[發(fā)明專(zhuān)利]應(yīng)用基于小麥EST序列的黑麥染色體特異分子標(biāo)記對(duì)黑麥5R染色體進(jìn)行鑒定的方法無(wú)效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 201210366548.9 | 申請(qǐng)日: | 2011-04-14 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN103045724A | 公開(kāi)(公告)日: | 2013-04-17 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 許紅星;尹冬冬;安調(diào)過(guò);李立會(huì) | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人: | 中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所 |
| 主分類(lèi)號(hào): | C12Q1/68 | 分類(lèi)號(hào): | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 石家莊匯科專(zhuān)利商標(biāo)事務(wù)所 13115 | 代理人: | 王琪;周大偉 |
| 地址: | 050021 *** | 國(guó)省代碼: | 河北;13 |
| 權(quán)利要求書(shū): | 查看更多 | 說(shuō)明書(shū): | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 應(yīng)用 基于 小麥 est 序列 黑麥 染色體 特異 分子 標(biāo)記 進(jìn)行 鑒定 方法 | ||
1.應(yīng)用基于小麥EST序列的黑麥染色體特異分子標(biāo)記對(duì)黑麥5R染色體進(jìn)行鑒定的方法,其特征步驟包括:
A、分子標(biāo)記的選定和制備:合成標(biāo)記引物“11-MAG1242”,其正向引物序列見(jiàn)SEQ?ID?NO:21,其反向引物序列見(jiàn)SEQ?ID?NO:22;
B、標(biāo)記引物的稀釋?zhuān)簩⑸喜胶铣傻臉?biāo)記引物,先用1×TE緩沖液溶解成100mmol?L-1的母液放入-20℃的冰箱中保存,使用前吸取母液用超純水稀釋成10mmol?L-1的工作液待用;其中1×TE緩沖液的配方為,10mmol?L-1?Tris-HCl與1mmol?L-1?EDTA,pH=8.0;
C、黑麥染色體的特異標(biāo)記:
C-1、模板DNA的提取:取待測(cè)物——小麥與黑麥的遠(yuǎn)緣雜交后代材料,對(duì)照物0——不包含待測(cè)黑麥染色體的樣品,對(duì)照物1——包含待測(cè)黑麥染色體的樣品,然后利用常規(guī)DNA提取方法分別提取三者的DNA;
C-2、PCR擴(kuò)增:以C-1所得DNA樣品為模板,利用步驟B所得工作液在PCR擴(kuò)增儀中分別對(duì)待測(cè)物、對(duì)照物0及對(duì)照物1進(jìn)行擴(kuò)增;
C-3、擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè):非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè)步驟C-2所得的擴(kuò)增產(chǎn)物,用銀染法進(jìn)行染色,并在凝膠成像儀上照相;
C-4、結(jié)果比對(duì):將待測(cè)遠(yuǎn)緣雜交后代材料的電泳圖譜分別與對(duì)照物0、對(duì)照物1的電泳圖譜進(jìn)行比對(duì),如果待測(cè)遠(yuǎn)緣雜交后代材料和對(duì)照物1的電泳圖譜均有特異擴(kuò)增片段,說(shuō)明遠(yuǎn)緣雜交后代材料中有待測(cè)黑麥染色體;如果待測(cè)遠(yuǎn)緣雜交后代材料的電泳圖譜與對(duì)照物0的電泳圖譜一致,均不含有特異擴(kuò)增片段,說(shuō)明遠(yuǎn)緣雜交后代材料中不含有待測(cè)黑麥染色體。
2.根據(jù)權(quán)力要求1所述的對(duì)黑麥染色體進(jìn)行鑒定的方法,其特征在于:步驟C-2中對(duì)所述待測(cè)物、對(duì)照物0及對(duì)照物1的DNA模板進(jìn)行擴(kuò)增的具體操作為,在體積為0.2ml的Eppendof管中依次加入30ng的模板DNA,1×PCR?buffer,1.5mmol?L-1?MgCl2,200mmol?L-1?dNTP,正、反向引物各0.2mmol?L-1,0.5U?Taq?DNA聚合酶,最后用無(wú)菌超純水補(bǔ)充反應(yīng)體系至10ml,然后將Eppendof管放在GeneAmp9700基因擴(kuò)增儀上進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。
3.根據(jù)權(quán)力要求2所述的對(duì)黑麥染色體進(jìn)行鑒定的方法,其特征在于:所述擴(kuò)增反應(yīng)的具體程序?yàn)椋?4℃預(yù)變性5min;然后94℃變性1min,55℃退火1min,72℃延伸1min,循環(huán)38次;最后72℃延伸10min,10℃保存。
4.根據(jù)權(quán)力要求1所述的對(duì)黑麥染色體進(jìn)行鑒定的方法,其特征在于:步驟C-3中所述擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測(cè)方法具體為,在步驟C-2所得的擴(kuò)增產(chǎn)物中加入上樣緩沖液2μl,混勻之后取3μl用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測(cè),電泳電壓為150~180V,電泳1~2h。
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