[發明專利]空間銅綠假單胞菌LCT-PA41菌株

無效

• 申請號: 201210379844.2
• 申請日: 2012-09-26
• 公開（公告）號: CN103087942A
• 公開（公告）日: 2013-05-08
• 發明（設計）人: 劉長庭;方向群;王立;李天志;王俊峰;郭英華;常德;蘇龍翔;陳振鴻;姜學革
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍總醫院
• 主分類號: C12N1/20
• 分類號: C12N1/20;C12R1/385
• 代理公司: 暫無信息
• 代理人: 暫無信息

技術領域

本發明所涉及生物技術領域。具體地說，涉及一種空間環境下的新菌株--銅綠假單胞菌，生物學特性、全基因組學測序、轉錄組測序和差異蛋白組學分析。?

背景技術

銅綠假單胞菌是臨床上常見的條件致病菌，長期應用激素、免疫抑制劑，進行腫瘤化療、放射治療等導致病人免疫功能低下，以及手術后或侵入性治療操作后的病人易導致本菌感染，被認為是醫院內感染的重要病原菌之一。其具備生存條件要求低，定植廣泛，耐藥水平高等特點，是臨床微生物學研究熱點菌種。?

隨著我國“神舟”系列飛船、“天宮一號”、空間站等龐大的航天計劃的實施，載人航天的醫學保障需求日益突出，對空間生物醫學的研究提出了更高的要求，同時也為空間生物醫學研究提供了難得的實驗平臺。我們此次搭載“神舟八號”飛船，共搭載包括銅綠假單胞菌在內的64株細菌。該飛船在軌運行16天13小時(397小時)的時間，行程1100萬公里。?

在國外針對空間領域銅綠假單胞菌的研究中，Guadarrama等發現模擬微重力環境下，微重力處理組銅綠假單胞菌PAl03菌株生長周期與對照組相比沒有顯著變化，外毒素產量無明顯差異，但作者同時也指出，結果可能與培養基條件，微重力生物效應回轉器回旋速度及回旋時間有關。而2008及2010年Crabbè等發表的研究結果表明，在模擬微重力條件下，銅綠假單胞菌藻酸鹽、彈性蛋白酶、鼠李糖脂產生增加，但綠膿菌素的產量無明顯差異。在真實太空環境下，銅綠假單胞菌缺乏類似報道。?

發明內容

本發明的目的在于：提供一種新的空間環境下的銅綠假單胞菌?LCT-PA41菌株，其保藏號為CGMCC?NO.6522。上述提供菌株的各項生物學特性、差異表達基因和差異蛋白也是本發明的保護范圍，其特征包括：?

1)菌株生物學特性?

革蘭氏染色陰性，單個排列的無芽胞桿菌；相對于對照菌株，可見LCT-PA41菌株對氯霉素、頭孢三嗪耐藥性提高，而對阿奇霉素、美滿霉素、美羅培南敏感性提高。不代謝糊精、右旋麥芽糖、右旋聚纖維二糖、β(1→6)葡二糖、松二糖、乳糖、車前二糖、3甲基-葡萄糖、左旋鹽藻糖、N-乙酰-β-右旋葡糖胺酶、右旋甘露醇、阿(拉伯)糖醇、半乳糖、右旋6-磷酸葡萄糖、右旋絲氨酸，而代謝產物減少的包括α右旋葡萄糖、右旋甘露糖、右旋果糖、右旋鹽藻糖、左旋鹽藻糖、右旋半乳糖、甘油、6-磷酸果糖。?

2)生物信息學特性?

a).差異基因表達?

與對照菌株比較，差異表達基因(FDR≤0.001和|log2Ratio|≥2)，見附件1。?

b).蛋白組學?

同重同位素相對與絕對定量(Isobaric?tags?for?relative?and?absolute?quantitation，iTRAQ)法進行樣本蛋白定量分析。當蛋白質定量值的蛋白豐度差異倍數超過1.2倍以上，且經檢驗其p-value值小于0.05，視為單次重復間的差異蛋白，重復出現兩次以上者被視為最終差異蛋白，符合條件差異蛋白見附件2。三次重復鑒定中達到要求差異蛋白如表1所示。?

表1三次重復鑒定的差異蛋白?

附圖說明

圖1LCT-PA41革蘭氏染色?

圖2生化譜實驗板圖2a?LCT-PA41菌株，圖2b地面對照菌株?

圖3LCT-PA41的差異表達基因?

圖4LCT-PA41的差異蛋白?

附件說明?

附件1空間銅綠假單胞菌LCT-PA41差異基因表達?

附件2空間銅綠假單胞菌LCT-PA41差異蛋白?

具體實施方式

下述實施實例中所用的實驗方法，如無特殊說明，均為常規方法。?

下述實施實例中所用的材料、試劑，如無特殊說明，均可從商業途徑獲得。?

實施實例一：空間菌株搭載?