[發明專利]ALK融合基因檢測的PCR引物、試劑盒和液相芯片

有效

• 申請號: 201210448636.3
• 申請日: 2012-11-09
• 公開（公告）號: CN103805687A
• 公開（公告）日: 2014-05-21
• 發明（設計）人: 陳昌華;陳菲;許昌有
• 申請（專利權）人: 益善生物技術股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/68
• 分類號: C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06
• 代理公司: 廣州華進聯合專利商標代理有限公司 44224
• 代理人: 萬志香

1.一種檢測ALK融合基因的PCR引物，其特征是，所述PCR引物為：針對K15;DEL15A20的SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.2、針對K17;A20的SEQ?ID?NO.1和SEQ?IDNO.3、針對K9;A20的SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.4、針對T6;A20的SEQ?ID?NO.1和SEQ?IDNO.5、和/或針對T3;A20的SEQ?ID?NO.1和SEQ?ID?NO.6。

2.一種檢測ALK融合基因的PCR試劑盒，其特征是，包括有權利要求1所述的PCR引物。

3.根據權利要求2所述的PCR試劑盒，其特征是，所述PCR試劑盒還包括有陽性對照品，所述陽性對照品為：針對K15;DEL15A20的含有SEQ?ID?NO.1和與SEQ?ID?NO.2反向互補配對的序列的核酸片段、針對K17;A20的含有SEQ?ID?NO.1和與SEQ?ID?NO.3反向互補配對的序列的核酸片段、針對K9;A20的含有SEQ?ID?NO.1和與SEQ?ID?NO.4反向互補配對的序列的核酸片段、針對T6;A20的含有SEQ?ID?NO.1和與SEQ?ID?NO.5反向互補配對的序列的核酸片段、和/或針對T3;A20的含有SEQ?ID?NO.1和與SEQ?ID?NO.6反向互補配對的序列的核酸片段。

4.根據權利要求3所述的PCR試劑盒，其特征是，所述陽性對照品為針對K15;DEL15A20的SEQ?ID?NO.7、針對K17;A20的SEQ?ID?NO.8、針對K9;A20的SEQ?ID?NO.9、針對T6;A20的SEQ?ID?NO.10、和/或針對T3;A20的SEQ?ID?NO.11。

5.一種檢測ALK融合基因的液相芯片，其特征是，包括有：

（A）權利要求1所述的PCR引物；

（B）.針對ALK融合基因不同融合類型分別設計的ASPE引物：每條ASPE引物由5’端的tag序列和3’端針對目的融合類型的特異性引物序列組成，所述特異性引物序列為：針對K15;DEL15A20的SEQ?ID?NO.12、針對K17;A20的SEQ?ID?NO.13、針對K9;A20的SEQ?IDNO.14、針對T6;A20的SEQ?ID?NO.15、和/或針對T3;A20的SEQ?ID?NO.16；所述tag序列選自SEQ?ID?NO.17-SEQ?ID?NO.26；

（C）.有anti-tag序列包被的、具有不同顏色編碼的微球，所述anti-tag序列與微球連接中間還設有間隔臂序列；所述anti-tag序列選自SEQ?ID?NO.27-SEQ?ID?NO.36，且所述anti-tag序列能相應地與（B）中所選的tag序列互補配對。

6.根據權要求5所述的液相芯片，其特征是，所述ASPE引物為：針對K15;DEL15A20的由SEQ?ID?NO.17和SEQ?ID?NO.12組成的序列、針對K17;A20的由SEQ?ID?NO.18和SEQ?IDNO.13組成的序列、針對K9;A20的由SEQ?ID?NO.19和SEQ?ID?NO.14組成的序列、針對T6;A20的由SEQ?ID?NO.20和SEQ?ID?NO.15組成的序列、和/或針對T3;A20的由SEQ?ID?NO.21和SEQID?NO.16組成的序列。

7.根據權利要求5或6所述的液相芯片，其特征是，所述間隔臂為5-10個T。

8.一種用于檢測ALK融合基因的特異性引物，其特征是，所述特異性引物為：針對K15;DEL15A20的SEQ?ID?NO.12、針對K17;A20的SEQ?ID?NO.13、針對K9;A20的SEQ?IDNO.14、針對T6;A20的SEQ?ID?NO.15、和/或針對T3;A20的SEQ?ID?NO.16。