVdR、SatTBTVdR和TVDVaRNAdR,引物序列如下:
?????TBTVdR:5’-CTCATCTCCCGCTAAGTCAG-3’,
?????TVDVdR:5’-CRTTGCCTTTATAGAGCAGCC-3’,其中,序列中的R=A或G,
?????SatTBTVdR:5’-TTCGTATTTGGCTCCGTCGC-3’,
TVDVaRNAdR:5’-TGTACTGGAGTGCTTCAACCG-3’;
?(2)CTAB法提取染病植物組織或傳毒介體昆蟲的總核酸,作為RT-PCR擴增模板;
?(3)一步法RT-PCR擴增;
(4)電泳檢測;
(5)檢測結果分析:根據每對引物擴增片段大小與病毒的關系,觀察感染TBTV、TVDVaRNA、Sat-TBTV和TVDV的煙草材料或傳毒介體昆蟲中檢測到的不同核酸帶,判斷發病煙草或傳毒介體昆蟲中具體感染的TBTV、TVDVaRNA、Sat-TBTV和TVDV?病原物的種類。
2.根據權利要求1所述的同步檢測TBTV、TVDV、Sat-TBTV和TVDVaRNA的方法,其特征在于,所述CTAB法提取感病植物組織或傳毒介體昆蟲的總核酸,步驟如下:
第一步、樣品準備
(1)感病植物組織準備:將3~5片病葉疊加在一起,稱取50~100?mg至研缽中;
(2)傳毒介體昆蟲準備:取30~50頭蚜蟲至研缽中;
第二步、加入1.2?mL的CTAB緩沖液,該緩沖液由質量百分比為2%的CTAB、2%的PVP-40以及pH?8.0的100?mM的Tris-HCl、1.4?M的?NaCl和20?mM?的EDTA組成混合液,最后根據混合溶液的體積加入0.2%巰基乙醇;
第三步、恒溫處理:充分研磨后,轉入1.5?mL的離心管中,在65℃溫浴下處理15~60?min;
第四步、離心處理:首先,將離心管放入離心機中12000~13000?r/min離心處理15?min,取750?μL上清液至另一1.5?mL的離心管,加入750?μL體積比為24∶1的氯仿:異戊醇,渦旋震蕩混勻30?s;然后,再將裝有上清液的離心管放入離心機中12000~13000?r/min離心處理10?min,接著,用微量移液器吸取600?μL上清液至又一1.5?mL的離心管中,并加入600?μL異丙醇,顛倒離心管充分混勻液體,室溫下放置10?min,最后將裝有上清液和異丙醇的離心管放入離心機中12000~13000?r/min離心處理15?min,用微量移液器吸出上清液;沉淀部分加入500?μL?70%?的乙醇,并放入離心機中12000~13000?r/min離心處理10?min;?
第五步、干燥:用微量移液器吸出液體,沉淀部分在20℃~25℃條件下自然干燥10~15?min;
第六步、溶解:加入100?μL?20?mmol/L?pH?8.0的Tris-HCl并置于冰上10?min,用微量移液器吹打5~10次使沉淀部分充分溶解;
第七步、保存:核酸沉淀溶解液-20℃保存備用;或者將所獲得的總核酸以干粉狀態放入-80℃進行長期保存備用。
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