[發(fā)明專利]一種生物信息學(xué)高性能計算平臺的信息化管理設(shè)計方法

無效

• 申請?zhí)枺?/td>: 201210439757.1
• 申請日: 2012-11-07
• 公開（公告）號: CN102982409A
• 公開（公告）日: 2013-03-20
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 金蓮
• 申請（專利權(quán)）人: 浪潮電子信息產(chǎn)業(yè)股份有限公司
• 主分類號: G06Q10/06
• 分類號: G06Q10/06
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

1.?一種生物信息學(xué)高性能計算平臺的信息化管理設(shè)計方法,?其特征在于內(nèi)容包括：項目管理模塊設(shè)計、樣品管理模塊設(shè)計、實驗管理模塊設(shè)計、用戶及權(quán)限管理模塊，其中：

1）項目管理模塊設(shè)計：課題項目，以下簡稱項目，是實驗室運作的核心,所有實驗的操作流程和數(shù)據(jù)都以項目為中心進(jìn)行組織的，樣品、人員、實驗室資源也按項目劃分，因此絕大多數(shù)數(shù)據(jù)存儲部分都和項目的編號關(guān)聯(lián)，系統(tǒng)為每個項目提供一系列配套功能，包括選擇樣品、人員和分配權(quán)限，查看所屬項目的實驗，實現(xiàn)項目管理，明確項目的具體資源，以便根據(jù)情況合理分配資源，大型的生物實驗室擁有許多個大型項目，一個大型項目或包含多個子項目，不同項目之間有些數(shù)據(jù)需要保密，不對外部公開，針對這種情況，項目管理模塊被設(shè)計成為項目組及項目二級結(jié)構(gòu)管理模式，即一個項目組包含多個不同的項目，有不同的權(quán)限設(shè)置，在項目里允許查看本項目下正在進(jìn)行的測序?qū)嶒灹骱透鱾€實驗的進(jìn)行狀態(tài)，這一設(shè)計針對大型實驗室人員多、項目多，需要進(jìn)行分類管理的實際情況而產(chǎn)生，在這種設(shè)計下，能夠更有效地管理大量不同類型的測序?qū)嶒?，提高實驗?shù)據(jù)導(dǎo)入及查看的效率；

2）樣品管理模塊設(shè)計：用來管理測序?qū)嶒灥膶嶒瀸ο?，對實驗室樣品的管理是實驗室信息管理中非常重要，而又容易被忽視的一個環(huán)節(jié)，實驗人員更關(guān)注實驗中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，但是在測序?qū)嶒炛?，需要把每條測序數(shù)據(jù)回溯關(guān)聯(lián)到樣品上，一旦測序數(shù)據(jù)出現(xiàn)異常，還需要能找到相關(guān)樣品重新進(jìn)行測序，因此，加強樣品管理環(huán)節(jié)，項目的樣品首先要添加入樣品庫中，并且在本系統(tǒng)中與相應(yīng)的項目關(guān)聯(lián)起來后，才能開始創(chuàng)建實驗并進(jìn)行實驗數(shù)據(jù)的管理；

3）實驗管理模塊設(shè)計：實驗管理模塊用于控制實驗室的實驗流程，管理每個實驗產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，并保證所有數(shù)據(jù)的可回溯性，實驗管理模塊需要具備任務(wù)分配，信息通訊，數(shù)據(jù)存儲的功能，在實驗管理模塊設(shè)計中，我們引入了實驗鏈的概念，每個項目包括多個實驗鏈，一個實驗鏈?zhǔn)怯汕昂箜樞蚺帕械亩鄠€實驗組成，一個實驗完成后，由實驗人員根據(jù)具體要求制定并建立下一個實驗，這樣就保證實驗流程不會混亂，并且實驗數(shù)據(jù)能夠關(guān)聯(lián)起來，實驗鏈中每個實驗允許有未確認(rèn)，已建立，已完成狀態(tài)；為了跟蹤一個樣品從進(jìn)入實驗鏈到得出最終測序結(jié)果這個過程，并進(jìn)行有效的數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)與整合，需要制訂實驗數(shù)據(jù)的命名格式規(guī)范；

4）用戶及權(quán)限管理模塊：權(quán)限管理模塊對LIMS系統(tǒng)中保存數(shù)據(jù)的安全性負(fù)責(zé)，數(shù)據(jù)的安全性體現(xiàn)在兩個方面：數(shù)據(jù)保密性，數(shù)據(jù)安全性，為了滿足這些數(shù)據(jù)安全性方面的需求，用戶及權(quán)限管理模塊要求系統(tǒng)使用者必須經(jīng)過注冊并經(jīng)過管理人員確認(rèn)才能夠使用本系統(tǒng)，每個注冊用戶被管理人員根據(jù)其工作職權(quán)授予相應(yīng)的角色。