[發明專利]一種產氣腸桿菌特異性PCR檢測引物有效
| 申請號: | 201210412342.5 | 申請日: | 2012-10-25 |
| 公開(公告)號: | CN102952880A | 公開(公告)日: | 2013-03-06 |
| 發明(設計)人: | 陳雪峰;楊國梁;王軍毅;高強;張宇飛;黃雪娜 | 申請(專利權)人: | 浙江省淡水水產研究所 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68;C12Q1/10;C12N15/11 |
| 代理公司: | 湖州金衛知識產權代理事務所(普通合伙) 33232 | 代理人: | 裴金華;戴心同 |
| 地址: | 313000 浙江省湖州市吳*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 產氣腸桿菌 特異性 pcr 檢測 引物 | ||
技術領域
本發明涉及一種用于檢測的引物,具體涉及一種用于檢測產氣腸桿菌?PCR檢測的引物,屬于生物檢測技術領域。
背景技術
產氣腸桿菌(Enterobacter?aerogenes)為革蘭氏陰性菌,主要存在于人和動物的腸道內,亦可存在水、土壤及腐敗物中,同時它也是一種重要的條件致病菌。當宿主機體狀態改變或細菌進入腸道以外的部位,往往會引起感染。近年來,由于第三代和第四代頭孢菌素、碳青酶烯類等超廣譜抗菌藥物在臨床上的廣泛使用,使該菌的耐藥菌株明顯增多,有些菌株已經表現為多重耐藥。多重耐藥使得臨床上對該菌引起的疾病的治療趨于復雜化。多重耐藥的一個主要原因是未能在第一時間辨明病原菌,在不明病原菌的情況下,濫用藥物,從而導致細菌的耐藥性的出現,導致多重耐藥的產生。因此,臨床上迫切需要一種快速、精準的檢測手段,辨明病原,從而針對性地防治。
傳統的細菌鑒定方法主要是通過細菌生理生化特性進行分類,需要大量的時間進行生理生化反應的結果判讀,不利于及時診斷病因,查找病原。PCR技術具有操作簡便、快速、靈敏度高、特異性強等特點,已逐步應用于細菌的快速檢測。然而,通過對現有技術的文獻檢索發現,目前尚未有利用PCR技術檢測產氣腸桿菌的報道。
發明內容
?本發明的目的在于提供一種產氣腸桿菌特異性PCR檢測引物。該引物可用于產氣腸桿菌的PCR檢測,具有檢測時間短,成本低,檢測結果特異性高,結果易判斷,實用性強。
本發明是通過以下的技術方案實現的:
一種產氣腸桿菌特異性PCR檢測引物,包括正向引物和反向引物:
正向引物F:5’-GTAACCGGTGAAACCGAAAGC-3’
反向引物R:5’-?GATGCCGCCTTCGTAGTGGAAATGG?-3’。
所述引物在用于產氣腸桿菌的PCR檢測時,具體如下操作:
步驟一,提取樣品DNA,PCR法擴增;
PCR檢測體系為20?μL的反應體系,具體為:
10×PCR?buffer(含Mg2+)????2?μL,
2.5mmol/L的dNTP???????1.6?μL,
5?U/μL?的rTaq酶????????0.16?μL,
20?μM的引物對??????????0.8?μL,
模板DNA???????????????1-2?μL,
最后用滅菌雙蒸水補至20?μL;
PCR檢測反應程序為:94℃預變性4min;進入循環,94℃變性30s,58℃退火30s,72℃延伸45s,30個循環;72℃延伸5min,降溫至4℃,結束。
步驟二,取10μL?PCR擴增產物,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,判斷樣品種是否含有產氣腸桿菌;所述判斷具體為:1%凝膠電泳電泳檢測擴增產物,若電泳結果在201bp出現單一條帶,則說明樣品種含有產氣腸桿菌;反之,則樣品中不含產氣腸桿菌。
與現有技術相比,本發明具有如下的有益效果:采用本發明的檢測方法檢測產氣腸桿菌所需時間短、特異性強、靈敏度高。本發明避免了采用傳統鑒定方法操作繁瑣、耗時長、準確性低、檢出率低等缺點。同時,本發明所涉及的儀器設備、試劑等較為常用,一般基層實驗室即可開展檢測工作,實用性更強。本發明檢測靶點具有單一特異性,檢測結果特異,易于判定。?
附圖說明
圖1為實施例中PCR檢測方法特異性評估實驗凝膠電泳結果圖;
圖2為實施例中PCR檢測方法靈敏度評價實驗凝膠電泳結果圖;
圖3為實施例中臨床樣品檢測凝膠電泳結果圖。?
具體實施方式
下面結合具體實施例,進一步闡述本發明。應理解,這些實施例僅用于說明本發明而不用于限制本發明的范圍。實施例中未注明具體條件的實驗方法,通常按照常規條件例如Sambrook等分子克隆:實驗室手冊(New?York:Cold?Spring?Habor?Laboratory?Press,1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。
步驟一,設計特異性擴增產氣腸桿菌的引物對
引物序列為:?F:5’-GTAACCGGTGAAACCGAAAGC-3’
R:5’-?GATGCCGCCTTCGTAGTGGAAATGG?-3’;
步驟二,DNA模板制備
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