[發明專利]焦磷酸測序法檢測ALDH2基因多態性的試劑盒及方法無效
| 申請號: | 201210337985.8 | 申請日: | 2012-09-13 |
| 公開(公告)號: | CN102876782A | 公開(公告)日: | 2013-01-16 |
| 發明(設計)人: | 周宏灝 | 申請(專利權)人: | 周宏灝 |
| 主分類號: | C12Q1/68 | 分類號: | C12Q1/68 |
| 代理公司: | 長沙正奇專利事務所有限責任公司 43113 | 代理人: | 盧宏 |
| 地址: | 410078 湖南省長沙市開*** | 國省代碼: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 磷酸 測序法 檢測 aldh2 基因 多態性 試劑盒 方法 | ||
技術領域
本發明屬于分子生物學領域,具體的是涉及焦磷酸測序法檢測ALDH2基因多態性的試劑盒及方法。
背景技術
酒精耐受(Alcohol?Tolerance)主要指身體對酒精性飲料或食物中乙醇的敏感性下降,包括直接耐受性和誘導耐受性。直接酒精耐受性與個人體型大小有關,誘導耐受指長期飲酒導致的酒精耐受性增高。研究表明環境因素和遺傳因素共同影響酒量的個體差異,酒精依賴和酒精過敏很大程度由傳因素決定,如乙醛脫氫酶2(ALDH2)是乙醇氧化代謝的主要代謝酶,酒精耐受性與ALDH2的酶活性有關,其多態性也是引起酒精耐受個體差異的主要原因(Circ?J.2011.75(4):911-8)。
ALDH2基因在rs671位點突變后,使504位谷氨酸被賴氨酸替換,突變雜合子(AG)使該酶活性降低,純合突變(AA)該酶活性消失。該突變使酒精耐受性平均降低84%。
ALDH2基因rs671位點突變與酒精耐受性風險關系(Hypertens?Res.2009.32(3):207-13)
飲酒是全球普遍流行的的生活方式,但研究表明長期過度飲酒是動脈粥樣硬化發病的一個危險因素,如高血壓,肥胖,血脂異常以及糖尿病等都與飲酒有關。同時,流行病學研究顯示適度的喝酒可通過各種機制降低心血管疾病,如適度飲用溫和的酒有利于糖代謝及影響高密度脂蛋白的水平,則會導致高血壓及高血脂癥,因此通過對ALDH2基因的突變檢測,讓你了解自己是否能喝酒,酒量如何,耐受程度怎樣,幫助你子啊生活中正確控制飲酒量,減少過度飲酒帶來身體上的傷害。
同時研究也發現,ALDH2基因多態性與硝酸甘油的用藥有關。ALDH2酶是硝酸甘油有效代謝物NO形成的關鍵。當ALDH2基因在rs671位點突變后,酶活性降低,硝酸甘油在體內生物轉化過程受阻,有效活性產物NO生成減少,進而導致硝酸甘油治療心絞痛效果降低。值得注意的是,在亞洲人群中,30%-50%的人都攜有rs671位點突變,遠遠高于歐美人群。國內研究還發現,中國漢族人群中,含服硝酸甘油無效的比例高達25%以上,基因多態性起到了非常重要的作用。因此,對ALDH2基因多態性檢測,有助于臨床上對硝酸甘油的合理使用。
綜上,開發快速、高效、準確、便捷、經濟的檢測ALDH2基因多態性檢測試劑盒對酒精耐受評估及硝酸甘油的合理使用,具有重要的臨床意義。
焦磷酸測序(Pyro?sequencing)技術是新一代DNA序列分析技術,該技術無須進行電泳,DNA片段也無須熒光標記,是一種通用型技術平臺。該技術具有操作簡便、檢測成本低、所需樣品量小、快捷、準確、高通量等特點,符合臨床大樣本檢測要求。
發明內容
本發明旨在提供一種焦磷酸測序法檢測ALDH2基因(SEQ?ID?NO.1)多態性的試劑盒及方法,以實現快速、簡便、準確、高效、實用、經濟的檢測ALDH2SNP。
為了達到上述目的,本發明提供的技術方案為:
一種焦磷酸測序法檢測ALDH2基因多態性的試劑盒,包括如下引物:
(1)擴增引物:
上游引物:5′-GATGTGTTTGGAGCCCAGTC-3′(SEQ?ID?NO.2);
下游引物:5′-CAGGTCCCACACTCACAGTTTTC-3′(SEQ?ID?NO.3);
其中,下游引物的5′進行生物素標記;
(2)測序引物:5′-GCTGCAGGCATACAC-3′(SEQ?ID?NO.4);
試劑盒中其他試劑及溶液為PCR和DNA焦磷酸測序的常規試劑。
一種應用上述試劑盒檢測ALDH2基因多態性的方法,包括如下步驟:
(1)DNA提取;
(2)聚合酶鏈反應:
配制50μl?PCR擴增體系,包含:10×PCR?buffer?5.0μl,dNTP?1.5μl,ALDH2上游引物0.5μl,ALDH2下游引物0.5μl,rTaq0.5μl,水41.0μl,模板1.0μl;循環程序為:95°C?5min預變性;依次在95°C?30S,50°C?30S,72°C?30S,進行35個循環;72°C保持5min,最終保持在4°C,得擴增產物;
(3)焦磷酸測序單鏈樣本純化;
(4)焦磷酸測序及結果分析。
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