[發明專利]肽微陣列及使用方法

有效

• 申請號: 201210427378.0
• 申請日: 2012-10-31
• 公開（公告）號: CN103122486A
• 公開（公告）日: 2013-05-29
• 發明（設計）人: 王巍;許崢
• 申請（專利權）人: 加利福尼亞大學董事會
• 主分類號: C40B40/10
• 分類號: C40B40/10;G01N33/68
• 代理公司: 北京安信方達知識產權代理有限公司 11262
• 代理人: 申基成;鄭霞

1.一種包含固體載體表面和多種預測的獨特結合肽的肽微陣列，所述結合肽被預合成并且通過接頭固定在所述固體載體表面上，其中所述預測的獨特結合肽通過與目標蛋白質或其結構域相互作用的計算預測而被選出以用于所述微陣列。?

2.如權利要求1所述的肽微陣列，其中100個與1000個之間的預測的獨特結合肽被固定在所述固體載體表面上。?

3.如權利要求1所述的肽微陣列，其中所述接頭是氨基己酸(Ahx)或聚乙二醇(PEG)。?

4.如權利要求1所述的肽微陣列，其中至少一種預測的獨特結合肽被甲基化或乙酰化。?

5.如權利要求1所述的肽微陣列，其中所述預測的獨特結合肽在每一端用丙氨酸加帽。?

6.如權利要求1所述的肽微陣列，其中所述計算預測包括至少三種分析途徑的組合，所述分析途徑選自由以下組成的組：結構信息、所述肽-蛋白質相互作用的能量模式、分子動力學模擬、進化過程中的保守、突變、亞細胞定位、功能性過濾過程、蛋白質組掃描以及質譜證據。?

7.一種鑒定與目標蛋白質或其結構域相互作用的一種或多種結合肽的方法，所述方法包括：?

a)為針對所述目標蛋白質或其結構域的預測的獨特結合肽提供計算預測；?

b)基于所述計算預測選擇多種預測的獨特結合肽；?

c)產生包含所述多種預測的獨特結合肽的肽微陣列，所述結合肽被預合成并且通過接頭固定在固體載體表面上；?

d)將所述微陣列暴露于所述目標蛋白質或其結構域；以及?

e)在所述微陣列上檢測預測的結合肽與所述目標蛋白質或其結構域的相互作用，從而鑒定與目標蛋白質或其結構域相互作用的一種或多種結合肽。?

8.如權利要求7所述的方法，其中所述計算預測包括至少三種分析途徑的組合，所述分析途徑選自由以下組成的組：結構信息、所述肽-蛋白質相互作用的能量模式、分子動力學模擬、進化過程中的保守、突變、亞細胞定位、功能性過濾過程、蛋白質組掃描以及質譜證據。?

9.如權利要求7所述的方法，其中100個與1000個之間的預測的獨特結合肽被固定在所述固體載體表面上。?

10.如權利要求7所述的方法，其中所述接頭是氨基己酸(Ahx)或聚乙二醇(PEG)。?

11.如權利要求7所述的方法，其中至少一種預測的獨特結合肽被甲基化或乙酰化。?

12.如權利要求7所述的方法，其中所述預測的結合肽在每一端用丙氨酸加帽以便穩定在所述固體載體表面上的固定。?

13.如權利要求7所述的方法，其中所述目標蛋白質或其結構域被甲基化或乙酰化。?

14.如權利要求7所述的方法，其中所述檢測包括熒光信號的檢測，所述熒光信號與結合親和力相關并且提供所述結合肽與所述目標蛋白質或其蛋白質結構域之間相互作用的定量測量。?

15.如權利要求7所述的方法，其中所述結合肽-蛋白質相互作用是瞬時相互作用。?

16.如權利要求1所述的肽微陣列的用途，其用于表位定位。?

17.如權利要求1所述的肽微陣列的用途，其用于藥物篩選或疫苗開發。?

18.如權利要求1所述的肽微陣列的用途，其與多種計算預測組合用于鑒定修飾肽。?

19.如權利要求18所述的肽微陣列的用途，其中所述修飾肽是甲基化的或乙酰化的肽，這些肽對應于調節賴氨酸甲基化的翻譯后修飾(PTM)蛋白質。?