[發明專利]與黃瓜果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記

有效

• 申請號: 201210382888.0
• 申請日: 2012-10-10
• 公開（公告）號: CN102925434A
• 公開（公告）日: 2013-02-13
• 發明（設計）人: 蔡潤;楊緒勤;何歡樂;潘俊松;任國良
• 申請（專利權）人: 上海交通大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12N15/29
• 代理公司: 上海科盛知識產權代理有限公司 31225
• 代理人: 楊元焱

技術領域

本發明涉及基因工程技術領域的分子標記，特別涉及兩個與黃瓜果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記。?

背景技術

黃瓜(Cucumis?sativus?L.)是葫蘆科(Cucurbitaceae)甜瓜屬(Cucumis)一年蔓生的草本植物，黃瓜作為世界十大重要的蔬菜作物之一，也是我國主栽蔬菜作物之一。?

果實是黃瓜經濟性狀最重要的部分，黃瓜果實屬于瓠果，由子房和花托共同發育而成。在黃瓜果實上有一個重要的性狀是果瘤，果瘤是黃瓜果實表面的瘤狀突起。果瘤基因的研究始于1913年，有果瘤是黃瓜的野生性狀，果瘤性狀是由Tu(Tuberculate?fruit)基因調控，有果瘤(Tu)為顯性，無果瘤(Tu)為隱性。在經典遺傳圖譜上，果瘤基因(Tu，Tuberculate?fruit)和無光澤果皮基因(D)及一致果皮顏色基因(u，uniform?immature?fruit?color)緊密連鎖在一起。曹辰興通過分離群體的遺傳分析結果表明控制莖、葉、果實表皮毛性狀的無毛基因對控制果瘤性狀的果瘤基因存在隱性上位作用(曹辰興等.黃瓜莖葉無毛性狀與果實瘤刺性狀的遺傳關系.園藝學報，2001，28(6)：565-566)。因此，果瘤基因Tu的研究將有助于揭示黃瓜果刺基因形成的分子機制，為黃瓜遺傳和育種工作奠定基礎。?

2009年張微微等得出黃瓜果瘤性狀屬于單基因顯性性狀，利用247個F₂群體將果瘤基因初步定位于第五染色體SSR標記16203和SCAR標記C_SC933之間，遺傳距離分別為1.3cM和5.9cM，詳細結果可以參看：Zhang?W?W等在《Theoretical?and?Applied?Genetics》(理論應用遺傳學)2009年第120卷第3期645-654頁發表的題為《Identification?and?mapping?of?molecular?markers?linked?to?the?tuberculate?fruit?gene?in?the?cucumber(Cucumis?sativus?L.)》(黃瓜果瘤基因緊密連鎖分子標記初步定位)一文，上述標記還存在分析群體相對較小，連鎖距離相對較遠等問題，候選區?間存在100多個候選基因，也沒有對候選基因分析。?

隨著人們生活水平的提高，品質育種已提到重要位置。黃瓜果實刺瘤性狀屬于感觀品質范疇。歐美溫室類型的黃瓜為無果瘤、少刺的果皮，稱其為水果黃瓜，其市場價格為普通黃瓜的2-3倍。外觀光滑黃瓜污染少，清洗方便，食用衛生，是無公害蔬菜的理想品種。經檢測表明：無瘤少刺黃瓜果肉農藥殘留量比有刺黃瓜低27％，果皮農藥殘留量低18％。黃瓜果瘤基因Tu控制果瘤的形成，它的研究將會推動品質育種進程。用與目的性狀緊密連鎖的分子標記進行標記輔助選擇在黃瓜遺傳育種中是十分有效的方法，分子標記是在DNA水平上對目標性狀進行選擇，具有高效、快速、不受環境條件限制等優點，可在苗期進行選擇，加快育種的進程。?

發明內容

本發明的目的，在于克服現有技術的不足，提供兩個與黃瓜果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記。?

本發明是通過以下技術方案實現的：?

本發明涉及的第一個與黃瓜果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記，命名為DT-1，由序列表中SEQ?ID?NO.1所示的236個核苷酸組成，無果瘤基因不含有這236個核苷酸。世界各地有瘤黃瓜品種均含有該顯性分子標記，無瘤黃瓜品種(除了突變體無毛無瘤品種gl)不含有該顯性分子標記，該顯性分子標記可以簡便、快速、高通量地應用于世界各地黃瓜有瘤/無瘤類型(除了突變體無毛無瘤品種gl)的篩選。?

上述與果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記，由SEQ?ID?NO.3所示的上游引物和SEQ?ID?NO.4所示的下游引物擴增得到。引物由上海生工合成。?

本發明涉及的第二個與黃瓜果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記，命名為DT-2，由序列表中SEQ?ID?NO.2所示的468個核苷酸組成，無果瘤基因不含有這468個核苷酸。世界各地有瘤黃瓜品種均含有該顯性分子標記，無瘤黃瓜品種(除了突變體無毛無瘤品種gl)不含有該顯性分子標記，該顯性分子標記可以簡便、快速、高通量地應用于世界各地黃瓜有瘤/無瘤類型(除了突變體無毛無瘤品種gl)的篩選。?

上述與果瘤基因Tu共分離的顯性分子標記，由SEQ?ID?NO.5所示的上游引物和SEQ?ID?NO.6所示的下游引物擴增得到。引物由上海生工合成。?